database | example |
UniProt ID | CDK3_HUMAN [link] |
UniProt AC | Q00526 [link] |
INSDC protein_id | AAV40830.1 [link] |
RefSeq protein_id | NP_001249.1 [link] |
入力にあたっての注意事項
一つのクエリタンパク質から、ホモ多量体の立体構造をモデリングするサービスです。サーバは、1本のクエリ配列について、PDBの全タンパク質(unitmol)に対して、配列相同性検索(blastp; Altschul et al., 1997)を実行し、相同なタンパク質のリストを作成します。次に、サブユニットがクエリと相同な多量体の立体構造があるかどうかチェックします。もし、こうした相同な多量体が見つかれば、複合体モデリングの鋳型として使うことができます。
database | example |
UniProt ID | CDK3_HUMAN [link] |
UniProt AC | Q00526 [link] |
INSDC protein_id | AAV40830.1 [link] |
RefSeq protein_id | NP_001249.1 [link] |
入力にあたっての注意事項
以下にP5CR3_HUMANをクエリとして指定した場合の、homo modeling サービスの検索結果を示します。
左端にある3Dのアイコン の一つをクリックすると, 以下のような3Dモデルウィンドウが表示されます。