Protein Model on 3s28_B_1_Q_1 (TEMPLATE: 3s28 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FB 1 (B) polymer(polypeptide(L)) [780 aa] Sucrose synthase 1 :SUS1_ARATH
2 b Q 1 (B) non-polymer(UDP) URIDINE-5'-DIPHOSPHATE 296L 297G 302G 303G 304Q 306V 578M 579A 580R 585K 609V 647S 648Q 654N 675E 678G 679L 680T 683E
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:3s28_B_1
3s28_B_1       1:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXEVLALLSRVEAKGKGILQQNQIIAEFEALPEQTRKKLEGGPFFDLLKSTQEAIVLPPWVALAVRPRPGVWEYL: 100
SecStr          :---------------------------  TTSTTTSSSSSSSSEEE HHHHHHHTTT STTTTTT SS  SSSS  S EEE TTEE  EE SSTT  EE :    
ExpBur          :---------------------------eeeeebebebeeeeeebbeeeebeeebebeebeeebeeeeeeeeeeeebbbebbbeeebeebbbeebbeeebb:    

3s28_B_1     101:RVNLHALVVEELQPAEFLHFKEELVDGVKNGNFTLELDFEPFNASIPRPTLHKYIGNGVDFLNRHLSAKLFHDKESLLPLLKFLRLHSHQGKNLMLSEKI: 200
SecStr          : EESSSS    B HHHHHHHHHHHHHSS   TTS EEE GGG  SS    SGGGTTBHHHHHHHHHHHHHTT HHHHHHHHHHHHH EETTEEBSB TT :    
ExpBur          :bbbeeeeeeeeeeebebbebebebeeeebbeeeeeebebeeebeebebbeeeebbbebbebbbeebbeebeeeeebbeebbebbbebebeeeebbbbeeb:    

3s28_B_1     201:QNLNTLQHTLRKAEEYLAELKSETLYEEFEAKFEEIGLERGWGDNAERVLDMIRLLLDLLEAPDPCTLETFLGRVPMVFNVVILSPHGYFAQDNVLGYPD: 300
SecStr          : SHHHHHHHHHHHHHHHHHS TT BHHHHHHHHHHHTB B S SBHHHHHHHHHHHHHHHHS  HHHHHHHHHHS    EEEEE  SS   SSS TTSTT:    
ExpBur          :eebeebbebbeebeeebeeeeeebebeebbebbeebbbeebbbebbebbbebbebbbebbeebeeebbeebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbbbbb:    
Contact         :                                                                                               bb   

3s28_B_1     301:TGGQVVYILDQVRALEIEMLQRIKQQGLNIKPRILILTRLLPDAVGTTCGERLERVYDSEYCDILRVPFRTEKGIVRKWISRFEVWPYLETYTEDAAVEL: 400
SecStr          : SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT     EEEEEEE  TT TTSSTT SEEE TT SSEEEEEE  EETTEE  S   TTS GGGHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbebbbbbbbbbbbbbebbeebbeebbbebebbbbbbbbbbeebeebebeeeebebeebebbbbbbbebebeeeebeebbbbbebbebbeebbebbbebb:    
Contact         : bbb b                                                                                              

3s28_B_1     401:SKELNGKPDLIIGNYSDGNLVASLLAHKLGVTQCTIAHALEKTKYPDSDIYWKKLDDKYHFSCQFTADIFAMNHTDFIITSTFQEIAGSKETVGQYESHT: 500
SecStr          :HHH SS  SEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHT  EEEE S  HHHHSTTTTTTHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHSSEEEESSSHHHH  SSS  TTGGGS:    
ExpBur          :eeebeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeebbbbbbbbbbbbbbbeebbbebeeebeebbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbeeeeebbbbbbb:    

3s28_B_1     501:AFTLPGLYRVVHGIDVFDPKFNIVSPGADMSIYFPYTEEKRRLTKFHSEIEELLYSDVENKEHLCVLKDKKKPILFTMARLDRVKNLSGLVEWYGKNTRL: 600
SecStr          :SEEETTTEEEEE   TT TTEEE      TTT   TT TTT  GGGHHHHHHHHH S  SSSEES BS TTS EEEEE   STTTTHHHHHHHHHH HHH:    
ExpBur          :ebbbbebbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbeebbbbbeeeeebeeebbeebeebbbbeeeeeebbbbbeeeebebbbbbbbbbebbbbbbbbebbbebeeb:    
Contact         :                                                                             bbb    b               

3s28_B_1     601:RELANLVVVGGDRRKESKDNEEKAEMKKMYDLIEEYKLNGQFRWISSQMDRVRNGELYRYICDTKGAFVQPALYEAFGLTVVEAMTCGLPTFATCKGGPA: 700
SecStr          :HHH EEEEE S  SS    HHHHHHHHHHHHHHHHTT BBBEEEE     HHHHHHHHHHHHHTT EEEE  S BSS HHHHHHHHHT  EEEESSBTHH:    
ExpBur          :bebbbbbbbbbbbeeebebebbeebbeebeebbeebebebebbbbbbbbeeebbbbbbbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbbe:    
Contact         :        b                                     bb     b                    b  bbb  b                 

3s28_B_1     701:EIIVHGKSGFHIDPYHGDQAADTLADFFTKCKEDPSHWDEISKGGLQRIEEKYTWQIYSQRLLTLTGVYGFWKHVSNLDRLEARRYLEMFYALKYRPLAQ: 800
SecStr          :HH  BTTTBEEE TT HHHHHHHHHHHHHHHHH THHHHHHHHHHHHHHHHH  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeeeebbbebebeebeebbeebbebbeebeeeeebbeebbebbeebbeeebbbeebbeebbbbbbbbbbbeeebeeeeeebeebbeebbeebbeebbe:    

3s28_B_1     801:AVPLAQD---------------------------------------------------------------------------------------------: 807
SecStr          :HS    -:    
ExpBur          :ebeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123