[pdbjlvh2]Protein Model on 4zjo_D_1_N

Protein Model on 4zjo_D_1_N_1 (TEMPLATE: 4zjo )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:2]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description	a(query F)
1	a	F	D 1 (D)	polymer(polypeptide(L)) [1042 aa]	Multidrug efflux pump subunit AcrB :ACRB_ECOLI
2	b		N 1 (D)	non-polymer(ERY)	ERYTHROMYCIN A	77Y 79S 91T 134S 292K 617A 666F 673E 674L 675G 681D 819Y 826E 860T 861G 862M

FOCUSED TEMPLATE

MODEL[1] TEMPLATE:4zjo_D_1

4zjo_D_1       1:XPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSSNSDSTGTVQITLTFESGTDA: 100
SecStr          :-  TTTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  B SS   S  EEEEEEE TT  HHHHHHHTHHHHHHH  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEE TT  H:    
ExpBur          :-eeebbeeeeebeeebeebeeebeebeeebebbbbeebebbebebebeeeebebeebbeebbeebbeebeebeeebbbebebbeebebebebbbeeebeb:    
Contact         :                                                                            b b           b         

4zjo_D_1     101:DIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAANMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH  EEEEEEEEEEEEEEEEESSS S HHHHHHHHHHHTHHHHTTSTTEEEEEEES  EEEEEEE HHHHHTTT  H:    
ExpBur          :eebeeebeebbeebbeebbeebeeeeeebebbeebbbbbbbbbbeeeeeeeeebbbbbbbebeebbeebeebeebebbbbbbbbbbbbbbeebeeeebbb:    
Contact         :                                 b                                                                  

4zjo_D_1     201:VDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRLTSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS     EEET SS  TT    EEE       SSHHHHS EEEE TTS EEEHHHHEEEEEEES    EEEETTEEEEEEEEEEETT  HH:    
ExpBur          :bebbebbeeebbeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebbeeeeebbebebeeeeeeeebbbeebbebeebbbeeebbbbbeeeebbbbbbebbeeeeeb:    
Contact         :                                                                                           b        

4zjo_D_1     301:DTAAAIRAELAKMEPFFPSGLKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHGGG  TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT  B HHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeeebeebeeebeeebebbebbbebebbeebbeebeebbeebeeebeebbeebbebeebbebbbebbebbbebbbeebeeeebbbbbbbbbbbbb:    

4zjo_D_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMALSVLVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGGG  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHHHHHH    :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbebbeebbebbbebbbbbbebbbebeebebbbbebbbebbebbbebbbebbbbbbbbbbbeebeeb:    

4zjo_D_1     501:AKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLPSSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLT: 600
SecStr          : TT TT S STTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS B S      SEEEEEEE  TT  HHHHHHHHHHHHHHHTT:    
ExpBur          :eeeeeeeeeebeebeebeebeeebeebbeebbebbeeeeeeeeebeebeeebeebeeebeeebbeebbbbbbbbebebeeebeeeebbebbeebbebbee:    

4zjo_D_1     601:KEKNNVESVFAVNGAGAAGAGQNTGIAFVSLKDWADRPGEENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARN: 700
SecStr          :TTTTTEEEEEEEEEE SS EEEEEEEEEEEE  GGG  SSSSSHHHHHHHHHHHHHHT SS EEEE   SSTTS  SS EEEEEEE S  HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbbeeebeeebbbbbbbbbeebeebeeeebebebbbeebeeebeeeeebebebebbebbeebeeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbe:    
Contact         :                b                                                b      bbb     b                   

4zjo_D_1     701:QLLAEAAKHPDMLTSVRPNGLEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVP: 800
SecStr          :HHHHHHHT TTTEEEEEESS   EEEEEEEE HHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHT EEEEEEEETTEEEEEEEEE GGGSSSGGGGGG EEE SSS EEE:    
ExpBur          :ebbeebeeeeebbeebeeeebeebeeeeeebeeeebeeeebeeeebeebbebbeebebbbbbebeeeebebbbbbeeebeeeeebbeebebebeeeebbe:    

4zjo_D_1     801:FSAFSSSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAISLIVVFLCLAALYESWSIPFS: 900
SecStr          :GGGTEEEEEEEE SEEEEETTEEEEEEEEEE TT  HHHHHHHHHHHHTTS TTEEEEE THHHHHHHS S HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSTTHH:    
ExpBur          :beebbeeeeeebbbbbbbbeeeebbebbbebbeeeebeebbebbeebbeebeeebeeebbeebebeeeeeeeeeebeeebeeebbeebbeebebebbbeb:    
Contact         :                  b      b                                 bbb                                      

4zjo_D_1     901:VMLVVPLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGLIEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQ:1000
SecStr          :HHTTHHHHHHHHHHHHHHTT  BSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS   SHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHS  STTHHHH:    
ExpBur          :bbebebbbbbbbbebbeeeeebbbbbbebbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbebbeeebebbeebbbebbebbbebbebbbebbbebbeebbeeeebbbebb:    

4zjo_D_1    1001:NAVGTGVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDIEHS---------------------------------------------------------:1043
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS SS SS   -:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbebbbeebbebbbbbbbebbeeeeeeeeeeee-:

Protein Model on 4zjo_D_1_N_1 (TEMPLATE: 4zjo )

Input Residue Numbers for Focused Sites