Protein Model on 4zjq_A_1_G_1 (TEMPLATE: 4zjq )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [1038 aa] Multidrug efflux pump subunit AcrB :ACRB_ECOLI
2 b G 1 (A) non-polymer(ERY) ERYTHROMYCIN A 79S 134S 292K 573M 663L 668E 676D 714N 821E 856G 857M
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4zjq_A_1
4zjq_A_1       1:XPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSSNSDSTGTVQITLTFESGTDA: 100
SecStr          :-  GGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EESS   S  EEEEEEE TT  HHHHHHHTHHHHHHH  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEESTT  H:    
ExpBur          :-eeebbeeeeebeeebeeeeeebeebeeebeebbbeebebbbbbbebeeeebebeebbeebbeebbeebeebeeebbbebebbeebebebebbbeeebeb:    
Contact         :                                                                              b                     

4zjq_A_1     101:DIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAANMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH EEEEEEEEEEEEEEEEEETT  S HHHHHHHHHHHTHHHHTTSTTEEEEEEES  EEEEEEE HHHHHTTT  H:    
ExpBur          :eebeebbeebbeebbeebbeebeebeeebeebeeebbbbbbbbbeeeeeebeebbbbbbeebeebbeebebbbebebbbbbbbbbbbbbbeebeebebbb:    
Contact         :                                 b                                                                  

4zjq_A_1     201:VDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRLTSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS      EET SS  TT    EE        SSHHHHS EEEE TTS EEEHHHHEEEEEEES  S EEEETTEEEEEEEEEEETT  HH:    
ExpBur          :bebeebbeeebbeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeeeeebbebebeeeeeeeebbbeebbebeebbbeeebebebeeeebbbbbbebbbeeeeb:    
Contact         :                                                                                           b        

4zjq_A_1     301:DTAAAIRAELAKMEPFFPSGLKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHGGG  TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EEHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeeebeebeeebeeebebbebbbebebbeebbebbeebbeebbeebeebbeebbebeebbebbbebbebbbebbbebbeeeebbbbbbbbbbbbb:    

4zjq_A_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMALSVLVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTGGGG  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbebbeebbebbbebbbbbbebbbebeebebebbebbbebbebbbebbbebbbbbbbbbbbeebeeb:    

4zjq_A_1     501:AKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLPSSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLT: 600
SecStr          : SS TTTTSSSTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS B SS     SEEEEEEE STT  HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeebeeeeebeeebeebbeebbebbeeeeeeeeebeebeeebeeeeeebeeeebbebbbbbbbbebebeeebeeeebbebbeebbebbee:    
Contact         :                                                                        b                           

4zjq_A_1     601:KEKNNVESVFAVNGGGQNTGIAFVSLKDWADRPGEENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARNQLLAE: 700
SecStr          :HTTTTEEEEEEEE SSTTEEEEEEEE  GGG  SSSSSHHHHHHHHHHHHHHS SS EEEE   SSTTS  SSEEEEEEEESS  HHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbebebbbbbbbbbeeeeebeeeebebebbbeebeeebeeebebebebebbebbeebbeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbeebbee:    
Contact         :                                                              b    b       b                        

4zjq_A_1     701:AAKHPDMLTSVRPNGLEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVPFSAFS: 800
SecStr          :HTT TTTEEEEEESS   EEEEEEEE HHHHHHHT  HHHHHHHHHHHHT EEEEEEEETTEEEEEEEEE GGGSSSGGGGGG EEE SSS EEEGGGTE:    
ExpBur          :beeeeebbeeeeeeeeeebebeeeebeeeebeeeebebeebeebeebbeebebbbebebeeeebbbbbbbeeebeeeeebbeebebebeeeebbebeebb:    
Contact         :             b                                                                                      

4zjq_A_1     801:SSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAISLIVVFLCLAALYESWSIPFSVMLVV: 900
SecStr          :EEEEEEE SEEEEETTEEEEEEEEEE SSS HHHHHHHHHHHTTSS TTEEEEE THHHHHHHS SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS SSTTHHHHTTH:    
ExpBur          :eeeeeebbbebbbbeeeebbbbbbebbeeeebeebbebbbebbeebeeebbeebbebbebeeeeeeeeeebeeebeeebbeebbeebebebbbebbbebe:    
Contact         :                    b                                  bb                                           

4zjq_A_1     901:PLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGLIEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQNAVGT:1000
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHTT  B HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   HHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  STTHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbebbeeeeebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbeeebebbeebbbbbbebbbebbebbbebbbebbeebbeeeebbbebbbbbbb:    

4zjq_A_1    1001:GVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDIEHSH-------------------------------------------------------------:1039
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS S  SS    -:    
ExpBur          :bbbbbbebbbeebbebbbbbbbbbbeeeeeebeebeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123