Protein Model on 6y79_LA_1_QB_1 (TEMPLATE: 6y79 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FLA 1 (4) polymer(polypeptide(L)) [485 aa] Subunit NU4M of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase (Complex I) :S5TMP9_YARLL
2 b QB 1 (j) non-polymer(LMN) Lauryl Maltose Neopentyl Glycol 204L 205D 208T 212L 216I 219M 272L 273Y 276M
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:6y79_LA_1
6y79_LA_1      1:XFLTSILLSSLYLFNRILAWQGNVKHFYLFASNLLLLFIVVLYINFNTFSNSFQFNFELFNSLNPFGLSNSDISNGLLFGIDGLSLTFILLTVLLIPLTL: 100
SecStr          :- HHHHHHHHHHHHHHHHHH S  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  TT  S  S EEES SS SSS    SS  SEEE   HHHHHHHHHHHTTHHHHH:    
ExpBur          :-eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebbeebeeebeeeeeebeebeeebeeeeeebeeeebeebeeeeeeebeeeeeebbebbbbbbbbbbbebbbebbbbbb:    

6y79_LA_1    101:LGNWYNINFNSNLYYTLVLAIGLVILLNFWALDYISFYILFEATLPLLFILIHIYGSSDSERASFYVLMFTLSGSLFMLLSIVVISIVLNTTNFINHNLF: 200
SecStr          :HHTTTT  SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTB SHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS   SSSTTT :    
ExpBur          :bbbbeebeeebeebbebbbebbebbbebbbbbbbebbbebbeebbeebeebbeebeeeebeebbeebeeebeebbeebeebbeebeeebeebbbeebeee:    

6y79_LA_1    201:VLSLDLQTIIWLGLFIAIMVKTPLFPIHVWLPVVHSESPLAGSMILAGLILKLALYAILRLLLPLLCEAQILYTPMIYIISLLTIILTSLATLRQIDLKV: 300
SecStr          :   HHHHHHHHHHHHHHHHHHTT GGG  HHHHHHHTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS  BSHH:    
ExpBur          :ebeeeebbebbebbbebbbbbbbbeeebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbeeebeebbebbbebbeebbeebeeeeebbb:    
Contact         :   bb  b   b   b  b                                                    bb  b                        

6y79_LA_1    301:IIAYSSISHMGIAILGVCSNTSLGIYGSIVLGVAHGFVSPALFLIVGGILYDRYHIRIVNYYKGLTTYMPQLATYIIILSFANIGTPLTGNFTGEFLSLQ: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHH   BGGG   TTTT HHHHHHHHHHHHHHHT SSSSHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbebeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebeeebebeebebbeeebeebbebbeebbebbbbeeebbbebbbebbbe:    

6y79_LA_1    401:GGFIRNPIIGGISCISVLLAAIYQLKLTNKLTGGISSIYMHRTNDVTIREKFIMNILIISTLIIGICPQIMYNLLYWTVNNYIYII--------------: 486
SecStr          :HHHHH HHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHSSS  SSS       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGGGHHHHHHHHHHT   -:    
ExpBur          :bbeeeeeeebeebeebeebbbebbeebbeebbeeebbeebeeeeebeebbeebbeebbebbeebbeeeeebeebbeebbeebeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123