CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(ACE2_HUMAN) | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [596 aa] | mink ACE2 | |
2 | b | B 1 (E) | polymer(polypeptide(L)) [185 aa] | Spike protein S1 :SPIKE_SARS2 | 19S 24Q(L) 27T 28F 30D(E) 31K 34H(Y) 37E 38D(E) 41Y 42Q 83Y 330N 353K 354G(H) 355D 357R 393R (identity: 72.2 %/84.1 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:7f5r_A_1 identity=84.1% |
queryA 19:STIEEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNT: 118 :** * ***** *** *** * ** ************ ** * ** ** ***** * * * *** *** * ** **** ****** ** ****: 7f5r_A_1 1:STTEDLAKTFLEKFNYEAEELSYQNSLASWNYNTNITDENIQKMNIAGAKWSAFYEEESQHAKTYPLEEIQDPIIKRQLRALQQSGSSVLSADKRERLNT: 100 SecStr : HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG SHHHHHHHHHHH SSSS HHHHHHHHH: ExpBur :eeebeebeebbeebbeebbebbbeebebebeebbeeeeebeeebeebeeebeebeeebbeebeebebeebeeeebebbbeebbebbbeebeeeeeeebee: Contact :b b bb bb b bb bb b queryA 119:ILNTMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYS: 218 :*** ********* *** ************ ** ** ********** ***************** ********* ************* *** **: 7f5r_A_1 101:ILNAMSTIYSTGKACNPNNPQECLLLEPGLDDIMENSKDYNERLWAWEGWRSEVGKQLRPLYEEYVALKNEMARANNYEDYGDYWRGDYEEEWADGYNYS: 200 SecStr :HHHHHHHHHHH EEEETTEEEEEEETTTHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSHHHHHHGGG B TTTT B : ExpBur :bbeebeebbeebebebeeeeeeeeebeebbbebbeebeebeebbbbbbbbbeebbeebbebbeebbebbbebbeeeeeebbbbbbbbebbbeeeeebebe: queryA 219:RGQLIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSV: 318 :* ********** ***************** **** *** ******************** * **************** * *** *** *********: 7f5r_A_1 201:RNQLIEDVEHTFTQIKPLYEHLHAYVRAKLMDAYPSRISPTGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYPLMVPFGQKPNIDVTDAMVNQSWDARRIFEEAEKFFVSV: 300 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTSS SSS EEGGGSSSSSSS GGGGGGGS SSTTS THHHHHHTT HHHHHHHHHHHHHHT: ExpBur :beebeebbeebbeebeebbebbbbbbbeebeeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbebeebbeebebeeeeeeeebbeebeeeebebeebbebbbebbeeb: queryA 319:GLPNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHL: 418 :****** *** ***** ** * *********** **** ******************************************************** **: 7f5r_A_1 301:GLPNMTEGFWQNSMLTEPGDNRKVVCHPTAWDLGKHDFRIKMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPNHL: 400 SecStr :T HHHHHH B S SS S EEEEEETTEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTS GGG S SSTTHHHHHHHHHHHHHHSHHHH: ExpBur :ebeebeeebeeebbbeeeeeeeebeeeeeebebbeebbbbbbbbeeebeebbebbbbbbbbbbbbbbbeeebbbbebbbebbbebbbebbbbbbbbbebb: Contact : b bbb b b queryA 419:KSIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTR: 518 :* **** *** ** ** *********************************** *** ******* ******* ********** **** ***********: 7f5r_A_1 401:KNIGLLPPDFSEDSETDINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKEQWMQKWWEMKRDIVGVVEPLPHDETYCDPAALFHVANDYSFIRYYTR: 500 SecStr :HHTTSS TT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS GGGHHHHHHHHHHHHH EE SS TT GGGGSHHHHTT THHHHH: ExpBur :eebebbeeeeeeeeebbbbebbebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbebbbbbebbbebbbe: queryA 519:TLYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSPYA: 614 :* *********** ******* ******* ****** ** ** * *** *** ***** * **************** ** ****** *******: 7f5r_A_1 501:TIYQFQFQEALCQIAKHEGPLYKCDISNSREAGQKLHEMLSLGRSKPWTFALERVVGAKTMDVRPLLNYFEPLFTWLKEQNRNSFVGWNTDWSPYA: 596 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHTT S STT TT HHHHHHHHHHHTTTTSS HHHHHHHHHS SS HHHHHHHHHHHHHHHHHTTTS S SS S : ExpBur :bbbbbbbbebbbeeeeeeeebbebbbbebeebbeebeebbebbebebbbbbbeebeeeeebebebbeebbeebbebbeeebeeeeebbeeeebeee: |