Protein Model on 4zjl_D_1_N_1 (TEMPLATE: 4zjl )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:2]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 1 (D) polymer(polypeptide(L)) [1042 aa] Multidrug efflux pump subunit AcrB :ACRB_ECOLI
2 b N 1 (D) non-polymer(ERY) ERYTHROMYCIN A 79S 81N 134S 135S 292K 615F 616G 617F 673E 674L 681D 719N 815R 817E 826E 862M
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4zjl_D_1
4zjl_D_1       1:XPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSSNSDSTGTVQITLTFESGTDA: 100
SecStr          :- HHHHT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EESS   S  EEEEEEE TT  HHHHHHHTHHHHHTT  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEE TT  H:    
ExpBur          :-eeebbeeeeebeeebeeeeeebeebeeebeebbbbebebbbbbbbbeeeebebeebbeebbeebbeebeebeeebbbebebbeebebebebbbeeebeb:    
Contact         :                                                                              b b                   

4zjl_D_1     101:DIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAANMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH  EEEEEEEEEEEEEEEEETTS S HHHHHHHHHHHTHHHHTTSTTEEEEEEES  EEEEEEE HHHHHHTT  H:    
ExpBur          :eebeeebeebbeebbeebbeebeeeebebeebeeebbbbbbbbbeeeeeeeeebbbbbbbebeebbeebeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeebebbb:    
Contact         :                                 bb                                                                 

4zjl_D_1     201:VDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRLTSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS      EET SS  TT    EE        SHHHHHT EEEE TTS EEEHHHHEEEEEEES  S EEEETTEEEEEEEEEEETT  HH:    
ExpBur          :bebeebbeeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebbeeeeebbebebeebeeeeebbbeebbebeebbbeeebbbebeeeebbbbbbebbeeebeb:    
Contact         :                                                                                           b        

4zjl_D_1     301:DTAAAIRAELAKMEPFFPSGLKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHGGG  TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EEHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeebbeebeeebeeebebbebbbebebbeebbeebeebbeebeeebeebbeebbebeebbebbbebbebbbebbbeebeeeeebbbbbbbbbbbb:    

4zjl_D_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMALSVLVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHH    :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbeebeebbebbbebbbbbbebbbebeebebbbbebbbbbbebbbebbbebbbbbbbbbbbeebeee:    

4zjl_D_1     501:AKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLPSSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLT: 600
SecStr          : TT TT SSSSTTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS B S      SEEEEEEE  TT  HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeebeebeebeeebeebbeebbebbeebeeeeeebeebeeebeebeeebeeeebbebbbbbbbbebebeeebeeeebeebbeebbebbee:    

4zjl_D_1     601:KEKNNVESVFAVNGFGFAGRGQNTGIAFVSLKDWADRPGEENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARN: 700
SecStr          :HTTTTEEEEEEEEEE SS EEEEEEEEEEEE  TTT  SSSSSHHHHHHHHHHHHHHS SS EEEE   SSTTS  SSEEEEEEEESS  HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbbbebeebebbbbbbbbbeebeebeeeebbbebbbeebeeebeeeeebebebebbebbeeeeeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbe:    
Contact         :              bbb                                                       bb      b                   

4zjl_D_1     701:QLLAEAAKHPDMLTSVRPNGLEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVP: 800
SecStr          :HHHHHHHT TTTEEEEEESS   EEEEEEEE HHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHT EEEEEEEETTEEEEEEEEE GGGSSSGGGGGG EEE SSS EEE:    
ExpBur          :ebbeebeeeeeebeebeeeeeeebeeeeeebeeeebeeeebeeeebeebeebbeebebbbebebeeeebbbbbbbeeebeeeeebbeebebebeeeebbe:    
Contact         :                  b                                                                                 

4zjl_D_1     801:FSAFSSSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAISLIVVFLCLAALYESWSIPFS: 900
SecStr          :GGGTEEEEEEEE SEEEEETTEEEEEEEEEE TT  HHHHHHHHHHHHHTS TTEEEEE THHHHHHHS   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT SSTHHH:    
ExpBur          :beebbeeeeeebbbbbbbbeeeebbbbbbebbeeeebeebbebbeebbeebeeebbeebbbebebeeeeeeeeeebeeebeeebbeebbeebebebbbeb:    
Contact         :              b b        b                                   b                                      

4zjl_D_1     901:VMLVVPLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGLIEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQ:1000
SecStr          :HHTTTHHHHHHHHHHHHHTT  B HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS   HHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  STTHHHH:    
ExpBur          :beebebbbbbbbbebbeeeeebbbbbbebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbeeebebbeebbbbbbebbbebbebbbebbbebbeebbeeeebbbebb:    

4zjl_D_1    1001:NAVGTGVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDIEHS---------------------------------------------------------:1043
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSSSS S    -:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbebbbeebbebbbbbbbbbbeeeeeeeeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123