HOMCOS:ホモ多量体のモデリング

アミノ酸配列を一つ入力し、相同なタンパク質立体構造を鋳型として、ホモ多量体の立体構造のモデリングを行います。

アミノ酸配列は、タンパク質配列データベースのID、１文字表記のアミノ酸配列、[PDB_ID]+[CHAIN_ID]、PDBファイルのアップロードのどれかの方法で入力してください。

タンパク質配列のID
(UniProt:ID/AC, INSDC/RefSeq:protein_id) (P5CR3_HUMAN, Q53H96, NP_075566)

アミノ酸配列

PDB PDB_ID:(1fin, 4hhb,...) CHAIN_ID(auth_asym_id):(A, B, ...)

PDBファイルのアップロード

E-value:
min Nresidue_contact_aligned (minNca)
min Ratio of residue_contact_aligned (minRca) (%)
事前に計算されたBLASTの結果の使用: (precalc_blt) no yes

アミノ酸配列の相同性検索にはBLASTを用いています。
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タンパク質配列のID (UniProt:ID/AC, INSDC/RefSeq:protein_id)	(P5CR3_HUMAN, Q53H96, NP_075566)
アミノ酸配列
PDB	PDB_ID:(1fin, 4hhb,...) CHAIN_ID(auth_asym_id):(A, B, ...)
PDBファイルのアップロード