CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | C 1 (C) | polymer(polypeptide(L)) [898 aa] | Aminopeptidase :K7GMF9_PIG | |
2 | b | M 1 (M) | branched(oligosaccharide) | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose | 98R(D) 100L 128N (identity: 66.7 %/79.4 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:7vpp_C_1 identity=79.4% |
queryA 65:LDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVV: 164 :***** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** *** ******* ** * ** ***** ******: 7vpp_C_1 4:LDQSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYT-TQGHMVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLVV: 102 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEESS SEEEEE S EE - SSSSSEEEESSS EEEEEEETTTTEEEE: ExpBur :eeeeeebbeeebeebbebebbebebbbebeeeeeeebbbebebebebebeeebebbbbbbeebebe-beeebbebeeeeebeebebeebeebeebbbbbb: Contact : b b b queryA 165:HLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNW: 264 :****** *** *** ******************** ** ****** **************** ******** ******* *** **** *****: 7vpp_C_1 103:HLKGSLQPGHMYEMESEFQGELADDLAGFYRSEYMEGNVKKVLATTQMQSTDARKSFPCFDEPAMKATFNITLIHPNNLTALSNMPPKGSSTPLAEDPNW: 202 SecStr :EESS TT EEEEEEEEEEE SSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B TT BEEEEEEEEETTSEEEESS BSSS EEETTEEEE: ExpBur :bbeeebeeeeebebbbbbebebbeebbbbbbbebebeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbbeeeeeeebeeeeeb: queryA 265:NVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRE: 364 : **** *** ******* ***** * * *********** *** *** ************** ** *********** *******************: 7vpp_C_1 203:SVTEFETTPVMSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGMYALNVTGPILNFFANHYNTPYPLPKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRE: 302 SecStr :EEEEB SB GGG EEEES EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEG: ExpBur :bbbebeebbebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebebbbbbbbebbeeebbebbbebbbebbbbbbebbebebebebbbbbbbbbbeeebbbbbbbbbbbb: queryA 365:NSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINT: 464 :* ***** *** ************************ ********************* ********** * ***************** *** * **: 7vpp_C_1 303:NALLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVMAVDALASSHPLTTPAEEVNT: 402 SecStr :GGT TTT HHHHHHHHHHHHHHHHHTTBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGG GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG S: ExpBur :bbbbbbeeebbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbeebbbbebbbbbbeeeebbe: queryA 465:PAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQ: 563 :****** ** ********* **** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** ** *************** ** **: 7vpp_C_1 403:PAQISEMFDSISYSKGASVIRMLSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIMDRWTLQMGFPVITVDTKTGNISQ: 502 SecStr :HHHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHTTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SSS SS HHHHHHHHHSS S EEEEEETTTTEEEE: ExpBur :eeebebbeebbbebbbbbbbbbbbebbeeebbeebbbebbeebeeeebebeebbebbbebbeeeeeeebeeebebbbbbbbebbbbbbbebebeebebeb: queryA 564:EHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQII: 662 : ***** ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** *: 7vpp_C_1 503:KHFLLDSESNVTRSSAFDYLWIVPISSIKNGVMQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNINVTGYFQVNYDEDNWRMIQHQLQTNLSVIPVINRAQVI: 602 SecStr :EE SSSS S TTTT EEE EEETTEE EEE S SEEE GGG SS EEESGGG SS EEEE HHHHHHHHHHHTT GGGS HHHHHHHH: ExpBur :ebbbbeeebeeeeeeeeebbbbbbbbbbeeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebbebbeeeeeebeebbbbbbb: queryA 663:NDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACS: 762 : * **** ** ******* ***** * **** ********* ************* ** *** *** ** * ** * ********** ********: 7vpp_C_1 603:YDSFNLATAHMVPVTLALDNTLFLNGEKEYMPWQAALSSLSYFSLMFDRSEVYGPMKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLMDQYSEINAISTACS: 702 SecStr :HHHHHHHHTTSS HHHHHGGGGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbbbbbbbeebebebbbebbbbbeebeebbbbebbbebbebbebbbbeeebeeebeebbeebbeebbeebbeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbbe: queryA 763:NGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATST: 862 :** * ** ** *** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** ****************: 7vpp_C_1 703:NGLPQCENLAKTLFDQWMSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATST: 802 SecStr :TT HHHHHHHHHHHHHHHH TTS S GGGHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHTT SSHHHHHHHHHHGGG S HHHHHHHHHHTT TTTS GGGHHHH: ExpBur :bebeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeebbebbbeebeeeebebbbebbbebbbbbeeeebbeebbeebeeeeebeebbbbeb: queryA 863:IISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWF: 962 :* ** ***** * ************ ** ******* ****** * ********** * ******************************* **: 7vpp_C_1 803:INSIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYXXXXXSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNMDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNWF: 902 SecStr :HHHHHHSTTHHHHHHHHHHHSHHHHHTT ----- HHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHTTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbebbebeebbebbbebbeeebeebeeee-----ebeebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeeeebeebeebbebbbbebebbbebbeebeeebbebb: queryA 963:TE: 964 : *: 7vpp_C_1 903:IE: 904 SecStr :HS: ExpBur :ee: |