[pdbjlvh2]Protein Model on 2oc2_A

Protein Model on 2oc2_A_1 (TEMPLATE: 2oc2 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

[sequence-replaced 3D model] [for PyMOL]

[3D template]

[Modeller script]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description
1	a	A(ACE2_HUMAN)	A 1 (A)	polymer(polypeptide(L)) [583 aa]	Angiotensin-converting enzyme, somatic isoform :ACE_HUMAN

ALIGNMENTS

MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:2oc2_A_1 identity=43.3%

queryA        22:EEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILN: 121
                :*  *  *                 * ******** *                    * *        ** * *      *      *        * ** :
2oc2_A_1       5:EAEASKFVEEYDRTSQVVWNEYAEANWNYNTNITTETSKILLQKNMQIANHTLKYGTQARKFDVNQLQNTTIKRIIKKVQDLERAALPAQELEEYNKILL: 104
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG   HHHHHHHHHHH  GGGGS HHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeebeebbeebeeebeebbeeebbbbbebbbebeeebbeebeeebeebbebeeebbeebeebebeebeeeebebbbeebebbeebbbeeeebeebbebbb:    

queryA       122:TMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQ: 221
                : * * **   ** *     ** *** *   ** *  *   ***** **   *      *  ** * *  ** * * * ** **  **             :
2oc2_A_1     105:DMETTYSVATVCHPNG--SCLQLEPDLTNVMATSRKYEDLLWAWEGWRDKAGRAILQFYPKYVELINQAARLNGYVDAGDSWRSMYETPSLE--------: 194
SecStr          :HHHHHHHH  EE TTS-- EE TTTHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHTTT SSHHHHHHGGG  TTHH--------:    
ExpBur          :ebeebbbebebeeeee--eebebeeebeeebbebbebeebbebbbbbbeebbeebeebbeebbebbbbbbeebeeebbbebbbeebebeebe--------:    

queryA       222:LIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPS-YISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGL: 320
                :   * *  * *  ***  ******  *   *    *   *  ****** **   * * * * ***   *  * * **  * *   * ****  ** * **:
2oc2_A_1     195:--QDLERLFQELQPLYLNLHAYVRRALHRHYGAQHINLEGPIPAHLLGNMWAQTWSNIYDLVVPFPSAPSMDTTEAMLKQGWTPRRMFKEADDFFTSLGL: 292
SecStr          :--HHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTT  TTS EETTSSSSTTSS  GGGHHHH S TTS    HHHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHHHTT :    
ExpBur          :--eebeebbeebbebbbbbbbbbbebbeeebeeeebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbebbebbebeeebeeeebeebbeeeebebeebbeebbebbebbeb:    

queryA       321:PNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKG-DFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLK: 419
                :      **  ***  *      ***  ***   * ****  ** *   *   ********** * *   *  ** *** ***** *    **  ***** :
2oc2_A_1     293:LPVPPEFWNKSMLEKPTDGREVVCHASAWDFYNGKDFRIKQCTTVNLEDLVVAHHEMGHIQYFMQYKDLPVALREGANPGFHEAIGDVLALSVSTPKHLH: 392
SecStr          :    HHHHHH B S   SS     S EEEE SSSS EEEE    SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHH:    
ExpBur          :eebeeebbeebbbeebeeeeebbbebebbbbeebebbbbbbbbebbbebbbebbbbbbbbbbbbbbeeeebbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbe:    

queryA       420:SIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRT: 519
                :*  ***     * *  **** * **      ** *    *** ** * * *      **       *   ***      **   **       ***    :
2oc2_A_1     393:SLNLLSSXGGSD-EHDINFLMKMALDKIAFIPFSYLVDQWRWRVFDGSITKENYNQEWWSLRLKYQGLCPPVPRTQGDFDPGAKFHIPSSVPYIRYFVSF: 491
SecStr          :HTTS   -  SH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSS TTTHHHHHHHHHHHHH EE SS   TT  GGGGSTTTTTT  SHHHHHHH:    
ExpBur          :ebebbee-eeee-eebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbb:    

queryA       520:LYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNK--NSFVGWST-DWSP: 612
                :  **** ******* * ********  * **** *     ** * **  *     *  **     * ** **  **   *       **    * *:
2oc2_A_1     492:IIQFQFHEALCQAAGHTGPLHKCDIYQSKEAGQRLATAMKLGFSRPWPEAMQLITGQPNMSASAMLSYFKPLLDWLRTENELHGEKLGWPQYNWTP: 587
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHTT  S GGG   TT HHHHHHHHHHHHHTTSS HHHHHHHHHSS S  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  SS SSTT   :    
ExpBur          :bbbbbbbebbbebeeeeeebbebebeebeebbeebbebbeebbbeebeebbeebbeeeebebebbeebbeebbebbeebbeeeebeebbeeeeeee:

Protein Model on 2oc2_A_1 (TEMPLATE: 2oc2 )

Input Residue Numbers for Focused Sites