CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(ACE2_HUMAN) | E 1 (E) | polymer(polypeptide(L)) [592 aa] | Angiotensin-converting enzyme 2 :ACE2_MOUSE | |
2 | b | D 1 (C) | polymer(polypeptide(L)) [1026 aa] | Spike glycoprotein :SPIKE_SARS2 | 24Q(N) 27T 28F 31K(N) 34H(Q) 38D 41Y 42Q 79L(T) 83Y(F) 353K(H) 354G 355D 357R (identity: 57.1 %/83.6 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:7xob_E_1 identity=83.6% |
queryA 19:STIEEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNT: 118 :* ** ***** ** ***** ****************** * * * ***** *** ** ***** * ******* *** ** ** * ***: 7xob_E_1 19:SLTEENAKTFLNNFNQEAEDLSYQSSLASWNYNTNITEENAQKMSEAAAKWSAFYEEQSKTAQSFSLQEIQTPIIKRQLQALQQSGSSALSADKNKQLNT: 118 SecStr : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS TTT SHHHHHHHHHHH GGGS HHHHHHHHH: ExpBur :eeebeebeebbeebbeebeebbeebeebbbeebbeeeeeeeeeeeebeeeeeebeeebbeebeeeebeebeeeebebbbebbbeebeeebeeeeeeebee: Contact : b bb b b b bb b b queryA 119:ILNTMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYS: 218 :**************** ********* **** * *** ****** ** ************************ * *********** * *** * : 7xob_E_1 119:ILNTMSTIYSTGKVCNXXXXXECLLLEPGLDEIMATSTDYNSRLWAWEGWRAEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANNYNDYGDYWRGDYEAEGADGYNYN: 218 SecStr :HHHHHHHHHHT EEE ----- EEETTTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT S HHHHHTTTT SSSSS : ExpBur :bbeebeebbeebebee-----eeeebeebbeeebbeeeebeebbebbebbbbebbeebbeebeebbebbbebbeebeeeebbbebbeebebeeeeeeebe: queryA 219:RGQLIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSV: 318 :* ******* ** ************** *** ******* ******************** ***** *********** * *** *** *********: 7xob_E_1 219:RNQLIEDVERTFAEIKPLYEHLHAYVRRKLMDTYPSYISPTGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYPLTVPFAQKPNIDVTDAMMNQGWDAERIFQEAEKFFVSV: 318 SecStr :SHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGG TTS EETTSSSSSS S GGGTTTS S TTS HHHHHHTT HHHHHHHHHHHHHHT: ExpBur :beebbebbeebbeebeebbebbbbbbbeebeeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbebeebbeebebeeeeeeeebbeebeeeebebeebbebbbebbeeb: queryA 319:GLPNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHL: 418 :*** ****** ***** * * ********** ***** ******** ****************** *******************************: 7xob_E_1 319:GLPHMTQGFWANSMLTEPADGRKVVCHPTAWDLGHGDFRIKMCTKVTMDNFLTAHHEMGHIQYDMAYARQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHL: 418 SecStr :T GGGGTT S SSS S EEEE SSS EEEE SSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTGGGS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHSSHHHH: ExpBur :ebeebeeebeeebbbeebeeeeebeeeebbbebbeebbbbbbbbeeebeebbebbbbbbbbbbbbbbeebeebbeebbbbbbeebbbebbbbbbbbeebb: Contact : bbb b queryA 419:KSIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTR: 518 :****** ***** ******************************** ***** ******************* ***************************: 7xob_E_1 419:KSIGLLPSDFQEDSETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFRGEIPKEQWMKKWWEMKREIVGVVEPLPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTR: 518 SecStr :HHHTSS TT HHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHHHHHHHHHHHTT S TTSHHHHHHHHHHHTS EE SS TT SGGGSHHHHTT STHHHHH: ExpBur :eebebbeeeeeeeeebebbebbeebbebbbbbbbbbbbbebbbbbbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbebbbbeebbbeebbb: queryA 519:TLYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSPYAD: 615 :* ************** * **************** ** ** ***** ******** ** * ****** *** *** ** ****** * ******: 7xob_E_1 519:TIYQFQFQEALCQAAKYNGSLHKCDISNSTEAGQKLLKMLSLGNSEPWTKALENVVGARNMDVKPLLNYFQPLFDWLKEQNRNSFVGWNTEWSPYAD: 615 SecStr :HHHHHHHHHHHHHTTT S GGG TT THHHHHHHHHHTTTTSS HHHHHHHHTS SS HHHHHHSHHHHHHHHHHTTSS SS TT SS : ExpBur :bbbbbbbbebbbeeeeeeeebbbbebbebeebbeebeebbebbebebbbebbebbeeeebbebebbbebbeebbebbeeebeeeeebbeeeebeeee: |