CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [904 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_FELCA |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:8jkt_A_1 identity=79.2% |
queryA 66:DQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQP-PDIDKTELVEPTEYLVV: 164 :**** ** **** ** **** ********** ***** * ******* * ***** **** *** * * **** * * * ***** ******: 8jkt_A_1 64:DQSKPWNVYRLPKTLIPDSYNVTLRPYLTPNNKGLYVFTGTNIVRFTCKESTNIVIIHSKRLNYTSHQGHMVALSGVGGFHPQPVIVRTELVELTEYLVV: 163 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEESS SEEEEE S EE SSSSSEEEEETT SS EEEEEEETTTTEEEE: ExpBur :eeeeeeeeeebeebbebebbebebbbebeeeeeeebbbebebebebebeeebebbbbbbbebebeeeeebbbebebeeeeeeeeebeebeebeebbbbbb: queryA 165:HLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNW: 264 :** ** **** *** ***************** * ** *** *** *************** **** *** * ******* *** * *** *: 8jkt_A_1 164:HLQEPLVAGRQYEMNSEFQGELADDLAGFYRSEYMENGVKKVLATTHMQATEARKSFPCFDEPAMKATFNITIIHPNNLVALSNMLPRGPSVPFGEDPTW: 263 SecStr :EESS TT EEEEEEEEEEE SSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B STTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EEETTEEEE: ExpBur :bbeeebeeeeebebebebebebbeebbbbbbbebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbeebebbbbbeeeeeeeebeeeeeb: queryA 265:NVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRE: 364 : **** *** ******* ***** *** * ************* ******* ****** ** ******** ***** *******************: 8jkt_A_1 264:KVTEFETTPIMSTYLLAYIVSEFSYVETRAPSGVLIRIWARPSAINQGHGDYALKVTGPILDFFSQHYDTPYPLNKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRE: 363 SecStr :EEEEB SB GGG EEEE EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEH: ExpBur :ebbebeebbebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebbbbbbbbbebbeebbbebbbebbbebbbbbbebbebebebebbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbb: queryA 365:NSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINT: 464 : ** * **** * ********************* ********************** ****************************************: 8jkt_A_1 364:SALLYDRQSSSSGNQERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADFAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINT: 463 SecStr :HHH TTTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGG GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGGS S: ExpBur :bbbbbbeeebbbebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbebbbbbbbbbbbbeeeebee: queryA 465:PAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQ: 563 :****** ** ************** ** ** ** * ****** * ******** *** * * ** ** ** ** ************ *** **: 8jkt_A_1 464:PAQISEVFDSISYSKGASVLRMLSNFLTEDLFKMGIASYLHTYKYGNTIYLNLWEHLQQVVDKQPTIKLPDTVSAIMDRWILQMGFPVITVDTQTGTISQ: 563 SecStr :HHHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE TTHHHHHHHHHHHT SS SS HHHHHHHHHSS EEEEEETTTTEEEE: ExpBur :beebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbebbeeebbeebbbebbeeeeeebbebebbbebbbebbeebeeeebeeebebbbbebbbbbbbbbbebebeebbbeb: queryA 564:EHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQII: 662 : ****** * ***** *** ***** * * * * *** * ****** * * ************ **** *** ******* * * ******** *: 8jkt_A_1 564:QHFLLDPQSVVTRPSQFNYLWIVPISSVRSGSPQAHYWLPGVEKAQNDLFKTTANDWVLLNLNVTGYYLVNYDNENWKKIQTQLQTDLSVIPVINRAQVI: 663 SecStr :EE SSTTS S TTTT EEE EEETTEE EEE S SEEE GGG TT EEESGGG SSSEEEE HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHHHH: ExpBur :ebbbbbeebeeebebebebbbbbbbbbbeeeeeeeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbeebbbbbbbbbbeebbeebbebbeeebeebeebbbbbbb: queryA 663:NDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACS: 762 : ******** *************** * **** *********************** ********** ** * ** * ******* ** *****: 8jkt_A_1 664:HDAFNLASAQKVPVTLALNNTLFLIQETEYMPWQAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKRYLKKQVTPLFNHFERVTKNWTDHPQTLMDQYSEINAVSTACS: 763 SecStr :HHHHHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbbbbbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbbbbbebbebbebbbbeeebeebbeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbebbbebbbe: queryA 763:NGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATST: 862 : ****** ** ** ** ************************* * **** * ********* ***** ***** ***** * ****** ***: 8jkt_A_1 764:YGVPECEKLAATLFAQWKKNPQNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWNFVWEQFLKAELVNEADKLRGALACSNQVWILNRFLSYTLDPNLIRKQDVTST: 863 SecStr :TT HHHHHHHHHHHHHHHH TTS S HHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHT SHHHHHHHHHHGGG HHHHHHHHHHTT TTTS GGGHHHH: ExpBur :bebeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeeebebbbebbeeeebebbbebbbebbbbbeeeebbeebbeebeeeeebebbbbbeb: queryA 863:IISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWF: 962 : ** ** ** ************** *** ******************* ********** * ***** ************** ******* *** **: 8jkt_A_1 864:LSSISSNVVGQTLVWDFVQSNWKKLFQDYGTGSFSFSNLIQAVTRRFSTEFELQQLEQFKKNNMDTGFGSATRALEQALEKTKANLKWVKENKDVVLRWF: 963 SecStr :HHHHHHSTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSSHHHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbebbebeebbebbbebbeeebeebbeebbeebebbbebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeeeebbbbebbbebbbbebebbbebbeebeeebeebb: queryA 963:TENS: 966 :****: 8jkt_A_1 964:TENS: 967 SecStr :HHT : ExpBur :eeee: |