Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed percentages rounded down, information per position, and relative weight of gapless real matches to pseudocounts A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -2 -3 -3 -4 -3 -1 -3 -4 -3 0 1 -2 9 -1 -4 -3 -2 -3 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 1.27 0.22 2 L 0 -3 -2 0 -2 -2 -2 2 -2 0 2 -2 4 3 -3 -2 -2 -1 1 -1 7 0 0 7 0 0 0 18 0 0 21 0 24 17 0 0 0 0 5 0 0.24 0.09 3 A 1 0 1 -1 -2 1 -1 2 -1 -2 -2 -1 -2 0 1 2 0 -3 -2 -2 13 8 10 0 0 9 0 15 0 4 0 0 0 7 7 23 5 0 0 0 0.19 0.06 4 L -2 -1 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -3 2 4 -1 1 2 -3 -3 0 -2 -1 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 12 62 5 0 12 0 0 6 0 0 0 0.43 0.12 5 I -1 -3 -3 -4 -2 0 -3 -4 -3 3 2 -3 3 3 -3 -2 -1 1 0 1 5 0 0 0 0 6 0 0 0 22 23 0 15 17 0 0 3 2 0 8 0.31 0.11 6 S 1 -2 2 1 -2 -1 1 -1 -2 -3 -3 -1 -2 -4 -2 4 1 -4 -3 -2 13 0 12 6 0 0 12 1 0 0 0 0 0 0 0 47 9 0 0 0 0.45 0.15 7 R -1 3 1 0 -3 0 -1 -1 0 -3 -3 2 -2 2 -2 2 -1 -3 -1 -3 2 25 9 5 0 0 0 4 1 0 0 18 0 15 0 22 0 0 0 0 0.31 0.13 8 L -1 -4 -4 -5 4 -3 -4 -4 -4 2 4 -4 2 1 -4 -3 -2 -3 -2 1 3 0 0 0 10 0 0 0 0 14 52 0 6 6 0 0 0 0 0 8 0.57 0.18 9 L 0 -2 -2 -1 3 -1 0 -3 -2 1 2 -1 2 1 -2 -1 -1 0 -1 1 6 0 0 4 10 0 11 1 0 5 22 5 8 9 0 3 0 1 0 14 0.13 0.08 10 D -2 -2 4 4 -3 -1 0 1 -1 -3 -4 1 -3 -4 0 1 0 -4 -3 -3 1 1 23 35 0 0 2 9 0 1 1 8 0 0 3 11 3 0 0 1 0.53 0.16 11 W -2 0 0 -1 1 -2 -1 -3 0 -1 0 -1 -2 2 -1 -2 -2 9 2 -2 1 6 5 3 4 1 3 1 3 2 9 3 0 10 4 1 1 33 8 1 0.78 0.19 12 F -2 -4 -2 -4 -3 -4 -4 -4 -3 0 1 -4 -1 7 -4 -3 -2 -1 3 -1 2 0 2 0 0 0 0 0 0 3 13 0 0 63 0 0 2 0 8 3 1.10 0.30 13 R -1 3 0 1 -3 1 1 0 -1 -3 -3 3 -2 -2 -2 1 -1 0 2 -3 1 20 2 8 0 6 8 7 0 0 1 21 0 0 0 15 0 1 9 0 0.33 0.15 14 S 0 1 1 0 -2 -1 -1 1 -2 -3 -2 0 -2 1 -2 3 1 -2 2 -2 6 9 6 6 0 0 0 10 0 0 