Protein Model on 1o8a_A_1_G_1 (TEMPLATE: 1o8a )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[sequence-replaced 3D model] [for PyMOL]
[3D template]
[Modeller script]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query A)
1 a A(ACE2_HUMAN) A 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [575 aa] ANGIOTENSIN CONVERTING ENZYME :ACET_HUMAN
2 b G 1 (A) non-polymer(NAG) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 578N (identity: 100.0 %/43.4 %)
ALIGNMENTS
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:1o8a_A_1 identity=43.4%
queryA        22:EEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILN: 121
                :*  *  *                 * ******** *                    * *        ** * *      *      *        * ** :
1o8a_A_1       5:EAEASKFVEEYDRTSQVVWNEYAEANWNYNTNITTETSKILLQKNMQIANHTLKYGTQARKFDVNQLQNTTIKRIIKKVQDLERAALPAQELEEYNKILL: 104
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG   HHHHHHHHHHT  GGGGS HHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeebeebbeebeeebeebbeeebbbebebbbebeeebbeebeeebeebbebeeebbeebeebebeebeeeebebbbeebebbeebbbeeeebeebbebbb:    

queryA       122:TMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQ: 221
                : * * **   ** *     ** *** *   ** *  *   ***** **   *      *  ** * *  ** * * * ** **  **             :
1o8a_A_1     105:DMETTYSVATVCHPNG--SCLQLEPDLTNVMATSRKYEDLLWAWEGWRDKAGRAILQFYPKYVELINQAARLNGYVDAGDSWRSMYETPSLE--------: 194
SecStr          :HHHHHHHT EEE SSS-- EEETTTHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHTHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHTTT SSHHHHHHGGG  TTHH--------:    
ExpBur          :ebbeebbebebeeeee--eebebeeebeeebbebeebeebbebbbbbbeebbeebeebbeebbebbbbbbeebeeebbbebbbeebebeebe--------:    

queryA       222:LIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPS-YISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGL: 320
                :   * *  * *  ***  ******  *   *    *   *  ****** **   * * * * ***   *  * * **  * *   * ****  ** * **:
1o8a_A_1     195:--QDLERLFQELQPLYLNLHAYVRRALHRHYGAQHINLEGPIPAHLLGNMWAQTWSNIYDLVVPFPSAPSMDTTEAMLKQGWTPRRMFKEADDFFTSLGL: 292
SecStr          :--HHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TTT  TTS EETTSSSSTTSS  GGGHHHH S TTS    HHHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHHHTT :    
ExpBur          :--eebeebbeebbebbbbbbbbbbebbeeebeeeebeeebebbbbbbbbbbbbbbbebbebbbbeeebeeeebeebbeeeebebeebbeebbebbebbeb:    

queryA       321:PNMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKG-DFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLK: 419
                :      **  ***  *      ***  ***   * ****  ** *   *   ********** * *   *  ** *** ***** *    **  ***** :
1o8a_A_1     293:LPVPPEFWNKSMLEKPTDGREVVCHASAWDFYNGKDFRIKQCTTVNLEDLVVAHHEMGHIQYFMQYKDLPVALREGANPGFHEAIGDVLALSVSTPKHLH: 392
SecStr          :    HHHHHH B S   SS     S EEEE SSSS EEEE    SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHHSHHHHH:    
ExpBur          :eebeeebbeebbbeebeeeeebbbebebbbbeebebbbbbbbbebbbebbeebbbbbbbbbbbbbbeeeebbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbe:    

queryA       420:SIGLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRT: 519
                :*  ***     * *  **** * **      ** *    *** ** * * *      **       *   ***      **   **       ***    :
1o8a_A_1     393:SLNLLSXXXXSD-EHDINFLMKMALDKIAFIPFSYLVDQWRWRVFDGSITKENYNQEWWSLRLKYQGLCPPVPRTQGDFDPGAKFHIPSSVPYIRYFVSF: 491
SecStr          :HTTS  ---- H-HHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHTTSS TTTHHHHHHHHHHHHH EE SS   TT  GGGGSTTTTTT   HHHHHHH:    
ExpBur          :ebebbe----ee-eeebbbbbebbbebbbbbbbbbbbbbbbbebbeeebeeeebbeebbebbeebbbbeeeeebeeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbb:    

queryA       520:LYQFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNK--NSFVGW: 606
                :  **** ******* * ********  * **** *     ** * **  *     *  **     * ** **  **   *       **:
1o8a_A_1     492:IIQFQFHEALCQAAGHTGPLHKCDIYQSKEAGQRLATAMKLGFSRPWPEAMQLITGQPNMSASAMLSYFKPLLDWLRTENELHGEKLGW: 580
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHTT  S GGG   TT HHHHHHHHHHHHTTTSS HHHHHHHHHSS S  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT   S :    
ExpBur          :bbbbbbbebbbebeeeeeebbebebeebeebbeebbebbeebbeeebeebbeebbeeeebebebbeebbeebbebbeebbeeeebeebb:    
Contact         :                                                          b                                         


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123