CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | C 2 (C) | polymer(polypeptide(L)) [899 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_PIG | |
2 | b | IA 2 (C) | non-polymer(NAG) | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose | 649D(N) 651S 652A(V) (identity: 33.3 %/79.6 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5lds_C_2 identity=79.6% |
queryA 66:DQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVH: 165 :**** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** * ******* ** * ** ***** *******: 5lds_C_2 44:DQSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYTXXX-HMVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLVVH: 142 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEESS SEEEEE S EE ---- EEEEESTT EEEEEEETTTTEEEEE: ExpBur :eeeeebeeeebeebbebebbebebebebeeeeeeebbbebebbbebebeeebebbbbbbeebebe----eebebeeeeebeebebeebeebeebbbbbbb: queryA 166:LKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWN: 265 :***** *** *** ******************** ** ****** **************** ******** ******* *** **** ***** : 5lds_C_2 143:LKGSLQPGHMYEMESEFQGELADDLAGFYRSEYMEGNVKKVLATTQMQSTDARKSFPCFDEPAMKATFNITLIHPNNLTALSNMPPKGSSTPLAEDPNWS: 242 SecStr :ESS TT EEEEEEEEEEE SSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B TTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EEETTEEEEE: ExpBur :beeebeeeeebebbbebebebbeebbbbbbbebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeeeeebb: queryA 266:VTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYREN: 365 :**** *** ******* ***** * * *********** *** *** ************** ** * ********* ********************: 5lds_C_2 243:VTEFETTPVMSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGMYALNVTGPILNFFANHYNTSYPLPKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYREN: 342 SecStr :EEEB SB GGG EEEE EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEHH: ExpBur :ebebeebbebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebebebbbbbebbeeebbebbbebbbebbbbbbebbebebebebbbbbbbbbbebebbbbbbbbbbbbb: queryA 366:SLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTP: 465 : ***** *** ************************ ********************* ********** * ***************** *** * ***: 5lds_C_2 343:ALLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVMAVDALASSHPLTTPAEEVNTP: 442 SecStr :HH TTTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTS GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG SH: ExpBur :bbbbeeeebbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbeebbbbebbbbbbeeeebeeb: queryA 466:AQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQE: 564 :***** ** ********* **** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** ** *************** ** ** : 5lds_C_2 443:AQISEMFDSISYSKGASVIRMLSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIMDRWTLQMGFPVITVDTKTGNISQK: 542 SecStr :HHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SSS SS HHHHHHHHHSS EEEEEETTTTEEEEE: ExpBur :eebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbebebbeebbbebbeebeeeebebeebbebbbebbeeeeebeeeeebeebbbbbbebbbbbbbebebeebebebe: queryA 565:HFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQIIN: 663 :***** ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** * : 5lds_C_2 543:HFLLDSESNVTRSSAFDYLWIVPISSIKNGVMQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNVNVTGYFQVNYDEDNWRMIQHQLQTNLSVIPVINRAQVIY: 642 SecStr :E S TT S TTTT EEE EEETTEE EEE SSSEEE GGG TT EEESGGG SS EEEE HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHHHHH: ExpBur :bbebbeeeeeeeebeeebebbbbbbbbeeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebeebbeeebeebeebbbbbbbb: Contact : b bb queryA 664:DAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSN: 763 :* **** ** ******* ***** * **** ********* ************* ** *** *** ** * ** * ********** *********: 5lds_C_2 643:DSFNLATAHMVPVTLALDNTLFLNGEKEYMPWQAALSSLSYFSLMFDRSEVYGPMKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLMDQYSEINAISTACSN: 742 SecStr :HHHHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHHT: ExpBur :bbbebbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbbbbbebbebbebbbbeeebeebbeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbbeb: queryA 764:GVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTI: 863 :* * ** ** *** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** *****************: 5lds_C_2 743:GLPQCENLAKTLFDQWMSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATSTI: 842 SecStr :T HHHHHHHHHHHHHHHHSTTS S HHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHT HHHHHHHHHHHTT S HHHHHHHHHHTT TTTS GGGHHHHH: ExpBur :ebeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeebbebbbebbeeeebbbbbbbbbebbbbbeeeebbeebbeebeeeeebeebbbbebb: queryA 864:ISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWFT: 963 : ** ***** * ************ ************** ****** * ********** * ******************************* ** : 5lds_C_2 843:NSIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYGGGSFSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNMDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNWFI: 942 SecStr :HHHHHSTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHSSSSSHHHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bebbebeebbebbbebbeeebeebeeebbeebebbeebbebbbebbbeeebbeebeebeeeeeeebbbbbebbbebbbbebebbbebbeebeeebbebbe: queryA 964:ENS: 966 :* *: 5lds_C_2 943:EHS: 945 SecStr :HT : ExpBur :eee: |