2 3 0 7 0 30 12 0 8 0 0.24 0.14 15 L -1 -3 -3 -4 0 -3 -3 -2 -3 2 4 -3 2 1 -3 -2 0 0 -2 1 4 0 0 0 2 0 0 2 0 14 47 0 5 4 0 1 7 2 0 10 0.39 0.16 16 F -2 -2 -3 -4 1 -3 -1 -4 -2 -1 2 -3 0 6 -4 -1 -1 1 2 -2 2 2 0 0 3 0 5 0 0 0 19 1 1 47 0 4 5 2 6 0 0.67 0.24 17 W -1 -2 -1 -2 2 -1 -1 3 -2 -1 -2 -1 -2 0 -2 0 -1 7 3 -2 2 0 3 1 5 3 5 22 0 6 2 5 0 3 1 6 4 18 13 0 0.45 0.18 18 K -2 2 2 0 -5 1 1 -3 0 -3 -3 5 -3 -5 -1 -1 -1 -5 -4 -4 1 8 10 3 0 5 8 1 2 1 2 50 0 0 2 2 3 0 0 0 0.73 0.31 19 E -1 2 -2 -1 -4 2 2 -4 3 -3 -4 5 -2 -4 0 -1 -1 -4 -1 -1 3 9 0 1 0 10 14 0 7 1 0 37 1 0 5 2 3 0 2 4 0.56 0.29 20 E -1 -1 0 2 -5 3 4 -4 1 -3 -1 2 -1 -4 -3 0 -2 -5 -4 -2 3 1 3 9 0 13 33 0 4 1 6 14 1 0 0 7 1 0 0 2 0.53 0.29 21 M -1 -1 -4 -3 -4 -4 -4 -2 0 2 2 -3 3 5 -5 -2 -3 -3 2 1 6 4 0 2 0 0 0 2 3 11 15 1 10 25 0 2 1 0 6 10 0.48 0.26 22 E -4 2 -2 -2 -3 0 0 -5 1 -6 -6 7 -5 -7 -5 -2 -1 -7 -5 -6 0 10 1 2 1 3 6 0 3 0 0 68 0 0 0 2 4 0 0 0 1.53 0.62 23 L -4 -6 -6 -7 1 -6 -6 -7 -6 5 3 -6 -1 0 -6 -5 -4 -5 -3 4 0 0 0 0 3 0 0 0 0 34 29 0 1 4 0 0 0 0 0 29 1.16 0.48 24 T -2 -5 -5 -6 0 -5 -5 -1 -6 3 3 -5 -1 -3 -3 -4 -1 -5 -4 4 3 0 0 0 2 0 0 6 0 18 30 0 1 0 1 1 4 0 0 35 0.82 0.39 25 L -4 -6 -6 -6 1 -5 -6 -7 -6 4 4 -5 4 3 -6 -5 -1 -5 -3 3 0 0 0 0 2 0 0 0 0 23 33 0 11 10 0 0 3 0 0 17 0.96 0.43 26 V -3 -6 -7 -7 -3 -6 -6 -7 -6 5 4 -6 1 -2 -6 -5 -3 -6 -4 4 1 0 0 0 0 0 0 0 0 27 37 0 3 1 0 0 1 0 0 28 1.18 0.50 27 G -5 -7 -5 -6 -7 -7 -7 8 -7 -9 -9 -6 -8 -8 -4 -4 -6 -7 -8 -8 0 0 0 0 0 0 0 98 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 2.78 0.95 28 L -2 -5 -1 6 -6 -4 0 -5 -1 -2 4 -4 -3 -5 -1 -2 -4 -6 -2 -3 3 0 3 42 0 0 6 0 1 1 35 1 0 0 3 3 0 0 1 1 0.99 0.50 29 Q -1 -1 -1 4 -1 0 -1 2 -4 -4 -3 -3 -1 -5 -1 3 -1 -6 -2 -3 4 3 2 27 1 5 3 15 0 0 3 0 2 0 3 25 2 0 2 2 0.52 0.34 30 Y 2 -4 5 0 1 -4 -2 4 -4 -6 -4 -3 -5 -4 -5 1 -2 -6 -2 -5 14 0 27 4 3 0 2 32 0 0 1 1 0 1 0 11 2 0 2 0 0.85 0.44 31 S 3 -5 -5 -6 1 -5 -3 -4 -2 -2 -4 -3 -4 -5 -5 2 0 -6 -5 5 25 0 0 0 3 0 1 0 1 1 0 1 0 0 0 13 6 0 0 49 1.02 0.53 32 G -3 -7 -5 -6 -8 -7 -7 8 -7 -9 -9 -7 -8 -8 -7 -5 -7 -8 -8 -8 2 0 0 0 0 0 0 98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2.85 1.00 33 K -6 -3 -5 -6 -8 -4 -4 -7 -6 -8 -8 8 -7 -9 -6 -5 -6 -8 -7 -8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 3.01 1.10 34 T -4 -6 -5 -6 -6 -5 -5 -4 -6 -6 -6 -5 -6 -7 -6 4 7 -7 -6 -5 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 30 68 0 0 0 2.07 0.90 35 T 0 -3 0 -5 6 -3 -2 -5 -5 -3 -5 -4 -5 -6 -5 4 5 -7 -6 -2 6 1 4 0 14 1 2 0 0 1 0 0 0 0 0 34 35 0 0 2 1.18 0.61 36 F -5 -6 -7 -7 -5 -6 -6 -7 -6 4 5 -6 1 3 -6 -6 -2 -5 -2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25 55 0 2 10 0 0 2 0 1 5 1.27 0.54 37 V -1 -5 -6 -6 -2 -3 -6 -5 -6 2 5 -5 2 -1 -6 -3 0 -5 -4 2 5 0 0 0 1 1 0 1 0 10 55 0 5 2 0 1 5 0 0 13 0.95 0.45 38 N -1 0 3 -2 -2 0 -1 -3 3 0 0 0 0 0 -4 0 0 -2 3 -1 3 5 15 1 1 4 4 0 10 7 9 7 2 4 0 8 5 0 12 3 0.22 0.20 39 V -2 6 -2 -4 1 3 -2 -4 -1 -4 -3 2 2 -1 -5 -1 -3 -5 -2 0 2 42 1 0 3 11 1 1 1 0 2 12 5 2 0 5 1 0 1 8 0.82 0.45 40 I -5 -6 -5 -7 -6 -6 -6 -7 0 1 3 -6 -3 7 -7 -6 -5 -3 5 -2 0 0 1 0 0 0 0 0 2 8 31 0 0 39 0 0 0 0 17 2 1.45 0.60 41 A 1 -1 -2 -3 2 0 -2 -3 -1 1 -1 2 1 -3 -1 0 1 -4 -1 2 13 3 1 1 5 4 0 0 1 7 6 15 4 0 2 7 11 0 2 17 0.19 0.19 42 S -2 1 2 3 -3 1 1 -1 1 -4 -2 1 -2 -2 -2 1 1 -4 0 -3 0 7 9 16 0 6 9 4 3 0 4 10 0 1 1 12 10 0 4 1 0.27 0.21 43 G -1 -1 4 3 -5 -1 0 4 0 -5 -5 0 -5 -4 -1 -1 -2 -5 -4 -4 5 3 21 17 0 2 5 28 2 0 1 7 0 1 3 3 1 0 1 1 0.65 0.37 44 Q 0 3 -2 0 -5 2 4 -4 1 -2 -4 2 -1 -5 -2 1 1 -5 -3 -3 7 14 1 4 0 9 25 1 3 2 1 11 1 0 1 10 9 0 0 1 0.46 0.33 45 F -2 -5 -4 -2 -5 -3 -5 -6 -1 0 -1 -5 0 8 -3 -3 -3 -2 2 1 3 0 1 3 0 1 0 0 