CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(ACE2_HUMAN) | E 1 (F) | polymer(polypeptide(L)) [593 aa] | Angiotensin-converting enzyme 2 :ACE2_MOUSE | |
2 | b | C 1 (C) | polymer(polypeptide(L)) [1047 aa] | Spike glycoprotein :SPIKE_SARS2 | 24Q(N) 27T 28F 30D(N) 31K(N) 34H(Q) 38D 41Y 42Q 83Y(F) 330N 353K(H) 354G 355D 357R (identity: 60.0 %/84.4 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:8vkl_E_1 identity=84.4% |
queryA 22:EEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILN: 121 :** ***** ** ***** ****************** * * * ***** *** ** ***** * ******* *** ** ** * ******: 8vkl_E_1 22:EENAKTFLNNFNQEAEDLSYQSSLASWNYNTNITEENAQKMSEAAAKWSAFYEEQSKTAQSFSLQEIQTPIIKRQLQALQQSGSSALSADKNKQLNTILN: 121 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSB HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG HHHHHHHHHHT GGGGS HHHHHHHHHHHH: ExpBur :beebeebbeebbeebbeebeebbebebeebbeebeebeeeeeebeeeeeebeeebbeebeebebeebeeeebebbbeebbebbeeebeeeeeeebeebbe: Contact : b bb bb b b bb b queryA 122:TMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQ: 221 :************** ************ **** * *** ****** ** ************************ * *********** * *** * * *: 8vkl_E_1 122:TMSTIYSTGKVCNPKNPQECLLLEPGLDEIMATSTDYNSRLWAWEGWRAEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANNYNDYGDYWRGDYEAEGADGYNYNRNQ: 221 SecStr :HHHHHHHT EEE TT TT EEETTTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSHHHHHHGGG B STT B HHH: ExpBur :ebeeebeebebbeeeeeeeeeebeebbeebbeeeeebeebeebbbbbbbebbeebbeebeebbebbbebbeebebebbbbebbbebebeeeeebebebee: queryA 222:LIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGLP: 321 :****** ** ************** *** ******* ******************** ***** *********** * *** *** ************: 8vkl_E_1 222:LIEDVERTFAEIKPLYEHLHAYVRRKLMDTYPSYISPTGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYPLTVPFAQKPNIDVTDAMMNQGWDAERIFQEAEKFFVSVGLP: 321 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSTTTS SSS EEGGGSSSSSSS GGGTTTT S SSS HHHHHHTT HHHHHHHHHHHHHHHT : ExpBur :bbebbeebbeebeebbebbbbbbbeebeeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbebeebbeebbbeeeeeebebbebbeeeebebeebbebbbebbeebebe: queryA 322:NMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKSI: 421 : ****** ***** * * ********** ***** ******** ****************** **********************************: 8vkl_E_1 322:HMTQGFWANSMLTEPADGRKVVCHPTAWDLGHGDFRIKMCTKVTMDNFLTAHHEMGHIQYDMAYARQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKSI: 421 SecStr : HHHHHH B S SS B S EEEEEETTEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGS GGG S SSHHHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHT: ExpBur :ebeeebeeebbbeeeeeeeebeeeeebbebbeebbbbbbbbeeebebbbebbbbbbbbbbbbbbeebebbbbebbbbbbeebbbebbbbbbbbbebbeee: Contact : b bbb b queryA 422:GLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTLY: 521 :*** ***** ******************************** ***** ******************* **************************** *: 8vkl_E_1 422:GLLPSDFQEDSETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFRGEIPKEQWMKKWWEMKREIVGVVEPLPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTIY: 521 SecStr :TSS TT HHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHT S GGGHHHHHHHHHHHTT EE SS TT SGGGSHHHHTT HHHHHHHHH: ExpBur :ebbeeeeeeeeebbbbbbbebbbebbbbbbbbbbbbebbbbbbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbebbbbeebbbebbbbbbb: queryA 522:QFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSP: 612 :************* * **************** ** ** ***** ******** ** * ****** *** *** ** ****** * ***: 8vkl_E_1 522:QFQFQEALCQAAKYNGSLHKCDISNSTEAGQKLLKMLSLGNSEPWTKALENVVGARNMDVKPLLNYFQPLFDWLKEQNRNSFVGWNTEWSP: 612 SecStr :HHHHHHHHHHHTT S GGG TT HHHHHHHHHHHHHTTSS HHHHHHHHHS SS HHHHHHTHHHHHHHHHHTSSS S SS : ExpBur :bbbbbebbbeeeeeeeebbebbbbebeebbeebbebbbbbbbebbbebbeebeeeeebebebbeebbeebbebbeeebeeeeebbeeeebe: |