Protein Model on 4zjo_A_1_G_1 (TEMPLATE: 4zjo )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [1042 aa] Multidrug efflux pump subunit AcrB :ACRB_ECOLI
2 b G 1 (A) non-polymer(ERY) ERYTHROMYCIN A 79S 81N 134S 135S 136F 292K 573M 616G 617A 673E 675G 681D 683E 817E 826E 828L 860T 862M
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4zjo_A_1
4zjo_A_1       1:XPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSSNSDSTGTVQITLTFESGTDA: 100
SecStr          :-  TGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EESS S S  EEEEEEE TT  HHHHHTTTHHHHHHH  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEE TT  H:    
ExpBur          :-eeebbeeeeebeeebeebeeebbebeeebeebbbeebeebbbbbbbeeeebebeebbeebbebbbeebeebeeebbbebebbeebebebebbbeeebeb:    
Contact         :                                                                              b b                   

4zjo_A_1     101:DIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAANMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH  EEE EEEEEEEEEEEEETT  S HHHHHHHHHHHTHHHHHTSTTEEEEEEES  EEEEEEE HHHHHHTT  H:    
ExpBur          :eebeeebeebbeebbeebbeebeebeeebbebeeebbbbbbbbbeeeebebeebbbbbbeebeebbeebeebebbebbbbbbbbbbbbbbeebeebebbb:    
Contact         :                                 bbb                                                                

4zjo_A_1     201:VDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRLTSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS     EEET SS  TT    EEE       SSGGGTS EEEE TTS EEEHHHHEEEEEEES  S EEEETTEEEEEEEEEEETT  HH:    
ExpBur          :bebbebbeeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeeeeebbebebeeeeeeeebbbeebbebeebbbeeebebebeeeebbbbbbbbbeeeebb:    
Contact         :                                                                                           b        

4zjo_A_1     301:DTAAAIRAELAKMEPFFPSGLKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHGGGS TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EEHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeeebeebeeebeeebebeebbbebebbeebbeebeebbeebbeebeebbeebbebeebbebbbebbebbbebbbeebeeeebbbbbbbbbbbbb:    

4zjo_A_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMALSVLVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGGS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbeebeebbebbbebbbbbbebbbebeebebebbebbbebbebbbebbbebbebbbbbbbbebbeeb:    

4zjo_A_1     501:AKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLPSSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLT: 600
SecStr          : TT TTTTTTSTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS B S      SEEEEEEE STT  HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeeebeeeebeebeebeebeeebeebbeebbebbeeeeeeeeebeebeeebeebeeebeeeeebebbbbbbbbebebeeebeeeebbebbeebbebbee:    
Contact         :                                                                        b                           

4zjo_A_1     601:KEKNNVESVFAVNGAGAAGAGQNTGIAFVSLKDWADRPGEENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARN: 700
SecStr          :TTTTTEEEEEEEEEE SS EEEEEEEEEEEE  GGG  SSSSSHHHHHHHHHHHHHHT SS EEEE   SSTTS  SS EEEEEEESS  HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbbeeeeeeebbbbbbbbbeebeebeeeebebebbbeebeeebeeeeebebebebbebbeebeeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbe:    
Contact         :               bb                                                       b b     b b                 

4zjo_A_1     701:QLLAEAAKHPDMLTSVRPNGLEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVP: 800
SecStr          :HHHHHHHT TTTEEEEEE S   EEEEEEEE HHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHT EEEEEEEETTEEEEEEEEE GGGSSSGGGGGG EEE SSS EEE:    
ExpBur          :ebbeebeeeeeebeebeeeeeebbeeeeeebeeeebeeeebeeeebeebeebbeebebbbebebeeeebbbbbbbbeebeeeeebbeebebebeeeebbe:    

4zjo_A_1     801:FSAFSSSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAISLIVVFLCLAALYESWSIPFS: 900
SecStr          :GGGTEEEEEEEE SEEEEETTEEEEEEEEEE TT  HHHHHHHHHHHHTTS TTEEEEE THHHHHHHS S HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT SSHHHH:    
ExpBur          :beebbeeeeeebbbbbbbbeeeebbebbbebbeeeebeebbebbeebbeebeeebbeebbebbebeeeeeeeeeebeeebeeebbeebbeebebebbbeb:    
Contact         :                b        b b                               b b                                      

4zjo_A_1     901:VMLVVPLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGLIEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQ:1000
SecStr          :HHTTHHHHHHHHHHHHHHTT  B HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   HHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  STTHHHH:    
ExpBur          :bbebebbbbbbbbebbeeeeebbbbbbebbbbbbebbbebbbbbbbbbbbbbbeeebebbeebbbebbebbbebbebbbebbbebbeebbebeebbbebb:    

4zjo_A_1    1001:NAVGTGVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDIEHS---------------------------------------------------------:1043
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS SS SS   -:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbebbbeebbebbbbbbbbbbeeeeeeeeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123