Contact Molecules for Homologous Proteins


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seq_id(%): [0] [30] [40] [50] [60] [70] [80] [90] [95] [100]
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PID QueryLength Homolgous Sequence in PDB UniProt Query TITLE
15960 98 0 P59636(ORF9B_SARS) RecName: Full=ORF9b protein;AltName: Full=Accessory protein 9b;AltName: Full=ORF-9b;AltName: Full=Protein 9b;
QUERYSEQ
MDPNQTNVVPPALHLVDPQIQLTITRMEDAMGQGQNSADPKVYPIILRLGSQLSLSMARRNLDSLEARAFQSTPIVVQMTKLATTEELPDEFVVVTAK
[BLAST file for PDB] (plain) (bar) (multiple alignment) [BLAST for UniProt: (plain) (bar) (multiple alignment) (PSSM file) ]
  [n]:site number of query sequence.  [a]:amino acid of query sequence.  [s]:predicted secondary structure.
  [e]:predicted exposed/buried.  [acc]:predicted relative accesssibility(%).  [pdb]:PDB code of homologous structure.
  [contact_mols]:predicted binding molecules  [observed aa]:Observed amino acids among homologous sequences.  [feature table]:UniProt Feature Table
  [variant]:UniProt Human Variant.
n a s e acc pdb contact_mols observed aa feature table variant
1M----
M
DISORDER predicted by DISOPRED
2D----
D
DISORDER predicted by DISOPRED
3P----
P
DISORDER predicted by DISOPRED
4N----
NLAGSEKTVDIPRFQYCHMW
DISORDER predicted by DISOPRED
5Q----
KQ
6T----
TIV
7N----
SN
8V----
VE
9V----
VM
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
10P----
PHL
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
11P----
P
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
12A----
A
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
13L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
14H----
HR
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
15L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
16V----
V
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
17D----
D
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
18P----
P
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
19Q----
Q
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
20I----
I
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
21Q----
Q
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
22L----
LM
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
23T----
TA
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
24I----
IVT
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
25T----
TI
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
26R----
R
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
27M----
M
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
28E----
E
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
29D----
DN
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
30A----
A
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
31M----
VM
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
32G----
VG
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
33Q----
HRQ
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
34G----
GD
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35Q----
Q
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
36N----
NS
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
37S----
NS
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
38A----
AV
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
39D----
GDV
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
40P----
PL
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
41K----
K
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
42V----
V
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
43Y----
Y
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
44P----
P
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
45I----
I
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
46I----
I
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L
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48R----
R
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L
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G
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S
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52Q----
QP
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53L----
L
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54S----
S
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55L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
56S----
SN
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
57M----
M
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
58A----
AV
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
59R----
RK
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
60R----
RK
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
61N----
NT
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
62L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
63D----
DN
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
64S----
S
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
65L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
66E----
E
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
67A----
ADV
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
68R----
RK
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
69A----
AV
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
70F----
F
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
71Q----
Q
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
72S----
SL
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
73T----
T
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
74P----
P
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
75I----
I
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
76V----
VA
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
77V----
V
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
78Q----
KQ
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
79M----
M
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
80T----
T
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
81K----
K
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
82L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
83A----
A
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
84T----
T
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
85T----
T
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
86E----
E
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
87E----
E
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
88L----
L
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
89P----
P
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
90D----
D
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
91E----
E
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
92F----
F
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
93V----
V
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
94V----
V
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"
95V----
V
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96T----
T
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97A----
AV
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98K----
K
DOMAIN /note="9b" DOMAIN /note="9b"