CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [900 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_PIG | |
2 | b | X 1 (A) | non-polymer(ACT) | ACETATE ION | 353A 355E 388H 389E 392H 411E 477Y (identity: 100.0 %/79.6 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5lds_A_1 identity=79.6% |
queryA 65:LDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVV: 164 :***** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** * ******* ** * ** ***** ******: 5lds_A_1 43:LDQSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYTXXX-HMVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLVV: 141 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEESS SEEEEE S EE ---- EEEE TT EEEEEEETTTTEEEE: ExpBur :eeeeeebbeeebeebbebebbebebebbbeeeeeeebbbebebebebebeeebebbbbbbeebebe----eebebeeeeebeebebeebeebeebbbbbb: queryA 165:HLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNW: 264 :****** *** *** ******************** ** ****** **************** ******** ******* *** **** *****: 5lds_A_1 142:HLKGSLQPGHMYEMESEFQGELADDLAGFYRSEYMEGNVKKVLATTQMQSTDARKSFPCFDEPAMKATFNITLIHPNNLTALSNMPPKGSSTPLAEDPNW: 241 SecStr :EESS TT EEEEEEEEEEE SSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B TT BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EEETTEEEE: ExpBur :bbeeebeeeeebebebebebebbeebbbbbbbebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeeeeeb: queryA 265:NVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRE: 364 : **** *** ******* ***** * * *********** *** *** ************** ** * ********* *******************: 5lds_A_1 242:SVTEFETTPVMSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGMYALNVTGPILNFFANHYNTSYPLPKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRE: 341 SecStr :EEEEB SB GGG EEEE EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEG: ExpBur :bebebeebbebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebebbbbbbbebbeeebbebbbebbbebbbbbbebbebebebebbbbbbbbbbebebbbbbbbbbbbb: Contact : b b queryA 365:NSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINT: 464 :* ***** *** ************************ ********************* ********** * ***************** *** * **: 5lds_A_1 342:NALLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVMAVDALASSHPLTTPAEEVNT: 441 SecStr :GGT TTTS HHHHHHHHHHHHHHHHTTTBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGG GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG S: ExpBur :bbbbbbeeebbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbeebbbbebbbbbbeeeebeb: Contact : bb b b queryA 465:PAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQ: 563 :****** ** ********* **** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** ** *************** ** **: 5lds_A_1 442:PAQISEMFDSISYSKGASVIRMLSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIMDRWTLQMGFPVITVDTKTGNISQ: 541 SecStr :HHHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SSS SS HHHHHHHHHSS S EEEEEETTTTEEEE: ExpBur :beebbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbebebbeebbbebbeebeeeebebeebbebbeebbeeeeeeeeeeebeebbbbbbebbbbbbbebebeebebeb: Contact : b queryA 564:EHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQII: 662 : ***** ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** *: 5lds_A_1 542:KHFLLDSESNVTRSSAFDYLWIVPISSIKNGVMQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNVNVTGYFQVNYDEDNWRMIQHQLQTNLSVIPVINRAQVI: 641 SecStr :EE S SS S TTTT EEE EEETTEE EEE SSSEEE GGG TT EEESGGG SS EEEE HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHHHH: ExpBur :ebbebeeeeeeeeebebebebbbbbbbbeeeeebeebbbeeeeebeeeebebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebeebbeeebeebeebbbbbbb: queryA 663:NDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACS: 762 : * **** ** ******* ***** * **** ********* ************* ** *** *** ** * ** * ********** ********: 5lds_A_1 642:YDSFNLATAHMVPVTLALDNTLFLNGEKEYMPWQAALSSLSYFSLMFDRSEVYGPMKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLMDQYSEINAISTACS: 741 SecStr :HHHHHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG SHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbbebbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbbbbbebbebbebbbbeeebeeebeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbbe: queryA 763:NGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATST: 862 :** * ** ** *** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** ****************: 5lds_A_1 742:NGLPQCENLAKTLFDQWMSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATST: 841 SecStr :TT HHHHHHHHHHHHHHHTSTTS S GGGHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHH S HHHHHHHHHHHTT HHHHHHHHHHTT TTTS GGGHHHH: ExpBur :bebeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeebbebbbebbeeeebbbbbbbbbebbbbbeeeebbeebbeebbeeeebebbbbbeb: queryA 863:IISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWF: 962 :* ** ***** * ************ ************** ****** * ********** * ******************************* **: 5lds_A_1 842:INSIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYGGGSFSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNMDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNWF: 941 SecStr :HHHHHHSTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTT SSHHHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbebbebeebbebbbebbeeebeebeeebbeebebbeebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeeebbebbebbbebbbbebebbbebbeebeeebbebb: queryA 963:TENS: 966 : * *: 5lds_A_1 942:IEHS: 945 SecStr :HHH : ExpBur :eebe: |