HOMCOS:タンパク質に対する結合分子の検索

入力したタンパク質と類似したタンパク質群と複合体を形成している他の分子のリストを作成します。相互作用する可能性のある分子とその結合部位を予測します。

アミノ酸配列は、タンパク質配列データベースのID、１文字表記のアミノ酸配列、[PDB_ID]+[CHAIN_ID]、PDBファイルのアップロードのどれかの方法で入力してください。

タンパク質配列のID
(UniProt:ID/AC, INSDC/RefSeq:protein_id) (CDK3_HUMAN, Q00526, AAV40830.1, NP_001249.1)

アミノ酸配列 (一文字表記)

PDB PDB_ID:(1fin, 4hhb,...) CHAIN_ID:(A, B, ...)

PDBファイルのアップロード

変異の影響を推定するために部位ごとのアミノ酸頻度を計算する ("no"を選ぶと計算時間が短くなります。): no yes
事前に計算されたBLASTの結果やPSSMの使用: no yes

アミノ酸配列の相同性検索にはBLASTを用いています。
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タンパク質配列のID (UniProt:ID/AC, INSDC/RefSeq:protein_id)	(CDK3_HUMAN, Q00526, AAV40830.1, NP_001249.1)
アミノ酸配列 (一文字表記)
PDB	PDB_ID:(1fin, 4hhb,...) CHAIN_ID:(A, B, ...)
PDBファイルのアップロード