1 5 6 1 2 57 2 2 1 0 5 9 1.36 0.57 46 S 0 -1 0 1 -1 -1 0 -1 0 -1 -2 -1 -2 -3 2 2 1 -4 -3 1 9 3 5 7 1 2 7 4 2 3 3 2 1 0 11 16 10 0 1 15 0.18 0.18 47 E -2 -1 0 0 -4 2 3 -2 2 -3 -2 2 -1 -4 1 0 2 -4 -2 -2 2 2 4 5 0 9 22 3 6 1 3 11 1 0 6 6 13 0 1 3 0.31 0.24 48 D -1 -1 2 3 -1 1 1 -1 1 -2 -2 1 -3 -2 0 1 1 -3 0 -1 2 2 9 16 1 5 10 4 4 1 3 10 0 1 3 10 9 0 4 4 0.20 0.16 49 M -3 -3 -3 -5 -1 -1 -2 -4 2 0 0 -3 2 1 -2 1 1 -3 6 -1 1 1 0 0 2 3 2 1 5 6 10 1 5 4 2 10 10 0 31 4 0.57 0.36 50 I -1 -1 0 0 1 1 0 -3 -2 3 -1 1 -1 -1 -2 -1 0 -4 -2 2 5 3 4 6 3 6 5 1 1 20 5 11 1 2 1 4 6 0 1 15 0.13 0.15 51 P 2 -4 -3 -5 -4 -2 -5 -4 1 -3 -5 -4 -4 -6 7 2 -1 -7 -6 -3 14 1 1 0 0 2 0 1 3 1 0 0 0 0 54 14 4 0 0 1 1.47 0.67 52 T -5 -6 -1 -6 -6 -5 -6 -4 -6 -4 -5 -5 -3 -7 -4 0 8 -7 -6 -5 0 0 2 0 0 0 0 1 0 1 1 0 1 0 1 7 87 0 0 0 2.28 0.97 53 V -2 -5 -3 -5 -4 1 -5 -4 -3 6 1 -2 -1 -2 -3 -5 -2 1 -4 4 2 0 1 0 0 6 0 1 1 42 11 3 1 1 2 0 2 2 0 24 0.87 0.44 54 G -3 -3 -1 -3 -3 -3 0 7 2 -7 -3 -3 -6 -1 -6 -2 -3 -6 -3 -6 1 1 2 1 1 1 7 69 5 0 3 1 0 3 0 2 2 0 1 0 1.44 0.63 55 F -2 -5 -1 0 -5 -4 -2 -4 -1 1 -3 -5 -3 7 1 -1 -2 -4 0 2 3 0 3 5 0 0 3 1 1 9 1 0 0 44 8 5 2 0 2 13 0.90 0.46 56 N -1 -3 4 2 -2 -1 0 -2 -1 -3 -2 -1 -1 -1 -4 1 1 -5 -1 -1 4 0 25 13 1 2 7 3 1 0 5 4 1 3 0 13 10 0 2 5 0.37 0.27 57 M 0 -1 -2 -4 0 -1 -4 -4 -2 1 0 -2 1 3 -4 1 1 -3 3 2 6 3 2 0 2 2 0 0 1 8 8 2 3 14 0 10 11 0 11 17 0.31 0.24 58 R -2 3 -1 -3 -5 0 3 -3 1 -2 -2 3 -2 -3 -1 -1 1 -5 -1 0 2 16 2 0 0 4 20 2 3 2 3 21 1 1 2 4 9 0 2 6 0.41 0.30 59 K -2 1 1 -1 -2 1 3 -2 0 -2 -3 2 -1 -5 1 0 3 -5 -2 -1 1 6 5 3 1 5 18 3 2 2 2 13 1 0 6 6 21 0 1 5 0.31 0.26 60 V -3 -4 -3 -6 -4 -2 -5 -4 -6 4 2 -1 0 0 -6 -2 -2 -1 -4 5 0 0 1 0 0 2 0 1 0 25 19 4 1 3 0 3 2 1 0 36 0.83 0.43 61 T -1 -1 1 2 -2 0 2 -2 -1 1 -1 -1 0 -2 -1 0 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