[pdbjlvh2]Protein Model on 5ikp_A_1_C

Protein Model on 5ikp_A_1_C_1 (TEMPLATE: 5ikp )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description	a(query F)
1	a	F	A 1 (A)	polymer(polypeptide(L)) [806 aa]	Glycogen phosphorylase, brain form :PYGB_HUMAN
2	b		C 1 (A)	non-polymer(AMP)	ADENOSINE MONOPHOSPHATE	72I 75Q 76Q 79Y 200Y 313R 314R

FOCUSED TEMPLATE

MODEL[1] TEMPLATE:5ikp_A_1

5ikp_A_1       1:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLGDVAEVRKSFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYFFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYERDPKRIYYLSLEFYMGRTLQ: 100
SecStr          :------------------------ HHHHHHHHHHHHHHHHTS   TTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT   EEEEE S    B  HH:    
ExpBur          :------------------------eeebeebeebbeebbeeeeeeeeeebeeebbbbbbbbbbeeebeebbeebeebbeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                                                                       b  bb  b                     

5ikp_A_1     101:NTMVNLGLQNACDEAIYQLGLDLEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKIVNGWQVEEADDWLRYGNPWEKARPEY: 200
SecStr          :HHHHTTTTHHHHHHHHHTTT  HHHHHHHS  BTT  SHHHHHHHHHHHHHHHTT  EEEEEE  SS S EEEEETTEEEEE   TTSS  SS EE GGG:    
ExpBur          :bbbbbbebeebbeebbeebebebeebbeebebbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbbbbebeebebeeeebebbeeeebbbeeeeee:    
Contact         :                                                                                                   b

5ikp_A_1     201:MLPVHFYGRVEHTPDGVKWLDTQVVLAMPYDTPVPGYKNNTVNTMRLWSAKAPNDXXXXDFNVGDYIEAVLDRNLAENISRVLYPNDXXFEGKELRLKQE: 300
SecStr          : EEEEES EEEE SS EEEES EEEEEEEEEEEEE SSSS EEEEEEEEEE    ----   HHHHHHHHHHHHHHHTTTT SS   --   HHHHHHHH:    
ExpBur          :ebebebbeeeeeeeeebebeeeeebbbbbbbbbbbbbebebbbbbbbbbbebeee----eeeeeeeeeeeeeeeebebbbeebbbee--eebebbebbbb:    

5ikp_A_1     301:YFVVAATLQDIIRRFKSSKFXXXXXXXTCFETFPDKVAIQLNDTHPALSIPELMRILVDVEKVDWDKAWEITKKTCAYTNHTVLPEALERWPVSMFEKLL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHTS  -------  TTSHHHHEEEEEESSTTTTHHHHHHHHHHHTS   HHHHHHHHHHHEEEEE S STTSS EEEHHHHHHH :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbebbeebee-------eebeebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeebebeebbebbeebbbbbbbebeeeebbebbbebbeebb:    
Contact         :            bb                                                                                      

5ikp_A_1     401:PRHLEIIYAINQRHLDHVAALFPGDVDRLRRMSVIEEGDCKRINMAHLCVIGSHAVNGVARIHSEIVKQSVFKDFYELEPEKFQNKTNGITPRRWLLLCN: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTT HHHHHHH SEE SSS EEEHHHHHHHT SEEEESSHHHHHHHHHTTTHHHHHH TTTEEE    B TIIIIIIT :    
ExpBur          :bbbbebbeebbeebbeebeeeeeeeeebeeebbbbeeeeeeebbbbbbbbbbbebbbbbbeebbeebbeebbebbeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbb:    

5ikp_A_1     501:PGLADTIVEKIGEEFLTDLSQLKKLLPLVSDEVFIRDVAKVKQENKLKFSAFLEKEYKVKINPSSMFDVHVKRIHEYKRQLLNCLHVVTLYNRIKRDPAK: 600
SecStr          :HHHHHHHHHHH GGGGT GGGGGGGGGGGS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     TTSB EEEES   GGGTHHHHHHHHHHHHHHHHH TTS:    
ExpBur          :eebbebbeeeeeeebbeebebbeebeebbeeeebbeebeebbeebbeebbebbeeeeebebbeebbbbbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeeee:    

5ikp_A_1     601:AFVPRTVMIGGKAAPGYHMAKLIIKLVTSIGDVVNHDPVVGDRLKVIFLENYRVSLAEKVIPAADLSQQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGAN: 700
SecStr          :    B EEEE    TT HHHHHHHHHHHHHHHHHTS TTTTTS  EEEESS  HHHHHHHGGG SEEEE   TTT S  SHHHHHHHTS EEEEEESTHH:    
ExpBur          :ebbebbbbbbbbbeeebebbebbbbbbbbbbebbbeeeebeeebbbbbbebbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbebbbb:    

5ikp_A_1     701:VEMAEEAGAENLFIFGLRVEDVEALDRKGYNAREYYDHLPELKQAVDQISSGFFSPKEPDCFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEAYMQCQAQVDQLYRNPKE: 800
SecStr          :HHHHHHHTGGGSEEEEEEHHHHHHHHHH   SHHHHTT SHHHHHHHHHHHTSS SSSTTTTHHHHHHHHT  SS SGGGHHHHHHHHHHHHHHHHSHHH:    
ExpBur          :bbbbeebeeebbbebeeeeeebeebeeeeeebeebbeeeeebeebbebbeebebbeeeeebbeebbebbbeebeebbbbbbeebbebbeebbebbeeeee:    

5ikp_A_1     801:WTKKVIRNIACSGKFSSDRTITEYAREIWGVEPSDLQIPPPNI---------------------------------------------------------: 843
SecStr          :HHHHHHHHHHHGGGGBHHHHHHHHHHHTS   TTSS      -:    
ExpBur          :bbebbbebbbbbbebbbbbbbbebbeebbebebeebebeeee-:

Protein Model on 5ikp_A_1_C_1 (TEMPLATE: 5ikp )

Input Residue Numbers for Focused Sites