CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [904 aa] | Aminopeptidase :K7GMF9_PIG | |
2 | b | Q 1 (A) | non-polymer(GOL) | GLYCEROL | 88T 90R 104K 105G (identity: 100.0 %/79.5 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:7vpp_A_1 identity=79.5% |
queryA 62:ATTLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEY: 161 :* ****** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** *** ******* ** * ** ***** ***: 7vpp_A_1 1:AITLDQSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYT-TQGHMVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEY: 99 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEE S SEEEEE S EE - SSSS EEEESTT EEEEEEETTTTE: ExpBur :eeeeeeeeebbeeebeebbebebbebebebebeeeeeeebbbebebebebebeeebebbbbbbeebebe-beeeebebeeeeebeebebeebeebeebbb: Contact : b b bb queryA 162:LVVHLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPED: 261 :********* *** *** ******************** ** ****** **************** ******** ******* *** **** **: 7vpp_A_1 100:LVVHLKGSLQPGHMYEMESEFQGELADDLAGFYRSEYMEGNVKKVLATTQMQSTDARKSFPCFDEPAMKATFNITLIHPNNLTALSNMPPKGSSTPLAED: 199 SecStr :EEEEESS TT EEEEEEEEEEE BSSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B STTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EE SS : ExpBur :bbbbbeeebeeeeebebbbbbebebbeebbbbbbbebebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeee: queryA 262:PNWNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVT: 361 :*** **** *** ******* ***** * * *********** *** *** ************** ** *********** ****************: 7vpp_A_1 200:PNWSVTEFETTPVMSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGMYALNVTGPILNFFANHYNTPYPLPKSDQIALPDFNAGAMENWGLVT: 299 SecStr :TTEEEEEB SB GGG EEEE EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEE: ExpBur :eebbbbebeebbebbbbbbbbbbbebeebeeebeeebebbbbbbbebbeeebbebbbebbbebbbebbebbebebebebbbbbbbbbbeeebbbbbbbbb: queryA 362:YRENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASE: 461 :**** ***** *** ************************ ********************* ********** * ***************** *** *: 7vpp_A_1 300:YRENALLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVMAVDALASSHPLTTPAEE: 399 SecStr :EEHHHH TTTS HHHHHHHHHHHHHHHHTTTBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGG GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG: ExpBur :bbbbbbbbbeeebbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbebbbbbbbbbbbbeeee: queryA 462:INTPAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGT: 560 : ******** ** ********* **** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** ** *************** ** : 7vpp_A_1 400:VNTPAQISEMFDSISYSKGASVIRMLSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIMDRWTLQMGFPVITVDTKTGN: 499 SecStr : SHHHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHTTTEEE HHHHHHHHHHHHTT SS SS HHHHHHHHHSS S EEEEEETTTTE: ExpBur :beeeeebebbeebbbebbbbbbbbbbbebbeeebbeebbbebbeebeeeebebeebbebbbebbeeeeeeeeeeebebbbbbbbebbbbbbbebebeebe: queryA 561:LSQEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRA: 659 : ** ***** ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * *******: 7vpp_A_1 500:ISQKHFLLDSESNVTRSSAFDYLWIVPISSIKNGVMQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNINVTGYFQVNYDEDNWRMIQHQLQTNLSVIPVINRA: 599 SecStr :EEEEE SSS S TTTT EEE EEETTEE EEE S SEEE GGG TT EEESGGG SSSEEEE HHHHHHHHHHHHHTSTTS HHHHH: ExpBur :bebebbbbbeeeeeeeebebebbbbbbbbbbeeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbebbbeebeeeeeebeebbbb: queryA 660:QIINDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAIST: 759 :* * * **** ** ******* ***** * **** ********* ************* ** *** *** ** * ** * ********** *****: 7vpp_A_1 600:QVIYDSFNLATAHMVPVTLALDNTLFLNGEKEYMPWQAALSSLSYFSLMFDRSEVYGPMKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLMDQYSEINAIST: 699 SecStr :HHHHHHHHHHHTTTS HHHHHGGGGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbbbbbebbbbeebebebbbebbbbbeebeebbbbebbbebbebbebbbbeeebeeebeebbeebbeebbeebeeebeebeeebeebbebbbbbbbbeb: queryA 760:ACSNGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDA: 859 :***** * ** ** *** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** *************: 7vpp_A_1 700:ACSNGLPQCENLAKTLFDQWMSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDA: 799 SecStr :HHHTT HHHHHHHHHHHHHHHH TTS S GGGHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHT SSHHHHHHHHHHGGG HHHHHHHHHHTT TTTS GGGH: ExpBur :bbebebeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeeebebbbeebeeeebebbbbbbbebbbbbeeeebbeebbeebeeeeebeebbb: queryA 860:TSTIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVL: 959 :**** ** ***** * ************ *** ******* ****** * ********** * *******************************: 7vpp_A_1 800:TSTINSIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYGXXXXSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNMDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVL: 899 SecStr :HHHHHHHHHSTTHHHHHHHHHHTTHHHHTTS ---- HHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bebbbebbebeebbebbbebbeeebeebeeebe----ebeebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeeeebebbeebbebbbbebebbbebbeebeeebb: queryA 960:QWFTE: 964 : ** *: 7vpp_A_1 900:NWFIE: 904 SecStr :HHHHS: ExpBur :ebbee: |