CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [889 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_PIG | |
2 | b | G 1 (A) | non-polymer(NAG) | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose | 333D(N) 501A 505H (identity: 66.7 %/78.5 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5lg6_A_1 identity=78.5% |
queryA 64:TLDQSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLV: 163 :****** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** ******* ** * ** ***** *****: 5lg6_A_1 42:TLDQSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYTXXX-XUVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLV: 140 SecStr : TTSGGGSSS SSEEEEEEEEEEEE S SSS EEEEEEEEEEEESS EEEEEEE S EE ----- EEEESSS EEEEEEETTTTEEE: ExpBur :eeeeeeebbeeebeebbebebbebebbbebeeeeeeebbbebebebebebeeebebbbbbbeebebe-----ebebebeeebeebeeeeeeebeebbbbb: queryA 164:VHLKGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPN: 263 :******* ** *** *************** **** ** **** * ************* ** ******** ****** *** **** ****: 5lg6_A_1 141:VHLKGSLQPGHUYEUESEFQGELADDLAGFYRSEYUEGNVKKVLATTQUQSTDARKSFPCFDEPAUKATFNITLIHPNNLTALSNUPPKGSSTPLAEDPN: 240 SecStr :EEEEEEE TT EEEEEEEEEEE BSSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B TTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EE SS TT: ExpBur :bbbeeebeeeeebebbbebebebbeebbbbbbbebebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeeeee: queryA 264:WNVTEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYR: 363 :* **** *** ****** ***** * * *********** *** *** ************** ** * ********* ******** *********: 5lg6_A_1 241:WSVTEFETTPVUSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGUYALNVTGPILNFFANHYNTSYPLPKSDQIALPDFNAGAUENWGLVTYR: 340 SecStr :EEEEEB SB GGG EEEES EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEE: ExpBur :bbbbebeebeebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebebebbbbbebbeeebbebbbebbbebbbebbebbebebebebbbbbbbbbbeeebbbbbbbbbbb: Contact : b queryA 364:ENSLLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEIN: 463 :** ***** *** ************************ ********************* ********** * ***** *********** *** * *: 5lg6_A_1 341:ENALLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVUAVDALASSHPLTTPAEEVN: 440 SecStr :HHHH TTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTT GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG : ExpBur :bbbbbbbeebbbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbebbbbeebbebbbeeeebe: queryA 464:TPAQISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLS: 562 :******* ** ********* * ** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** * ***** ********* ** *: 5lg6_A_1 441:TPAQISEUFDSISYSKGASVIRULSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIUDRWTLQUGFPVITVDTKTGNIS: 540 SecStr :SHHHHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SS SS HHHHHHHHHHS S EEEEEETTTTEEE: ExpBur :eeeebbbbbbebbebbbbbbbbbbbebbebebbeebbbebbeebeeeebebebbbebbeebbeeeeeeebeeebeebbbbbbebebbbbbebebeebebe: Contact : b b queryA 563:QEHFLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQI: 661 :* **** * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** : 5lg6_A_1 541:QKHFLLXXXXXXXXXXAFDYLWIVPISSIKNGVUQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNVNVTGYFQVNYDEDNWRUIQHQLQTNLSVIPVINRAQV: 640 SecStr :EEE ---------- TT EEE EEETTEE EEE SSSEEE GGG TT EEESGGG SSSEEEE HHHHHHHHHHHHH GGGS HHHHHHH: ExpBur :bebbee----------eeeeebbbbbbbbbeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebbebbeeebeebeebbbbbb: queryA 662:INDAFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTAC: 761 :* * **** ** ******* ***** * * ** ********* * ********* * ** *** *** ** * ** * **** ***** *******: 5lg6_A_1 641:IYDSFNLATAHUVPVTLALDNTLFLNGEKEYUPWQAALSSLSYFSLUFDRSEVYGPUKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLUDQYSEINAISTAC: 740 SecStr :HHHHHHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbbbbbbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbebbbebbebbebbbbeeebeeebeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbb: queryA 762:SNGVPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATS: 861 :*** * ** ** ** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** ***************: 5lg6_A_1 741:SNGLPQCENLAKTLFDQWUSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATS: 840 SecStr :HTT HHHHHHHHHHHHHHHHSTTS S HHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHGGG S HHHHHHHHHHTT TTTS HHHHHH: ExpBur :ebbbeebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeebeebbebbbebbeeeebbbbbebbbebbbbbeeeebbeebbeebbeeeebeebbbbe: queryA 862:TIISITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQW: 961 :** ** ***** * ************ ** ********** ****** * ********** * ******************************* *: 5lg6_A_1 841:TINSIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYXXGSFSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNUDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNW: 940 SecStr :HHHHHHHSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHH -- SHHHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTSSS GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :bbbebbebeebbebbbebbeeebeebeeeb--eeebbeebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeeeebebbeebbebbbeebeebbebbeebeeebbeb: queryA 962:FTENS: 966 :* * *: 5lg6_A_1 941:FIEHS: 945 SecStr :HHHH : ExpBur :beeee: |