CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(ACE2_HUMAN) | D 1 (D) | polymer(polypeptide(L)) [593 aa] | Angiotensin-converting enzyme 2 :ACE2_MOUSE | |
2 | b | W 1 (W) | branched(oligosaccharide) | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose | 53N 55T 57E 58N 340Q(R) (identity: 80.0 %/84.4 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:8vkm_D_1 identity=84.4% |
queryA 22:EEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILN: 121 :** ***** ** ***** ****************** * * * ***** *** ** ***** * ******* *** ** ** * ******: 8vkm_D_1 22:EENAKTFLNNFNQEAEDLSYQSSLASWNYNTNITEENAQKMSEAAAKWSAFYEEQSKTAQSFSLQEIQTPIIKRQLQALQQSGSSALSADKNKQLNTILN: 121 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG HHHHHHHHHHT GGGGS HHHHHHHHHHHH: ExpBur :beebeebbeebbeebbeebeebbebbbeebbeebeebeeeeeebeeeeeebeeebbeebeebebeebeeeebebbbeebbebbeeebeeeeeeebeebbe: Contact : b b bb queryA 122:TMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQ: 221 :************** ************ **** * *** ****** ** ************************ * *********** * *** * * *: 8vkm_D_1 122:TMSTIYSTGKVCNPKNPQECLLLEPGLDEIMATSTDYNSRLWAWEGWRAEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANNYNDYGDYWRGDYEAEGADGYNYNRNQ: 221 SecStr :HHHHHHHT EEE TT TT EEETTTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSHHHHHHGGG B STT B HHH: ExpBur :ebeeebeebebbeeeeeeeeeebeeebeebbeeeeebeebeebbbbbbbebbeebbeebeebbebbbebbeebebebbbbebbbebebeeeeeeebebee: queryA 222:LIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGLP: 321 :****** ** ************** *** ******* ******************** ***** *********** * *** *** ************: 8vkm_D_1 222:LIEDVERTFAEIKPLYEHLHAYVRRKLMDTYPSYISPTGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYPLTVPFAQKPNIDVTDAMMNQGWDAERIFQEAEKFFVSVGLP: 321 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTTS SSS EEGGGSSSSSSS GGGTTTT S SSS HHHHHHTT HHHHHHHHHHHHHHHT : ExpBur :bbebbeebbeebeebbebbbbbbbeebeeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbebeebbeebbbeeeeeebebeebbeeeebebeebbebbbebbeebebe: queryA 322:NMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKSI: 421 : ****** ***** * * ********** ***** ******** ****************** **********************************: 8vkm_D_1 322:HMTQGFWANSMLTEPADGRKVVCHPTAWDLGHGDFRIKMCTKVTMDNFLTAHHEMGHIQYDMAYARQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKSI: 421 SecStr : HHHHHH B S SS S EEEEEETTEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHT: ExpBur :ebeeebeeebbbeeeeeeeebeeeeeebebbeebbbbbbbbeeebebbbebbbbbbbbbbbbbbeebebbbbebbbbbbeebbbebbbbbbbbbebbeee: Contact : b queryA 422:GLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTLY: 521 :*** ***** ******************************** ***** ******************* **************************** *: 8vkm_D_1 422:GLLPSDFQEDSETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFRGEIPKEQWMKKWWEMKREIVGVVEPLPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTIY: 521 SecStr :TSS TT HHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHT S GGGHHHHHHHHHHHTT EE SS TT SGGGSHHHHTT HHHHHHHHH: ExpBur :ebbeeeeeeeeebbbbbbbebbbebbbbbbbbbbbbebbbbbbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbebbbbeebbbebbbbbbb: queryA 522:QFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSP: 612 :************* * **************** ** ** ***** ******** ** * ****** *** *** ** ****** * ***: 8vkm_D_1 522:QFQFQEALCQAAKYNGSLHKCDISNSTEAGQKLLKMLSLGNSEPWTKALENVVGARNMDVKPLLNYFQPLFDWLKEQNRNSFVGWNTEWSP: 612 SecStr :HHHHHHHHHHHTT S GGG TT HHHHHHHHHHHHHTTSS HHHHHHHHHS SS HHHHHHTHHHHHHHHHHTSSS S SS : ExpBur :bbbbbebbbeebeeeeebbebbbbebeebbeebeebbebbbbebbbebbeebeeeeebebebbeebbeebbebbeeebeeeeebbeeeebe: |