CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | B 1 (B) | polymer(polypeptide(L)) [901 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_FELCA | |
2 | b | D 1 (D) | polymer(polypeptide(L)) [900 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_FELCA | 710D 711R 712S 713E 715Y 716G 720N(R) 806E 836K(N) 838L(V) 839W 842N 843R 874G(T) 878D 881Q 882S 913Y(F) 916Q 917Q 920Q (identity: 76.2 %/79.2 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:8jkt_B_1 identity=79.2% |
queryA 71:WNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQP-PDIDKTELVEPTEYLVVHLKGS: 169 :** **** ** **** ********** ***** * ******* * ***** **** *** * * **** * * * ***** ******** : 8jkt_B_1 69:WNVYRLPKTLIPDSYNVTLRPYLTPNNKGLYVFTGTNIVRFTCKESTNIVIIHSKRLNYTSHQGHMVALSGVGGFHPQPVIVRTELVELTEYLVVHLQEP: 168 SecStr :TTSSS SSEEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEESS SEEEEE S EE BTTBSEEEEESSS SS EEEEEEETTTTEEEEEESS : ExpBur :eeeeebeebbebebbebebbbebeeeeeeebebebebebebbbeeebebbbbbbbebebeeeeeeebebeeeeeeeeebebeebeebeebbbbbbbbeee: queryA 170:LVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNVTEF: 269 :** **** *** ***************** * ** *** *** *************** **** *** * ******* *** * *** * ****: 8jkt_B_1 169:LVAGRQYEMNSEFQGELADDLAGFYRSEYMENGVKKVLATTHMQATEARKSFPCFDEPAMKATFNITIIHPNNLVALSNMLPRGPSVPFGEDPTWKVTEF: 268 SecStr : TT EEEEEEEEEEE BSSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B STTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSSS EE TT TTEEEEEB: ExpBur :beeeeebebebebebebbeebbbbbbbebeeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbeebebbbbbeeeeeeeebeeeeebeebeb: queryA 270:HTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRENSLLF: 369 : *** ******* ***** *** * ************* ******* ****** ** ******** ***** ******************* ** : 8jkt_B_1 269:ETTPIMSTYLLAYIVSEFSYVETRAPSGVLIRIWARPSAINQGHGDYALKVTGPILDFFSQHYDTPYPLNKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRESALLY: 368 SecStr : SB GGG EEEE EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEHHHH : ExpBur :eebbebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebbbbbbbbbebbeeebbebbbebbbebbbebbebbebebebebbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbb: queryA 370:DPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQIS: 469 :* **** * ********************* ********************** *********************************************: 8jkt_B_1 369:DRQSSSSGNQERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADFAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPAQIS: 468 SecStr : TTTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGG GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGGS SHHHHH: ExpBur :beeebbbebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbeebebeebbbbebbbebbebbbbbbbbbbbbeeeebebeeebb: queryA 470:ELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEHFLL: 568 :* ** ************** ** ** ** * ****** * ******** *** * * ** ** ** ** ************ *** ** ****: 8jkt_B_1 469:EVFDSISYSKGASVLRMLSNFLTEDLFKMGIASYLHTYKYGNTIYLNLWEHLQQVVDKQPTIKLPDTVSAIMDRWILQMGFPVITVDTQTGTISQQHFLL: 568 SecStr :HTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SS SS HHHHHHHHHTS EEEEEETTTTEEEEEE S: ExpBur :bbbbebbbbbbbbbbbbbbebbeeebbeebbbebbeeeeeebbeeebbbebbbebbeebeeeebeeebeebbbbbbebbbbbbbebebeebebbbebbbe: queryA 569:DPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQIINDAFN: 667 :** * ***** *** ***** * * * * *** * ****** * * ************ **** *** ******* * * ******** * ****: 8jkt_B_1 569:DPQSVVTRPSQFNYLWIVPISSVRSGSPQAHYWLPGVEKAQNDLFKTTANDWVLLNLNVTGYYLVNYDNENWKKIQTQLQTDLSVIPVINRAQVIHDAFN: 668 SecStr :STT S TTTT EEE EEETTEE EEE S SEEE GGG TT EEESGGG SSSEEEE HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHHHHHHHHH: ExpBur :beeeeeeeebebebebbbbbebbeeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebebbbbbbbbeebbebbbebbeeebeebeebbbbbbbbbbbb: queryA 668:LASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSNGVPE: 767 :**** *************** * **** *********************** ********** ** * ** * ******* ** ***** ****: 8jkt_B_1 669:LASAQKVPVTLALNNTLFLIQETEYMPWQAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKRYLKKQVTPLFNHFERVTKNWTDHPQTLMDQYSEINAVSTACSYGVPE: 768 SecStr :HHHTTSS HHHHHHTTGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHHHT HH: ExpBur :bbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbbbbbebbeebebbbbeeebbebbeebbeebbeebbeebeeebeebeeebeebbebbbbebbbebbbebebee: Contact : bbbb bb b queryA 768:CEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTIISIT: 867 :** ** ** ** ************************* * **** * ********* ***** ***** ***** * ****** *** ** : 8jkt_B_1 769:CEKLAATLFAQWKKNPQNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWNFVWEQFLKAELVNEADKLRGALACSNQVWILNRFLSYTLDPNLIRKQDVTSTLSSIS: 868 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHSTTS S GGGHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHT SHHHHHHHHHHHTT HHHHHHHHHHTT TTTS GGGHHHHHHHHH: ExpBur :beebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeeebebbbebbeeeebebbbebbbebbbbbeeeebbebbbeebeeeeebebbbbbebbbebb: Contact : b b bb bb queryA 868:NNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWFTENS: 966 : ** ** ************** *** ******************* ********** * ***** ************** ******* *** ******: 8jkt_B_1 869:SNVVGQTLVWDFVQSNWKKLFQDYGTGSFSFSNLIQAVTRRFSTEFELQQLEQFKKNNMDTGFGSATRALEQALEKTKANLKWVKENKDVVLRWFTENS: 967 SecStr :HSTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTTSSSHHHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH : ExpBur :ebeebbebbbebbeeebeebbeebbeebebbbebbebbbebbbeeebbeebeebeeebeebebbbbebbbebbbbebebbbebbeebeeebbebbeeeb: Contact : b b bb b bb b |