Protein Model on 5amc_A_1_O_1 (TEMPLATE: 5amc )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[sequence-replaced 3D model] [for PyMOL]
[3D template]
[Modeller script]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query A)
1 a A(ACE2_HUMAN) A 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [607 aa] ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME :ACE_HUMAN
2 b O 1 (A) non-polymer(PEG) DI(HYDROXYETHYL)ETHER 243Y(F) 246A(R) 247K(A) 250N(R) 281L(M) 282T(V) 283V 602S(N) (identity: 12.5 %/43.3 %)
ALIGNMENTS
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5amc_A_1 identity=43.3%
queryA        25:AKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLA-QMY-PL-QEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILN: 121
                :*  *       **    **  ***   **** **      *      *       *   * *  *            *    **  *   *    *  * :
5amc_A_1      17:AQLFAQSYQSSAEQVLFQSVAASWAHDTNITAENARRQEEAALLSQEFAEAWGQKAKELYEPIWQQFTDPQLRRIIGAVRTLGSANLPLAKRQQYNALLS: 116
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTGGG S HHHHHHHHHHT  GGGGS HHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :beebbeebeebbeebeeeebebebebbbebeeebbeebeebbeeebebeeebbebbeebbeeebeebeeeebeebbbebbbbbbbbbeeeebeebbebeb:    

queryA       122:TMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQ: 221
                : ** **** ***       *  * * *  * * *  *   * *** *    *  * ****    * **        * * ***  *              :
5amc_A_1     117:QMSRIYSTAKVCLXXXTATCWSLDPDLTNILASSRSYAMLLFAWEGWHNAAGIPLKPLYEDFTALSNEAYKQDGFTDTGAYWRSWYNSPTFE--------: 208
SecStr          :HHHHHHHH EEE ---   EEETTTHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTT SSHHHHHHHTT  TTHH--------:    
ExpBur          :ebbebbbbbebee---eeeeebbbeebeebbbeeeebeebbebbeebbeebbeebbeebeebbebbbebbeebeeebbbbbbeeebeeeebe--------:    

queryA       222:LIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAY-PSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGL: 320
                :   * **      ***  *** **  *   *   **   *  *********   * * *   ***  *** ***  *  * * *   *  ** ** *  *:
5amc_A_1     209:--DDLEHLYQQLEPLYLNLHAFVRRALHRRYGDRYINLRGPIPAHLLGDMWAQSWENIYDMVVPFPDKPNLDVTSTMLQQGWQATHMFRVAEEFFTSLEL: 306
SecStr          :--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTT  TTS EETTSSSSTTS   GGGHHHH S TTS    THHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHHHTT :    
ExpBur          :--eebeebbeebeebbebbbbbbbebbbeebeeebbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbebbebbbbeeeebebebbeebeeeebebeebbeebbebbebbeb:    
Contact         :                     b  bb  b                               bbb                                     

queryA       321:PNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDL-GKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLK: 419
                :  *   *** ***  *      ***  ***     ****  ** ****   * *********   *   *  ** *** ***** *    **  ** ** :
5amc_A_1     307:SPMPPEFWEGSMLEKPADGREVVCHASAWDFYNRKDFRIKQCTRVTMDQLSTVHHEMGHIQYYLQYKDLPVSLRRGANPGFHEAIGDVLALSVSTPEHLH: 406
SecStr          :    HHHHHH B S  TT      S EEEE SSSS EEEE    SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHH:    
ExpBur          :eebeeebbeebbbeebeeeeebbbebebbbbeeeeebebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbeeeebbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbe:    

queryA       420:SIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRT: 519
                : ****      * *  ** *** **     *** *    *** ** *  *       **       *   **   **  *    *** *    ***    :
5amc_A_1     407:KIGLLD-RVTNDTESDINYLLKMALEKIAFLPFGYLVDQWRWGVFSGRTPPSRYNFDWWYLRTKYQGICPPVTRNETHFDAGAKFHVPNVTPYIRYFVSF: 505
SecStr          :HTTS  -    SHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHHHHHHHHHHTSS GGGHHHHHHHHHHHHH EE SS   TT  GGGGSTTTTTT   HHHHHHH:    
ExpBur          :eeebbe-eeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbeeebeeeebbebbbebbbebbbbbbbbebeeebbbbbbbbbbbebebbbbbbbbb:    

queryA       520:LYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNS--FVGWST-DWSP: 612
                :  **** ****  *  ***** ***  ** ** **   ** * * **   *   **       *** **     **  **       **    * *:
5amc_A_1     506:VLQFQFHEALCKEAGYEGPLHQCDIYRSTKAGAKLRKVLRAGSSRPWQEVLKDMVGLDALDAQPLLKYFQLVTQWLQEQNQQNGEVLGWPEYQWHP: 601
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHTT  S GGG   TT HHHHHHHHHHHHHTTSS HHHHHHHHHS SS  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT  SS S TT   :    
ExpBur          :bbbbbbbebbbeeeeeeeebbebbbbebeebbebbeebbebbbbeebeebbeebeeeeebebebbbebbeebeebbeeebeeeebeebbeeeeeeb:    
Contact         :                                                                                  b                 


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123