[pdbjlvh2]Protein Model on 4ff4_A_1_E

Protein Model on 4ff4_A_1_E_1 (TEMPLATE: 4ff4 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description	a(query F)
1	a	F	A 1 (A)	polymer(polypeptide(L)) [1095 aa]	Virion RNA polymerase :Q859P9_BPN4
2	b		E 1 (A)	non-polymer(AMP)	ADENOSINE MONOPHOSPHATE	436R 575N 576G 577P 682K 683N 686T 687I 690Y 963D

FOCUSED TEMPLATE

MODEL[1] TEMPLATE:4ff4_A_1

4ff4_A_1       1:XXXXXXXXXXXXXXXXXEELKEGIDAVYPSLVGTADSKAEGIKNYFKLSFTLPEEQKSRTVGSEAPLKDVAQALSSRARYELFTEKETANPAFNGEVIKR: 100
SecStr          :----------------- HHHHHHHHHSTTBSSBS TT SS B HHHHHEE  SS  BTTTT S HHHHHHHHTT HHHHHHHTT S   TT  HHHHHH:    
ExpBur          :-----------------eeeeeebeeebeebbeebeeebeebbbbbbbbbbeeeeeebbbeebebbbeebeebbeeeeebeeebeeeebbebbeeebbee:    

4ff4_A_1     101:YKELMEHGEGIADILRSRLAKFLNTKDVGKRFAQGTEANRWVGGKLLNIVEQDGDTFKYNEQLLQTAVLAGLQWRLTATSNTAIKDAKDVAAITGIDQAL: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGHHHHHHTT  GGGSTT GGGGGEEEETTEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHSGGG     HHHHHHHHT  GGG:    
ExpBur          :beebbeebeebbeebeebbeebbeeeebbeebeeeeebbbeebbbbbbbbbeeeeebebbebbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebeeeebbeebebeeee:    

4ff4_A_1     201:LPEGLVEQFDTGMTLTEAVSSLAQKIESYWGLSRNPNAPLGYTKGIPTAMAAEILAAFVESTDVVENIVDMSEIDPDNKKTIGLYTITELDSFDPINSFP: 300
SecStr          :  TTHHHHHHHSEEHHHHHHHHHHHHHHHHT EE TTSBHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHTTSEEEEEEEGGGT TT   EEEEEEE    TT GGGGST:    
ExpBur          :bebbbeeebbebbbbebbbeebbebbbebbbbeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeebbeeeebebeeeeeebeeebbbbebeeeeeebebebbb:    

4ff4_A_1     301:TAIEEAVLVNPTEKMFFGDDIPPVANTQLRNPAVRNTPEQKAALKAEQATEFYVHTPMVQFYETLGKDRILELMGAGTLNKELLNDNHAKSLEGKNRSVE: 400
SecStr          :THHHHHHBSS SS  EETT      SEETTEEEEE  HHHHHHHHHHHH  BEE HHHHHHHHHH HHHHHHHHS  S  TTSS HHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbeeeebebbbeeeebeeeeebbebeebebbeebeebbeebbebebebbebbbebbeebebeebbebbbebebeeeebbebbbeebebebbebe:    

4ff4_A_1     401:DSYNQLFSVIEQVRAQSEDISTVPIHYAYNMTRVGRMQMLGKYNPQSAKLVREAILPTKATLDLSNQNNEDFSAFQLGLAQALDIKVHTMTREVMSDELT: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHH S GGG  EE  EEE TTS EEESSSSSTTT HHHHTTEES  EEE  SSTTSHHHHHHHHHHHHHTT  GGGS HHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbeebbbbbebbeeeeeebeebebbbbbbbbebbebebeebbbbbebebbbbbbbbbebebebeeeeeeebbbbbbbbbebbebebebbebeebeeebe:    
Contact         :                                   b                                                                

