CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [900 aa] | Aminopeptidase :K7GMF9_PIG |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5z65_A_1 identity=79.8% |
queryA 68:SKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHLK: 167 :** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** *** ******* ** * ** ***** *********: 5z65_A_1 4:SKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYT-TQGHMVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLVVHLK: 102 SecStr : TTSSSS SSEEEEEEEEEEEEE S SSS EEEEEEEEEEEESS EEEEEEE S EE - SSSS EEEESTT EEEEEEETTTTEEEEEEE: ExpBur :eeebeeeebeebbebebbebebebebeeeeeeebbbebebbbebebeeebebbbbbbbebebe-beeeebebebeeebebeebeebeebeebbbbbbbbe: queryA 168:GSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVT: 267 :*** *** *** ******************** ** ****** **************** ******** ******* *** **** ***** **: 5z65_A_1 103:GSLQPGHMYEMESEFQGELADDLAGFYRSEYMEGNVKKVLATTQMQSTDARKSFPCFDEPAMKATFNITLIHPNNLTALSNMPPKGSSTPLAEDPNWSVT: 202 SecStr :EEE TT EEEEEEEEEEE SSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B STTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EE TT TTEEEE: ExpBur :eebeeeeebebbbebebebbeeebbbbbbebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeeeeebbbb: queryA 268:EFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRENSL: 367 :** *** ******* ***** * * *********** *** *** ************** ** *********** ******************** *: 5z65_A_1 203:EFETTPVMSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGMYALNVTGPILNFFANHYNTPYPLPKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRENAL: 302 SecStr :EB SB GGG EEEE EEEEEE TT EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS SSSEEEEEEETT TT EE TTEEEEEHHHH: ExpBur :ebeebbebbbbbbbbbbbebeebeeeeeeebebebbbebebbeeebbebbbebbbebbebbeebbebebebebbbbbbbbebeeebbbbbbbbbbebebb: queryA 368:LFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQ: 467 :**** *** ************************ ********************* ********** * ***************** *** * *****: 5z65_A_1 303:LFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVMAVDALASSHPLTTPAEEVNTPAQ: 402 SecStr : TTT HHHHHHHHHHHHHHHHTTTBTTTEEESSGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTS GGGHHHHTHHHHHHHHTSTT S GGG SHHH: ExpBur :bbbeebbbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbeebebebbbbbebbbebbeebbeeebebbbbeeeebeeeee: queryA 468:ISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHF: 566 :*** ** ********* **** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** ** *************** ** ** **: 5z65_A_1 403:ISEMFDSISYSKGASVIRMLSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIMDRWTLQMGFPVITVDTKTGNISQKHF: 502 SecStr :HHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SSS SS HHHHHHHHHSS S EEEEEETTTTEEEEEE : ExpBur :beebeeebbebbbbbbbbbbbebbeeebbeebbbebbeebeeeebebeebbebbbebbeeeeeeebeeebebbbbbbbebbbbbbbebebeebebebebb: queryA 567:LLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQIINDA: 665 :*** ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** * * : 5z65_A_1 503:LLDSESNVTRSSAFDYLWIVPISSIKNGVMQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNINVTGYFQVNYDEDNWRMIQHQLQTNLSVIPVINRAQVIYDS: 602 SecStr : SSTT S TTSS EEE EEETTEE EEE SSSEEE GGG TT EEESGGG SSSEEEE HHHHHHHHHHHHH GGGS HHHHHHHHHHH: ExpBur :bbeeeeeeeeebeeebebbbbbbbbeeeeeeeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebbebbeeebeebebbbbbbbbbbb: queryA 666:FNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSNGV: 765 :**** ** ******* ***** * **** ********* ************* ** *** *** ** * ** * ********** ********** : 5z65_A_1 603:FNLATAHMVPVTLALDNTLFLNGEKEYMPWQAALSSLSYFSLMFDRSEVYGPMKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLMDQYSEINAISTACSNGL: 702 SecStr :HHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG SHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHHTT : ExpBur :bebbebeebebebbbebbbbbeebeebbbbbbbeebbeebebbbbeeebeebbeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbbebeb: queryA 766:PECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIIS: 865 :* ** ** *** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** ***************** *: 5z65_A_1 703:PQCENLAKTLFDQWMSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATSTINS: 802 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHH TTS S GGGHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHH SHHHHHHHHHHHTT HHHHHHHHHHTT TTTS GGGHHHHHHH: ExpBur :eebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeebeebbebbbebbeeeeeeebbebbbebbbbbeeeebbeebbeebeeeeebeeebbbebbbe: queryA 866:ITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWFTEN: 965 :* ***** * ************ ************** ****** * ********** * ******************************* ** * : 5z65_A_1 803:IASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYGGGSFSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNMDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNWFIEH: 902 SecStr :HHHSTTTHHHHHHHHHHHTTTHHHHTSS HHHHHHHHTTT SHHHHHHHHHHHTTTTTT GGGTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT: ExpBur :bbebeebbebbbebbeeebebbeebeeeeebebeebbebbbebbbeeebbeebeebbeeeeebebeebeebbeebbeebeebbebbeebeeebbebbeee: queryA 966:S: 966 :*: 5z65_A_1 903:S: 903 SecStr : : ExpBur :e: |