Protein Model on 1pyg_D_1_K_1 (TEMPLATE: 1pyg )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 1 (D) polymer(polypeptide(L)) [801 aa] GLYCOGEN PHOSPHORYLASE B :PHS2_RABIT
2 b K 1 (D) non-polymer(AMP) ADENOSINE MONOPHOSPHATE 67W 68I 71Q 72Q 75Y 242R 309R 310R 315K 316F 317G 318C
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:1pyg_D_1
1pyg_D_1       1:XXXXXXXXXRKQISVRGLAGVENVTELKKNFNRHLHFTLVKDRNVATPRDYYFALAHTVRDHLVGRWIRTQQHYYEKDPKRIYYLSLEFYMGRTLQNTMV: 100
SecStr          :---------  S S TT S  S HHHHHHHHHHHHHTTS   TTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE S    B HHHHHHH:    
ExpBur          :---------eeeeeeeeeeeeeeeeebeebbeebbeeeeeeeeeebeeebebbbbbbbbbebbeebbeebbeebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbebbbb:    
Contact         :                                                                  bb  bb  b                         

1pyg_D_1     101:NLALENACDEATYQLGLDMEELEEIEEDAGLGNGGLGRLAACFLDSMATLGLAAYGYGIRYEFGIFNQKICGGWQMEEADDWLRYGNPWEKARPEFTLPV: 200
SecStr          :HTT HHHHHHHHHHHT  HHHHHTT   B    SHHHHHHHHHHHHHHHTT  EEEEEE  SSEEEEEEEETTEEEEEEE TTTT  TT EE GGG EEE:    
ExpBur          :bbebeebbbebbeeeebebeebbebbebbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbeebebbbeeeebebeeeebebbeeebbbbeeeeeeebeb:    

1pyg_D_1     201:HFYGRVEHTSQGAKWVDTQVVLAMPYDTPVPGYRNNVVNTMRLWSAKAPXXXXXXXXXXXXXXQAVLDRNLAENISXXXXXXXXXXXXKELRLKQEYFVV: 300
SecStr          :EEEEEEEE SS EEEEEEEEEEEEEEEEEEE SSSS EEEEEEEEEE  -------------- HHHHHHHHHTT ------------ HHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeeebeeeeebbebbeeeebebbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbebe--------------eeeeeeeebeebe------------eeeebbbbbbbb:    
Contact         :                                         b                                                          

1pyg_D_1     301:AATLQDIIRRFKSSKFGCRDPVRTNFDAFPDKVAIQLNDTHPSLAIPELMRVLVDLERLDWDKAWEVTVKTCAYTNHTVLPEALERWPVHLLETLLPRHL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHS SSS  S     GGGHHHHEEEEEESSTTTTHHHHHHHHHHTTS   HHHHHHHHHHHEEEE   S GGGS EEEHHHHHHH HHHH:    
ExpBur          :bbbbebbbebbbbbeeeeeeeebeebeebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebebbeebbeebbbbbbeebeeeebbebbbebbeebbbbbb:    
Contact         :        bb    bbbb                                                                                  

1pyg_D_1     401:QIIYEINQRFLNRVAAAFPGDVDRLRRMSLVEEGAVKRINMAHLCIAGSHAVNGVARIHSEILKKTIFKDFYELEPHKFQNKTNGITPRRWLVLCNPGLA: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHSTT HHHHHHH SEE SSS EEEHHHHHHHH S EEESSHHHHHHHHHTTTHHHHHH GGGEEE    B TIIIIIIT HHHH:    
ExpBur          :ebbeebbeebbeebeeeeeeeeebeeebbbbeeeeeeebbbbbbbbbbbebbbbbbeebbeebbeebbebbeebbeebbbebbbbbbbbbbbbbbbeebb:    

1pyg_D_1     501:EIIAERIGEEYISDLDQLRKLLSYVDDEAFIRDVAKVKQENKLKFAAYLEREYKVHINPNSLFDVQVKRIHEYKRQLLNCLHVITLYNRIKKEPNKFVVP: 600
SecStr          :HHHHHHH SGGGT GGGGGGGGGGTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT     TTSEEEEEES   GGG HHHHHHHHHHHHHHHHHSTTS    :    
ExpBur          :ebbbeebeeebbeebebbeebeeebeeeebbebbeebbeebbeebbebbeeeeeeebbeebbbbbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeeeeeebe:    

1pyg_D_1     601:RTVMIGGKAAPGYHMAKMIIKLITAIGDVVNHDPVVGDRLRVIFLENYRVSLAEKVIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMKFMLNGALTIGTMDGANVEMA: 700
SecStr          :EEEEEE    TT HHHHHHHHHHHHHHHHHTT GGGTTS  EEEETT  HHHHHHHHHH SEEEE   TTS S  HHHHHHHHHT EEEE S THHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbbeeebebbebbbbbbbbbbeebeebeebeebbebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbeebbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

1pyg_D_1     701:EEAGEENFFIFGMRVEDVDRLDQRGYNAQEYYDRIPELRQIIEQLSSGFFSPKQPDLFKDIVNMLMHHDRFKVFADYEEYVKCQERVSALYKNPREWTRM: 800
SecStr          :HHH GGGSEE S  HHHHHHHHHH   THHHHHH HHHHHHHHHHHHTTT TTSTTTTHHHHHHHHHT TT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHH:    
ExpBur          :eebeeebbbbbbbeeeebeebeeeeeebeeebeebeebeebbebbeebebbeeeeebbeebbebbbeebebbbbbbbeebbebbeebbebbeeeeebbbb:    

1pyg_D_1     801:VIRNIATSGKFSSDRTIAQYAREIWGVEPSRQRLPA----------------------------------------------------------------: 836
SecStr          :HHHHHHHGGGGBHHHHHHHHHHHTT          -:    
ExpBur          :bbebbbbbbbbbbbbbbbebbeebbebebeeeebe-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123