Contact Molecules for Homologous Proteins


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PID QueryLength Homolgous Sequence in PDB UniProt Query TITLE
2715 75 30 P0DTC4(VEMP_SARS2) RecName: Full=Envelope small membrane protein ; Short=E; Short=sM protein ;
QUERYSEQ
MYSFVSEETGTLIVNSVLLFLAFVVFLLVTLAILTALRLCAYCCNIVNVSLVKPSFYVYSRVKNLNSSRVPDLLV
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  [n]:site number of query sequence.  [a]:amino acid of query sequence.  [s]:predicted secondary structure.
  [e]:predicted exposed/buried.  [acc]:predicted relative accesssibility(%).  [pdb]:PDB code of homologous structure.
  [contact_mols]:predicted binding molecules  [observed aa]:Observed amino acids among homologous sequences.  [feature table]:UniProt Feature Table
  [variant]:UniProt Human Variant.
n a s e acc pdb contact_mols observed aa feature table variant
1M----
M
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PS
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F
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5V----
V
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QSH
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7E----
E
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QEDR
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9T e108.4 2mm4_A
TI
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GA
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FLYI
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13ISe 88.9 2mm4_A homo
IV
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VG
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NQ
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VAS
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IV
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Y
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71PSe 96.9 7ntk_E hetero MPP5_HUMAN AFAD_HUMAN LNX2_HUMAN
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72D e 81.5 7ntk_E hetero MPP5_HUMAN AFAD_HUMAN PALS1_HUMAN LNX2_HUMAN
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L
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L
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75V e138.0 7ntk_E hetero MPP5_HUMAN AFAD_HUMAN PALS1_HUMAN LNX2_HUMAN precipitant
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