Protein Model on 6k32_A_1_O_1 (TEMPLATE: 6k32 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [1208 aa] RNA-dependent RNA polymerase :D0EZK6_CPVBM
2 b O 1 (A) non-polymer(UTP) URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE 475R 477Q 480R 481R 483R 543D 544V 545A 546G 547M 548D 640T 644H 675G 676D
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:6k32_A_1
6k32_A_1       1:TKLHNTIFSETRKFTRESFKEIEHLTARLANDRVARHDFLFNTSIVLISDYSGEDSNGNQLQATITIPNEIINPKEYDPSDYPLAEDESFFKQGHKYDYL: 100
SecStr          :  SSSSSHHHH S  TTHHHHHHHHHHHHHS HHHHHHHH  TTS    EEEE  SSSS EEEE    HHHHS     TTSS B SSSSSB TT S  S :    
ExpBur          :eebeebebbeeeebbeebbeebeebbbebbeeeebbbebbbeeebeebeeeebebbeebebebebeebeebeebeebeeebbebeeeeeebeeebebbbb:    

6k32_A_1     101:VTFRAGSLTNTYEPKTKMYKLHAALDKLMHVKQRKSRFADLWRELCAVIASLDVWYQTTNYPLRTYVKLLFHKGDEFPFYESPSQDRIIFNDKSVASILP: 200
SecStr          :    GGG    S S STHHHHHHHHHHHHHTTT   SSS HHHHHHHHHHHHHHHHSSS  THHHHHHHHS  SSS SEEE STT SEEES TTS TTHH:    
ExpBur          :bbbebeebeeeeeeeeeeeebeebbeebbbbebebbbbbebbbbbbbbbbbbbbbeeebebbbbbbbbebbeeeeebbbebeeeeeebebeeeebbbbbb:    

6k32_A_1     201:TFVYTCCQVGTAIMSGILTHVESIVAMNHFLHCAKDSYIDEKLKIKGIGRSWYQEALHNVCQATVPVWSQFNEVIGHRTKSTSEPHFVSSTFISLRAKRA: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHTSS HHHHHHHHHHHHHHTTT TTHHHHHHHHHTTSTHHHHTTSS EEEEEEE TTS EEEEEEEE    TTTSHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbebbebbbbbbbbbbbbebbeebbbeebeebeebbbbbbbbbbeebeebebbbbbeebebebeeebebebbebbeeebeeeeeebe:    

6k32_A_1     301:ELLYPEFNAYINRAIQLSKTQNDVANYYAACRAMTNDGTFLATLTELSLDAAVFPRIEQHLVTRPAVLMSNTRHESLKQKYTNGVGSIAQSYLSSFTDEI: 400
SecStr          :HHS HHHHHHHHHHHHS  SHHHHHHHHHHHHTTS         TTTTHHHHSS    S      EEEEE SSS  SEEE  SSSHHHHHHHHGGGGGTH:    
ExpBur          :eebeeebbebbeebbeebeebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbebeeeeeebeebeeebbbeeeeebebebeeebbebbbebbeebbeeb:    

6k32_A_1     401:AKRVNGRHHDEAWLNFLTTSSPGRKLTEIEKLEVGGDVAAWSNSRIVMQAVFAREYRTPERIFKSLKAPIKLVERQQSDRRQRAISGLDNDRLFLSFMPY: 500
SecStr          :HHHTTTS HHHHHHHHS S    S    GGGTTT HHHHHHTTSHHHHHHHT TTTT THHHHHHHSS  EEEEE  SSS  EEEEE  TTHHHHTHHHH:    
ExpBur          :beebeeeebbebbbeebeeeeebeeebeeeeeeeeeebbebbebbbbbbbbbeebbeeeebbeebeebebebeeebebbeebbbebebbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                                                                          b b  bb b                 

6k32_A_1     501:TIGKQIYELNDNAAQGKQAGNAFDIGEMLYWTSQRNVLLSSIDVAGMDASVTTNTKDIYNTFVLDVASKCTVPRFGPYYAKNMEVFEAGNRQSQVRYVNA: 600
SecStr          :HHTTTHHHH TTB   S   SGGGTTTHHHHHTSSS  EEEE EE HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHS    TTT   EE   EESS SS    EE H:    
ExpBur          :bbbebbeeebebbbeebbbbbbbbbbbbbbbbbeeebbbbbbebebbbbbbeeebbbbbbbbbbbbbeebebeebbbbebeebebeeeeeeeeeeeebbb:    
Contact         :                                          bbbbbb                                                    

