Protein Model on 4zjl_A_1_G_1 (TEMPLATE: 4zjl )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [1044 aa] Multidrug efflux pump subunit AcrB :ACRB_ECOLI
2 b G 1 (A) non-polymer(ERY) ERYTHROMYCIN A 79S 81N 134S 135S 136F 292K 573M 575M 615F 617F 618A 673E 681D 683E 826E 828L 860T 861G 862M
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4zjl_A_1
4zjl_A_1       1:XPNFFIDRPIFAWVIAIIIMLAGGLAILKLPVAQYPTIAPPAVTISASYPGADAKTVQDTVTQVIEQNMNGIDNLMYMSSNSDSTGTVQITLTFESGTDA: 100
SecStr          :- HHHHT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EESS   S  EEEEEEE TT  HHHHHHHTHHHHHTT  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEE TT  H:    
ExpBur          :-eeebbeeeeebeeebeebeeebeebeeebeebbbbebeebbbbbbbebeebebeebbeebbebbbeebeebeeebbbebbbbeebbbebebbbeeebeb:    
Contact         :                                                                              b b                   

4zjl_A_1     101:DIAQVQVQNKLQLAMPLLPQEVQQQGVSVEKSSSSFLMVVGVINTDGTMTQEDISDYVAANMKDAISRTSGVGDVQLFGSQYAMRIWMNPNELNKFQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH EEEEE  SSEEEEEEEEETT  S HHHHHHHHHHHTHHHHHHSTTEEEEEEES  EEEEEEE HHHHHHTT  H:    
ExpBur          :eebeeebeeebeebbeebbeebeebeeebeebeeebbbbbbbbbeeeeeebeebbbbbbeebeebbeebeebbebebbbbbbbbbbbbbbeebeeeebbb:    
Contact         :                                 bbb                                                                

4zjl_A_1     201:VDVITAIKAQNAQVAAGQLGGTPPVKGQQLNASIIAQTRLTSTEEFGKILLKVNQDGSRVLLRDVAKIELGGENYDIIAEFNGQPASGLGIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS      EET SS  TT    EE   S    SHHHHHT EEEE TTS EEEHHHHEEEEEEES  S EEEETTEEEEEEEEEE TT  HH:    
ExpBur          :bebbebbeeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeeeeebbebeeeeeeeeeebbbeebbebeebbbeeebebebeeeebbbbbbbbbeeeebb:    
Contact         :                                                                                           b        

4zjl_A_1     301:DTAAAIRAELAKMEPFFPSGLKIVYPYDTTPFVKISIHEVVKTLVEAIILVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFAVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHGGG  TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  EEHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeeebeebeeebeeebebbebbbebebbeebbeebeebbeebeeebeebbeebbbbeebbebbbebbebbbebbbeebeeeebbbbbbbbbbbbb:    

4zjl_A_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLPPKEATRKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFVPMAFFGGSTGAIYRQFSITIVSAMALSVLVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTT  SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbebbeebbeebbebbbbebebbbebeebebebbebbbebbebbbebbbebbebbbbbbbbeebeeb:    

4zjl_A_1     501:AKGDHGEGKKGFFGWFNRMFEKSTHHYTDSVGGILRSTGRYLVLYLIIVVGMAYLFVRLPSSFLPDEDQGVFMTMVQLPAGATQERTQKVLNEVTHYYLT: 600
SecStr          : TT TTTTSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS B S      SEEEEEEE  TT  HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeeeeeeeebeebeebeebeeebeebbeebbebbeebeeeeeebeebeeebeeeeeebeeeebbebbbbbbbbbbebeeebeeeebeebbeebbebbee:    
Contact         :                                                                        b b                         

4zjl_A_1     601:KEKNNVESVFAVNGFGFAGRGQNTGIAFVSLKDWADRPGEENKVEAITMRATRAFSQIKDAMVFAFNLPAIVELGTATGFDFELIDQAGLGHEKLTQARN: 700
SecStr          :TTTTTEEEEEEEEEE SS EEEEEEEEEEEES TTT  SSTTSHHHHHHHHHHHHHHS SS EEEE   SSTTS  SSEEEEEEEESS  HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbbbeebebebbbbbbbbbeebeebeeeebebebbbeebeebbeeeeebebebebbebbeebeeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbe:    
Contact         :              b bb                                                      b       b b                 

4zjl_A_1     701:QLLAEAAKHPDMLTSVRPNGLEDTPQFKIDIDQEKAQALGVSINDINTTLGAAWGGSYVNDFIDRGRVKKVYVMSEAKYRMLPDDIGDWYVRAADGQMVP: 800
SecStr          :HHHHHHHT TTTEEEEEESS   EEEEEEEE HHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHT EEEEEEEETTEEEEEEEEE STTSSSGGGGTT EEE SSS EEE:    
ExpBur          :ebbeebeeeeebbeebeebeeebbeeeeeebeeeebeeeebeeeebeebeebbeebebbbebebeeeebbbbbbbeeebeeeeebbeebebebeeeebbe:    

4zjl_A_1     801:FSAFSSSRWEYGSPRLERYNGLPSMEILGQAAPGKSTGEAMELMEQLASKLPTGVGYDWTGMSYQERLSGNQAPSLYAISLIVVFLCLAALYESWSIPFS: 900
SecStr          :GGGTEEEEEEEE SEEEEETTEEEEEEEEEE TT  HHHHHHHHHHHHHTS TTEEEEE THHHHGGGS S HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT SSTTHH:    
ExpBur          :beebbeeeeeebbbbbbbbeeeebbbbbbebbeeeebeebbebbeebbeebeeebbeebbebbeeeeeeeeeeeebeeebeeebbeebbeebebebbbeb:    
Contact         :                         b b                               bbb                                      

4zjl_A_1     901:VMLVVPLGVIGALLAATFRGLTNDVYFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKDLMDKEGKGLIEATLDAVRMRLRPILMTSLAFILGVMPLVISTGAGSGAQ:1000
SecStr          :HHTTHHHHHHHHHHHHHHTT  B HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS   HHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  STTHHHH:    
ExpBur          :bbebebbbbbbbbebbeeeeebbbbbbbbbbbbbebbbebbbbbbbbbbbebbeeebebbeebbebbbebbbebbebbbebbbebbeebbebeebbbebb:    

4zjl_A_1    1001:NAVGTGVMGGMVTATVLAIFFVPVFFVVVRRRFSRKNEDIEHSHT-------------------------------------------------------:1045
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTS  SS SS     -:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbebbbeebbebbbbbbbbbbeeeeeebeeeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123