Protein Model on 4zjq_D_1_N_1 (TEMPLATE: 4zjq )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:2]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 1 (D) polymer(polypeptide(L)) [1038 aa] Multidrug efflux pump subunit AcrB :ACRB_ECOLI
2 b N 1 (D) non-polymer(ERY) ERYTHROMYCIN A 79S 80S 81N 89Q 91T 134S 292K 573M 621I 661F 676D 810R 812E 821E
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4zjq_D_1
4zjq_D_1       1:XPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSSNSDSTGTVQITLTFESGTDA: 100
SecStr          :- HHHHT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  B SS   S  EEEEEEE TT  HHHHHHHTHHHHHTT  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEESTT  H:    
ExpBur          :-eeebbeeeeebeeebeeeeeebbebeeebeebbbeebeebbbebbbeeeebebeebbeebbeebbeebeebeeebbbebebbeebebebebbbeeebeb:    
Contact         :                                                                              bbb       b b         

4zjq_D_1     101:DIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAANMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH  EEEEEEEEEEEEEEEEETT  S HHHHHHHHHHHTHHHHTTSTTEEEEEEES  EEEEEEE SHHHHHTT  H:    
ExpBur          :eebeebbeeebeebbeebbeebeeeebebeebeebbbbbbbbbbeeeebeeeebbbbbbeebeebbeebebbeebebbbbbbbbbbbbbbeebeeeebbb:    
Contact         :                                 b                                                                  

4zjq_D_1     201:VDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRLTSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS     EEET SS  TT    EEE       SSHHHHS EEEE TTS EEEHHHHEEEEEEES  S EEEETTEEEEEEEEEEETT  HH:    
ExpBur          :bebbebbeeebbeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeeeeebbebebeebeeeeebbbeebbeeeebbbeeebebebeeeebbbbbbebbeeebee:    
Contact         :                                                                                           b        

4zjq_D_1     301:DTAAAIRAELAKMEPFFPSGLKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHGGGS TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTT  B HHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeebbeebeeebeeebebbebbbeeebbeebbeebeebbeebeebbeebbeebbebeebbebbbebbebbbebbbeebeeeeebbbbbbbbbbbb:    

4zjq_D_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMALSVLVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTGGGG  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHH    :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbeebeebbebbbebbbbbbebbbebeebebbbbebbbbbbebbbebbbebbbbbbbbbbbeebeee:    

4zjq_D_1     501:AKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLPSSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLT: 600
SecStr          : SS TT S SGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS B S      SEEEEEEE  TT  HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeebeebeebeeebeebbeebbebbeeeeeeeeebeebeeebeebeeebeeebbeebbbbbbbbebebeeebeeeebbebbeebbebbee:    
Contact         :                                                                        b                           

4zjq_D_1     601:KEKNNVESVFAVNGGGQNTGIAFVSLKDWADRPGEENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARNQLLAE: 700
SecStr          :HTTTTEEEEEEEE SSTTEEEEEEEE  GGG  SSSSSHHHHHHHHHHHHHHS SS EEEE   SSTTS  SSEEEEEEEE S  HHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbebebbbebbbbbeebeebeeeebebebbbeebeebbeeebebebebebbebbeebeeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbeebbee:    
Contact         :                    b                                       b              b                        

4zjq_D_1     701:AAKHPDMLTSVRPNGLEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVPFSAFS: 800
SecStr          :HHT TTTEEEEEESS   EEEEEEEE HHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHT EEEEEEEETTEEEEEEEEE STTSSSGGGGGG EEE SSS EEEGGGTE:    
ExpBur          :beeeeebbeeeeeeeeeeeeeeebeeeeeebeeeebeeeebeebeebbeebebbbbbebeeeebebbbbbbeebeeeeebbeebebebeeeebbebeebb:    

4zjq_D_1     801:SSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAISLIVVFLCLAALYESWSIPFSVMLVV: 900
SecStr          :EEEEEEE SEEEEETTEEEEEEEEEE SSS HHHHHHHHHHHTTSS TTEEEEE THHHHHHHS S HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSTHHHHHTTH:    
ExpBur          :eeeeeebbeebbbbeeeebbebbbebbeeeebeebbebbbebbeebeeebbeebbebbebeeeeeeeeeebeeebeeebbeebbeebebebbbebbbebe:    
Contact         :         b b        b                                                                               

4zjq_D_1     901:PLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGLIEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQNAVGT:1000
SecStr          :HHHHHHHHHHHHTTT  BSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   HHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  STTHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbebbeeeeebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebebbeebbeebbebbbebbebbbebbbebbeebbeeeebbbebbbbbbb:    

4zjq_D_1    1001:GVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDIEHSH-------------------------------------------------------------:1039
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSS        -:    
ExpBur          :bbbbbbeebbeebbebbbbbbbebbeeeeeeeeeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123