4ff4_A_1     501:KLLEGNLKPAIDMMVEFNTTGSLPENAVDVLNTALGDRKSFVALMALMEYSRYLVAEDKSAFVTPLYVEADGVTNGPINAMMLMTGGLFTPDWIRNIAKG: 600
SecStr          :HHHHTTTHHHHHHHHHHHHHS   TTHHHHHHHHHGGG SHHHHHHHHHHHHHHT S GGGEEE  EEEEEESSHHHHHHHHHH  SS  HHHHHHHHTT:    
ExpBur          :ebbeeebeebbebbeebeeeeebeeebbebbeebbeeeeebebbbbbbbbbebeebeeeeebebbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbeebeeebbebbbbb:    
Contact         :                                                                          bbb                       

4ff4_A_1     601:GLFIGSPNKTMNEHRSTADNNDLYQASTNALMESLGKLRSNYASNMPIQSQIDSLLSLMDLFLPDINLGENGALELKRGIAKNPLTITIYGSGARGIAGK: 700
SecStr          :TEEES TT  HHHHHHHT    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTT HHHHHHHHHHHHHHHHH TTEEE TT  EEE THHHHHHHHHHHTT  HHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbeeebbbbebbeeeeeebbbbbbbebbeebbeebeeebeeeeebbebbebbbbbbbbbbeebeeeeeeeeebeeebbeebbebbbbeeebeebbbe:    
Contact         :                                                                                 bb  bb  b          

4ff4_A_1     701:LVSSVTDAIYERMSDVLKARAKDPNISAAMAMFGKQAASEAHAEELLARFLKDMETLTSTVPVKRKGVLELQSTGTGAKGKINPKTYTIKGEQLKALQEN: 800
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS TT  HHHHHHTTT SSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEETTEEEEEE S    S   TTT    HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbeebbebbbebbbbbbeeeeeeeeeeebebbbeeeeeeeeebeebbeebeebbebbbebbbbeeeeebeeeeeebeeeeeeebeebebeeeebebbbeb:    

4ff4_A_1     801:MLHFFVEPLRNGITQTVGESLVYSTEQLQKATQIQSVVLEDMFKQRVQEKLAEKAKDPTWKKGDFLTQKELNDIQASLNNLAPMIETGSQTFYIAGSENA: 900
SecStr          :HHHHTHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT TT  TTS  BHHHHHHHHHTTGGG   EE SS EE TTEEEES:    
ExpBur          :bbbbbbebbeebbeebbeeebeebbebbbebbbbbbbbbbbbbeeebeeebeebeeeeebeeebbbbeebbeebbeebeebbbebeeebbbbbbbbeebe:    

4ff4_A_1     901:EVANQVLATNLDDRMRVPMSIYAPAQAGVAGIPFMTIGTGDGMMMQTLSTMKGAPKNTLKIFDGMNIGLNDITDASRKANEAVYTSWQGNPIKNVYESYA:1000
SecStr          :TTT SEEE  TTS S EE  EEEE   TTTHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHSTT   S EE SSEEEEETTSHHHHHHHHHHHHHHHTT  HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeeebbbbbeeebebebbbebbbebeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbebeebbeebbbbeebbbbbbeebeebbebbbebbbebbeebbbebbeebbb:    
Contact         :                                                              b                                     

4ff4_A_1    1001:KFMKNVDFSKLSPEALEAIGKSALEYDQRENATVDDIANAASLIERNLRNIALGVDIRHKVLDKVNLSIDQMAAVGAPYQNNGKIDLSNMTPEQQADELN:1100
SecStr          :HHHHH  GGGS HHHHHHHHHHHS TTT SS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHB EEE SEESS   EE   SB  TT  HHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebebeebbeebbebbbebbbeeeeeeeeeeeebeebbeebeebbeebbebbebbbebbeebbbbbbbbbbbebbebbebeeebeeeeeeebbeebb:    

4ff4_A_1    1101:KLFREELEARKQ----------------------------------------------------------------------------------------:1112
SecStr          :HHHHHHHHHHH-:    
ExpBur          :ebbeebeeeee-:

Protein Model on 4ff4_A_1_E_1 (TEMPLATE: 4ff4 )

Input Residue Numbers for Focused Sites