CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(ACE2_HUMAN) | B 1 (D) | polymer(polypeptide(L)) [593 aa] | Angiotensin-converting enzyme 2 :ACE2_MOUSE | |
2 | b | A 1 (A) | polymer(polypeptide(L)) [201 aa] | Spike glycoprotein :SPIKE_SARS2 | 24Q(N) 27T 28F 30D(N) 31K(N) 34H(Q) 35E 38D 41Y 42Q 82M(S) 83Y(F) 330N 353K(H) 354G 355D 357R (identity: 58.8 %/84.4 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:8dma_B_1 identity=84.4% |
queryA 22:EEQAKTFLDKFNHEAEDLFYQSSLASWNYNTNITEENVQNMNNAGDKWSAFLKEQSTLAQMYPLQEIQNLTVKLQLQALQQNGSSVLSEDKSKRLNTILN: 121 :** ***** ** ***** ****************** * * * ***** *** ** ***** * ******* *** ** ** * ******: 8dma_B_1 22:EENAKTFLNNFNQEAEDLSYQSSLASWNYNTNITEENAQKMSEAAAKWSAFYEEQSKTAQSFSLQEIQTPIIKRQLQALQQSGSSALSADKNKQLNTILN: 121 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTS GGG HHHHHHHHHHT GGGGS HHHHHHHHHHHH: ExpBur :beebeebbeebbeebbebbeebbebbbeeebeebeebeeeeeebeeebeebeeebbeebeebebeebeeeebebbbeebeebbeeebeeeeeeebeebbe: Contact : b bb bb bb b bb bb queryA 122:TMSTIYSTGKVCNPDNPQECLLLEPGLNEIMANSLDYNERLWAWESWRSEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANHYEDYGDYWRGDYEVNGVDGYDYSRGQ: 221 :************** ************ **** * *** ****** ** ************************ * *********** * *** * * *: 8dma_B_1 122:TMSTIYSTGKVCNPKNPQECLLLEPGLDEIMATSTDYNSRLWAWEGWRAEVGKQLRPLYEEYVVLKNEMARANNYNDYGDYWRGDYEAEGADGYNYNRNQ: 221 SecStr :HHHHHHTT EEE TT TT EEETTTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTT SSHHHHHHTTS B SSSS B HHH: ExpBur :ebeeebeebebbeeeeeeeeeebeeebeebbeeeeebeebeebbbbbbbebbeebbeebeebbebbbebbeeeebebbbbebbeebebebeeebebebee: queryA 222:LIEDVEHTFEEIKPLYEHLHAYVRAKLMNAYPSYISPIGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYSLTVPFGQKPNIDVTDAMVDQAWDAQRIFKEAEKFFVSVGLP: 321 :****** ** ************** *** ******* ******************** ***** *********** * *** *** ************: 8dma_B_1 222:LIEDVERTFAEIKPLYEHLHAYVRRKLMDTYPSYISPTGCLPAHLLGDMWGRFWTNLYPLTVPFAQKPNIDVTDAMMNQGWDAERIFQEAEKFFVSVGLP: 321 SecStr :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSSS SSS EETTSSSSSSSS GGGTTTS S SSS HHHHHHTT HHHHHHHHHHHHHHTT : ExpBur :bbebbeebbeebeebbebbbbbbbeebeeebeeebbeebbbbbbbbbbbbbbebeebbeebbbeeeeeebebbebbeeeebebeebbebbbebbeebebe: queryA 322:NMTQGFWENSMLTDPGNVQKAVCHPTAWDLGKGDFRILMCTKVTMDDFLTAHHEMGHIQYDMAYAAQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKSI: 421 : ****** ***** * * ********** ***** ******** ****************** **********************************: 8dma_B_1 322:HMTQGFWANSMLTEPADGRKVVCHPTAWDLGHGDFRIKMCTKVTMDNFLTAHHEMGHIQYDMAYARQPFLLRNGANEGFHEAVGEIMSLSAATPKHLKSI: 421 SecStr : HHHHHH B S SS S EEEEEETTEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGS GGG S SSTTHHHHHHHHHHHHHTSHHHHHHT: ExpBur :ebeeebeeebbbeeeeeeeebeeeeebbebbeebbbbbbbbeeebebbbebbbbbbbbbbbbbbeebebbbeebbbbbbeebbbebbebbbbbbebbeee: Contact : b bbb b queryA 422:GLLSPDFQEDNETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFKGEIPKDQWMKKWWEMKREIVGVVEPVPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTLY: 521 :*** ***** ******************************** ***** ******************* **************************** *: 8dma_B_1 422:GLLPSDFQEDSETEINFLLKQALTIVGTLPFTYMLEKWRWMVFRGEIPKEQWMKKWWEMKREIVGVVEPLPHDETYCDPASLFHVSNDYSFIRYYTRTIY: 521 SecStr :TSS TT HHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHT S GGGHHHHHHHHHHHTT EE SS TT SGGGSHHHHTT HHHHHHHHH: ExpBur :ebbeeeeeeeeebbbbbbbeebbebbbbbbbbbbbbebbbbbbeeebeeeebbeebbebbbebbbbbbbeebeeebbbbbbbebbbbeebbbebbbbbbb: queryA 522:QFQFQEALCQAAKHEGPLHKCDISNSTEAGQKLFNMLRLGKSEPWTLALENVVGAKNMNVRPLLNYFEPLFTWLKDQNKNSFVGWSTDWSP: 612 :************* * **************** ** ** ***** ******** ** * ****** *** *** ** ****** * ***: 8dma_B_1 522:QFQFQEALCQAAKYNGSLHKCDISNSTEAGQKLLKMLSLGNSEPWTKALENVVGARNMDVKPLLNYFQPLFDWLKEQNRNSFVGWNTEWSP: 612 SecStr :HHHHHHHHHHHTT S GGG TT HHHHHHHHHHHTTTTSS HHHHHHHHHS SS HHHHHHTHHHHHHHHHT SSS S SS : ExpBur :bbbbbebbbebbeeeeebbebbbbebeebbeebbebbebbbbebbbebbeebeeeeebebebbeebbeebbebbeeebeeeeebbeeeebe: |