CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | B 1 (B) | polymer(polypeptide(L)) [887 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_PIG | |
2 | b | R 1 (B) | non-polymer(NAG) | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose | 228A 507F 510Q 511N (identity: 100.0 %/78.4 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5lg6_B_1 identity=78.4% |
queryA 65:LDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVV: 164 :***** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** ******* ** * ** ***** ******: 5lg6_B_1 43:LDQSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYTXXX-XUVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLVV: 141 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEE S SSS EEEEEEEEEEEESS EEEEEEE S EE ----- EEEESTT EEEEEEETTTTEEEE: ExpBur :eeeeeebbeeebeebbebebbebebbbebeeeeeeebbbebebbbebebeeebebbbbbbeebebe-----ebebebeeeeeebeeeeeeebeebbbbbb: queryA 165:HLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNW: 264 :****** ** *** *************** **** ** **** * ************* ** ******** ****** *** **** *****: 5lg6_B_1 142:HLKGSLQPGHUYEUESEFQGELADDLAGFYRSEYUEGNVKKVLATTQUQSTDARKSFPCFDEPAUKATFNITLIHPNNLTALSNUPPKGSSTPLAEDPNW: 241 SecStr :EEEEEE TT EEEEEEEEEEE BSSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B TT BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EE SS TTE: ExpBur :bbeeebeeeeebebbbebebebbeebbbbbbbebebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeeeeeb: Contact : b queryA 265:NVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRE: 364 : **** *** ****** ***** * * *********** *** *** ************** ** * ********* ******** **********: 5lg6_B_1 242:SVTEFETTPVUSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGUYALNVTGPILNFFANHYNTSYPLPKSDQIALPDFNAGAUENWGLVTYRE: 341 SecStr :EEEEB SB GGG EEEES EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEH: ExpBur :bbbebeebeebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebebebbbbbebbeeebbebbbebbbebbbebbebbebebebebbbbbbbbbbeeebbbbbbbbbbbb: queryA 365:NSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINT: 464 :* ***** *** ************************ ********************* ********** * ***** *********** *** * **: 5lg6_B_1 342:NALLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVUAVDALASSHPLTTPAEEVNT: 441 SecStr :HHH TTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTT GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG S: ExpBur :bbbbbbeebbbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbeebebeebbbbebbbebbeebbbeebbebbbeeeebeb: queryA 465:PAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQ: 563 :****** ** ********* * ** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** * ***** ********* ** **: 5lg6_B_1 442:PAQISEUFDSISYSKGASVIRULSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIUDRWTLQUGFPVITVDTKTGNISQ: 541 SecStr :HHHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SS SS HHHHHHHHHHS S EEEEEETTTTEEEE: ExpBur :eeebebbeeebbebbbbbbbbbbbebbebebbeebbbebbeebeeeebebebbbebbbebbeeeeeeeeeeebeebbbbbbebebbbbbebebeebebeb: Contact : b bb queryA 564:EHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQII: 662 : ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** *: 5lg6_B_1 542:KHFLLDXXXXXXXSSAFDYLWIVPISSIKNGVUQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNVNVTGYFQVNYDEDNWRUIQHQLQTNLSVIPVINRAQVI: 641 SecStr :EE ------- SSTT EEE EEETTEE EEE SSSEEE GGG TT EEESGGG SSSEEEE HHHHHHHHHHHHH GGGS HHHHHHHH: ExpBur :ebbeee-------eeeeebebbbbbbbbbeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebbebbeeebeebeebbbbbbb: queryA 663:NDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACS: 762 : * **** ** ******* ***** * * ** ********* * ********* * ** *** *** ** * ** * **** ***** ********: 5lg6_B_1 642:YDSFNLATAHUVPVTLALDNTLFLNGEKEYUPWQAALSSLSYFSLUFDRSEVYGPUKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLUDQYSEINAISTACS: 741 SecStr :HHHHHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbbbbbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbebbbebbebbebbbbeeebeebbeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbbe: queryA 763:NGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATST: 862 :** * ** ** ** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** ****************: 5lg6_B_1 742:NGLPQCENLAKTLFDQWUSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATST: 841 SecStr :TT HHHHHHHHHHHHHHHHSTTS S HHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHGGG S HHHHHHHHHHTT TTTS HHHHHHH: ExpBur :bebeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeebeebbebbbebbeeeebbbbbebbbebbbbbeeeebbeebbeebbeeeebeebbbbeb: queryA 863:IISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWF: 962 :* ** ***** * ************ ** ******* ****** * ********** * ******************************* **: 5lg6_B_1 842:INSIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYXXXXXSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNUDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNWF: 941 SecStr :HHHHHHSTTTHHHHHHHHHHTHHHHHH ----- HHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTSSS GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbebbebeebbebbbebbeeebeebeeeb-----ebeebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeeeebeebeebbebbbeebebbbebbeebeeebbebb: queryA 963:TENS: 966 : * *: 5lg6_B_1 942:IEHS: 945 SecStr :HHH : ExpBur :eeee: |