CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(ACE2_HUMAN) | C 1 (C) | polymer(polypeptide(L)) [598 aa] | Angiotensin-converting enzyme 2 :ACE2_HUMAN | |
2 | b | D 1 (D) | polymer(polypeptide(L)) [195 aa] | Spike protein S1 :SPIKE_SARS2 | 19S 24Q 27T 28F 30D 31K(N) 34H 35E(K) 37E 38D 41Y 42Q 79L(F) 82M 83Y 353K 354G 355D 357R 393R (identity: 85.0 %/98.8 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:7dmu_C_1 identity=98.8% |
queryA 18:QSTIEEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLN: 117 :******* **** *** **************************** ************** ********** ***************************: 7dmu_C_1 1:QSTIEEQVETFLDNFNHKAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNIAGDKWSAFLKEQSTFAQMYPLQEIQHLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLN: 100 SecStr : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG SHHHHHHHHHHH GGGGS HHHHHHHH: ExpBur :eeeebeebeebbeebbeebeebebebbebbbebbbebeeebbeeebebeeebeebeeebbeebeeeebeebeeeebeebbeebeeebeeebeeeeeeebe: Contact : b b bb bb bb bb bb b bb queryA 118:TILNTMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDY: 217 :****************************************************************************************************: 7dmu_C_1 101:TILNTMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDY: 200 SecStr :HHHHHHHHHHHH EEE SS TT EEETTTHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSHHHHHHTTT B S TTT B: ExpBur :ebebebbebbbebebeeeeeeeeeeebeeebbebbeebeebeebbebbbbbbeebbeebbebbeebbebbbebbeebebebbbbebbbebebeeeeeeeb: queryA 218:SRGQLIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVS: 317 :****************************************************************************************************: 7dmu_C_1 201:SRGQLIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVS: 300 SecStr : TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTS TTS EEGGGGSSSSSS GGGGHHHH S TTS S THHHHHHTT HHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :eeeebbebbeebbeebeebbebbbbbbbeebeeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbebbeebbbeeeeeebebbeebeeeebebeebbebbbebbee: queryA 318:VGLPNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKH: 417 :****************************************************************************************************: 7dmu_C_1 301:VGLPNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKH: 400 SecStr :TT HHHHHH B S SSS S EEEEEETTEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHTSHHH: ExpBur :bebeebeeebeeebbbeeeeeeeebbbeebebebbeebbbbbbbbeeebebbbebbbbbbbbbbbbbbeebebebbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeb: Contact : bbb b b queryA 418:LKSIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYT: 517 :****************************************************************************************************: 7dmu_C_1 401:LKSIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYT: 500 SecStr :HHHTTSS TT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT S GGGHHHHHHHHHHHTT EE SS TT GGGGSHHHHHT SHHHHH: ExpBur :beebebbeeebeeeeebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbbbbbbbebbbebbb: queryA 518:RTLYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSPYAD: 615 :**************************************************************************************************: 7dmu_C_1 501:RTLYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSPYAD: 598 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHTT S GGG TT HHHHHHHHHHHTTTTSS HHHHHHHHHS SS SHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGS S SS SS : ExpBur :bbbbbbbbbebbbeeeeeeeebbebbbbebeebbeebeebbebbebeebbebbeebeeeeebebebbeebbeebeebbeeebeeeeebeeeeebeeee: |