Protein Model on 8gpb_A_1_D_1 (TEMPLATE: 8gpb )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [832 aa] GLYCOGEN PHOSPHORYLASE B :PHS2_RABIT
2 b D 1 (A) non-polymer(AMP) ADENOSINE MONOPHOSPHATE 282N 283D 285F 287E 611P 612G 613Y
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:8gpb_A_1
8gpb_A_1       1:XXXXXXXXXXKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMV: 100
SecStr          :----------   SSS    HHHHHHHHHHHHHHHHHTT   TTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE S EEEE  HHHHHH:    
ExpBur          :----------eeebebbeeeeeebeebeebbeebbeeebeeeeeebeeebbbbbbbbbbbeebebebeebeeebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

8gpb_A_1     101:NLALENACDEATYQLGLDMEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKICGGWQMEEADDWLRYGNPWEKARPEFTLPV: 200
SecStr          :HHT HHHHHHHHHHTT  HHHHHTT   EEES SHHHHHHHHHHHHHHHTT  EEEEEE  SB S EEEEETTEEEEE   TTTT  TT EE GGG EEE:    
ExpBur          :bbebbbbbeebbeebebebeebbeebebbbbbbeebbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbeebbbebebeebebeeeebebbeeeebbbeeeeeeebeb:    

8gpb_A_1     201:HFYGRVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVNTMRLWSAKAPNDFNLKDFNVGGYIQAVLDRNLAENISRVLYPNDNFFEGKELRLKQEYFVV: 300
SecStr          :EEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE SSSS EEEEEEEEEE  SSTTTTTT  S HHHHHHTHHHHHGGGTB    SS     HHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeeebeeeeeebebbebeebebbbbbbbbbbbebebbbbbbbbbbebbeeeeeeeeeeeeeeebeeeeeebbebbeebbebbeebeeeeebbbbbbbbb:    
Contact         :                                                                                 bb b b             

8gpb_A_1     301:AATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRVLVDLERLDWDKAWEVTVKTCAYTNHTVIPEALERWPVHLLETLLPRHL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHTSSTTT  TTS   TTHHHHEEEEEESSTTTTHHHHHHHHHHHTS   HHHHHHHHHHHEEEE     GGGS EEEHHHHHHH HHHH:    
ExpBur          :bbbbebbbebbeebebeeeeeeeeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeebebeebbebbbebbbbbbbbebeebebebbbebbeebbbbbb:    

8gpb_A_1     401:QIIYEINQRFLNRVAAAFPGDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKFQNKTNGITPRRWLVLCNPGLA: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHSTT HHHHHHH SEE SSS EEEHHHHHHHH S EEESSHHHHHHHHHTTTHHHHHH GGGEEE    B TIIIIIIT HHHH:    
ExpBur          :ebbeebbeebbeebeeeeeeeeebeeebbbbeeeeeeebbbbbbbbbbbebbbbbbeebbeebbeeebebbeebbeebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

8gpb_A_1     501:EIIAERIGEEYISDLDQLRKLLSYVDDEAFIRDVAKVKQENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKKEPNKFVVP: 600
SecStr          :HHHHHHH SGGGS GGGGGGGGGGSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     TTSEEEEEES   TTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTS    :    
ExpBur          :ebbbeebeeebbeebebbeebeeebeeeebbeebeebbeebbeebbebbeeeeeeebbeebbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbebeeeeeeeebe:    

8gpb_A_1     601:RTVMIGGKAAPGYHMAKMIIKLITAIGDVVNHDPVVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMA: 700
SecStr          :EEEEEE    TT HHHHHHHHHHHHHHHHHTT TTTGGGEEEEEETT  HHHHHHHTTT SEEEE   TTSS   SHHHHHHHTT EEEE S TTHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbeeeebbebbbbbbbbbbeebeebeebeeebbbbbbebbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbebbbbebbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbb:    
Contact         :          bbb                                                                                       

8gpb_A_1     701:EEAGEENFFIFGMRVEDVDRLDQRGYNAQEYYDRIPELRQIIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEEYVKCQERVSALYKNPREWTRM: 800
SecStr          :HHH GGGSEE S  HHHHHHHHHH   SHHHHHH HHHHHHHHHHHHTTT TTSTTTTHHHHHHHHH  TT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHH:    
ExpBur          :eebbeebbbbbbbeeeebeebeeeebebeebbeebeebeebbebbeebebbeeeeebbeebbebbbeebebbbbbbbeebbebbeebbeebeeeeebbbb:    

8gpb_A_1     801:VIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPAPDEKIP----------------------------------------------------------: 842
SecStr          :HHHHHTTGGGGBHHHHHHHHHHHTT                -:    
ExpBur          :bbebbbbbbbbbbbbbbbebbeebbebeeeeeebebeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123