6k32_A_1     601:AWQACALEAANSQTSTSYESEIFGQVKNAEGTYPSGRADTSTHHTVLLQGLVRGNELKRASDGKNSCLATIKILGDDIMEIFQGSESDTYDHAVSNASIL: 700
SecStr          :HHHHHHHHHHT     EEE SSSSEEE  S S  TTSS TTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHTT    EE   BBTTBEEEEE S TTHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbbeeeebbbbbebebbeebebeebbbbbebbbeebbbbbbbbbbbebbbeebeeeeeeebbebbbbeebbbbbbbeeeeeebeebbebbeebb:    
Contact         :                                       b   b                              bb                        

6k32_A_1     701:NESGFATTAELSQNSIVLLQQLVVNGTFWGFADRISLWTREDTKDIGRLNLAMMELNALIDDLVFRVRRPEGLKMLGFFCGAICLRRFTLSVDNKLYDST: 800
SecStr          :HHTT EE   EESS EEETTEEEETTEEE  GGGS SS     SS  SSSHHHHHHHHHHGGGSSS S HHHHHHHHHHHHHTTTT EEEE  HHHHHHH:    
ExpBur          :eebbbbbeeeebbbbbebeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbeeeeeebeebebbeebbebbbbbbbbbeebebbbbbbbbbbbbbbbbbebebeeeebeeb:    

6k32_A_1     801:YNNLSKYMTLTKYDKNPDSDSTLMSLILPLAWLFMPRGGEYPAYPFERRDGTFTEDESMFTARGAYKRRLLYDVSNIGEMIQQNSMALDDDLLHEYGFTG: 900
SecStr          :HHHHTTTS EEE    SSSS  EEEE   TTGGG SSS          SS        TT   TTTHHHHHHHHT HHHHHHHT     HHHHHHHTSHH:    
ExpBur          :eebbeeebebbeeeeeeeeebbebbbbbbbbbbbbeebbbbbbbbbbbeeeeebeebbbbbbbeebbbbbbbbbbbbeebeeeeeeeeeeebbeebbbbb:    

6k32_A_1     901:ALLLIDLNILDLIDEVKKEDISPVKVSELATSLEQLGKLGEREKSRRAASDLKIRGHALSNDIVYGYGLQEKIQKSAMATKETTVQSKRVSSRLHDVIVA:1000
SecStr          :HHHHHHH HHHHHHHHHHHSS HHHHHHHHHHHTTTSS S SHHHHHHHHHHHHHT    TTTSTTHHHHHHHHHHHHHS   HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbebebeebbeebbeeebeeeebeebbeebbebbeeeebeebeebbeebeeeeeebeeebbbbebbeebbbebbeeeeeeeebeeebbeebbeebee:    

6k32_A_1    1001:KTRDYKISTIPADALHLHEFEVEDVTVDLLPHAKHTSYSSLAYNMSFGSDGWFAFALLGGLDRSANLLRLDVASIRGNYHKFSYDDPVFKQGYKIYKSDA:1100
SecStr          :HHSS      TT SS  EEEE  SSB    THHHHTTSS SSSTT TTSHHHHHHHHTT   SSHHHHHHHHTTTS  SS   TT TTHHHHHHHHTTT :    
ExpBur          :ebeebebeeeeebbbbbbbbeeeeeeeeeeebbebbeebbbbbbbeeeebbbbbbbbbbebbeebbeebeebbeeeebeeeeebebebbebbbebeeeee:    

6k32_A_1    1101:TLLNDFFTAISAGPKEQGILLRAFAYYSLYGNVEYHYVLSPRQLFFLSDNPVSAERLVRIPPKYYVSTQCRALYNIFSYLHILRSIANNRGKRLKMVLHP:1200
SecStr          :SGGGTTHHHHT  HHHHHHHHHHHHHTTSS  SSS     TTTSTTS S GGGGTTT B  TT   STTHHHHHHHHHHHHHHHS TT  SB  EEEE H:    
ExpBur          :ebbeebbebbebeeeeeebbeebbeebeebbbeebebebbbbbbbbbbbbbeebeebbebbeebeeeeebebbbbbbbbbbbbbbbeebebbebebbbbe:    

6k32_A_1    1201:GLIAYVRG--------------------------------------------------------------------------------------------:1208
SecStr          :HHHHHH -:    
ExpBur          :ebbeebe-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123