CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(IMA1_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [469 aa] | C. glabrata importin alpha ARM domain - Upc2 NLS fusion :Q6FNI4_CANGA:Q6FX18_CANGA | |
2 | b | A 2 (A) | polymer(polypeptide(L)) [469 aa] | C. glabrata importin alpha ARM domain - Upc2 NLS fusion :Q6FNI4_CANGA:Q6FX18_CANGA | 458E(R) 459K(G) 460L 461S(A) 462I 478N(Q) 498V(E) (identity: 28.6 %/48.0 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:7vpt_A_1 identity=48.0% |
queryA 72:GTVNWSVDDIVKGINSSNVENQLQATQAARKLLSREKQPPIDNIIRAGLIPKFVSFLGRTDCSPIQFESAWALTNIASGTSEQTKAVVDGGAIPAFISLL: 171 :* * **** ** ** * **** **** * * * * * * * ************ ** *** ** * ** **: 7vpt_A_1 15:GQLQQELPQMVQQINSSDMQEQLAATVKFRQILSREHNPPIDIVIQSGVVPTLVNFMNENQPEMLQLEAAWALTNIASGTSAQTQVVVDAGAVPLFIQLL: 114 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHT SSHHHHHHHHHHHHHHHT SS HHHHHHTT HHHHHHTTSTTS HHHHHHHHHHHHHHTTS HHHHHHHHTTTHHHHHHHHH: ExpBur :eebeeebeebeeebeeeeeeebeebbeebbebbeeeeeebbeebbeeebbebbbebbeeebeeebbebbbebbbbbbeeeeebbeebbeeebbebbbebb: queryA 172:ASPHAHISEQAVWALGNIAGDGSVFRDLVIKYGAVDPLLALLAVPDMSSLACGYLRNLTWTLSNLCRNKNPAPPIDAVEQILPTLVRLLHHDDPEVLADT: 271 : *** ***** *** ** * * * * * * * ********* * * * * **** * * * * * : 7vpt_A_1 115:YTGSVELQEQAIWALGNVAGDSTSYRDYVLQCSAMEPILSLF-----NSEKVTLIRTATWTLSNLCRGKKPQPDWSIVSKALPTLAKLIYSFDNETLIDA: 209 SecStr :HHS HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHTT HHHHHGGG-----G HHHHHHHHHHHHHHH TT HHHHGGGHHHHHHHTT S HHHHHHH: ExpBur :eebeeebbbbbbebbbbbbeeeeebbeebbeeebbebbbebb-----eeeeeebbebbbebbbbbbeeeeeebeeebbeebbebbbebbeeeeeebbbbb: queryA 272:CWAISYLTDGPNERIGMVVKTGVVPQLVKLLGASELPIVTPALRAIGNIVTGTDEQTQVVIDAGALAVFPSLLTNPKTNIQKEATWTMSNITAGRQDQIQ: 371 :******* *** * * * ** ** ****** ****** * ***** * * ** ** * *** ** ****** ***: 7vpt_A_1 210:CWAISYLSDGPAEAIQAVIDARIPKRLVELLSHQSTLVQTPALRAVGNIVTGNDLHTQVVINCGVLSALRNLLSSPKESIRKEACWTISNITAGNTEQIQ: 309 SecStr :HHHHHHHTSS HHHHHHHHHTT HHHHHHHTT S HHHHHHHHHHHHHHTTS HHHHHHHHHTTHHHHHHHHTT SSHHHHHHHHHHHHHHHTS HHHHH: ExpBur :bebbbebbeeeeebbeebbeeebbeebbebbeeeeeebbebbbebbbbbbeeeeebbeebbeeebbebbeebbebeeeebeeebbebbbebbeeeeebbe: queryA 372:QVVNHGLVPFLVSVLSKADFKTQKEAVWAVTNYTSGGTV--EQIVYLVHCGIIEPLMNLLTAKDTKIILVILDAISNIFQAAEKLGETEKLSI-----MI: 464 : ** * * * * * * *** ** * *** * * * * * * ** ** * ** * *** ** * * * * *: 7vpt_A_1 310:AVVDANLIPPLIKLLETAEYKIKKEACWAISNASSGGLQRPEIIRYMVSQGCIKPLCDLLEIADNRIIEVTLDALENILKMGETDKEARGLAINENADLI: 409 SecStr :HHHHTT HHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHHHGGGSHHHHHHHHHTT HHHHHHHTTTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT SS HHHHHH: ExpBur :bbbebebbeebbebbeebeeebbbbbbebbbbbbeebeeeeebbeebbeeebbebbbebbeebeeebbebbbebbebbbebbbebeeeeeeeebebbeeb: Contact : bbbbb queryA 465:EECGGLDKIEALQNHENESVYKASLSLIEKYFSVE: 499 :* ** ** * ** * ** ** *: 7vpt_A_1 410:EKAGGMEKIFNCQQNENDRIYEKAYKIIETYFGEE: 444 SecStr :HHTTHHHHHHHGGG SSHHHHHHHHHHHHHH GGG: ExpBur :eeeebbebbbebbebeeeebeebbeebbeebbeeb: Contact : b b |