[pdbjlvh2]Protein Model on 3s27_D_1_DA

Protein Model on 3s27_D_1_DA_1 (TEMPLATE: 3s27 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description	a(query F)
1	a	F	D 1 (D)	polymer(polypeptide(L)) [781 aa]	Sucrose synthase 1 :SUS1_ARATH
2	b		DA 1 (D)	non-polymer(UDP)	URIDINE-5'-DIPHOSPHATE	296L 302G 303G 304Q 306V 578U 579A 580R 585K 609V 647S 648Q 654N 678G 679L 680T 683E

FOCUSED TEMPLATE

MODEL[1] TEMPLATE:3s27_D_1

3s27_D_1       1:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXNEVLALLSRVEAKGKGILQQNQIIAEFEALPEQTRKKLEGGPFFDLLKSTQEAIVLPPWVALAVRPRPGVWEYL: 100
SecStr          :-------------------------- HHHHHHHHHHHHTT SEEEEHHHHHHHTTTTS TT    HHHHTGGGGEEEEEEETTEEEEEE SSTT  EEE:    
ExpBur          :--------------------------eeeeeeeebeebeeeeeebbeeeeeebbbbeebeeeeeeeeeeeeeeeebbbbbbbeeebbbbbbeebeeeebe:    

3s27_D_1     101:RVNLHALVVEELQPAEFLHFKEELVDGVKNGNFTLELDFEPFNASIPRPTLHKYIGNGVDFLNRHLSAKLFHDKESLLPLLKFLRLHSHQGKNLULSEKI: 200
SecStr          :EEESSSS EEEE HHHHHHHHHHHHTSS S TTS EEE GGGTTSS     GGGTTBHHHHHHHHHHHHTTT HHHHHHHHHHHHH EETTEEBSB TT :    
ExpBur          :bbbbeeeeeeebeebebbebbbebeeeebbeeeeeebebeeebeebeebeeeebbbebbebbbeebbeebeeeeebbeebbebbbebebeeeebbbbeeb:    

3s27_D_1     201:QNLNTLQHTLRKAEEYLAELKSETLYEEFEAKFEEIGLERGWGDNAERVLDUIRLLLDLLEAPDPCTLETFLGRVPUVFNVVILSPHGYFAQDNVLGYPD: 300
SecStr          : SHHHHHHHHHHHHHHHHHS TT BHHHHHHHHHHHTB B S SBHHHHHHHHHHHHHHHHS  HHHHHHHHHHS   SEEEEE  SS   SSS TTSTT:    
ExpBur          :eebeebbebbeebeeebeeeeeebebeebeeebeebbbbebbbebbeebbebbebbbebbeebeeebbeebbbebbebbbbbbbbbbbbbbbeebbbbbb:    
Contact         :                                                                                               b    

3s27_D_1     301:TGGQVVYILDQVRALEIEULQRIKQQGLNIKPRILILTRLLPDAVGTTCGERLERVYDSEYCDILRVPFRTEKGIVRKWISRFEVWPYLETYTEDAAVEL: 400
SecStr          : SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT     EEEEEEE  TT TTSSTT SEEE TT SSEEEEEE  EETTEE  S   TTT GGGHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbebbbbbbbbbbbbbeebeebbeebbbebebbbbbbbbbbeebeebebeeeebebeebeebbbbbbebebeeeebeebbbbbebbebbeebbeebbebb:    
Contact         : bbb b                                                                                              

3s27_D_1     401:SKELNGKPDLIIGNYSDGNLVASLLAHKLGVTQCTIAHALEKTKYPDSDIYWKKLDDKYHFSCQFTADIFAUNHTDFIITSTFQEIAGSKETVGQYESHT: 500
SecStr          :HHH SS  SEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHT EEEEE S  HHHHSTTTTTTHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHSSEEEESSSHHHH  SSS  TTGGGS:    
ExpBur          :eeebeeebebbbbbbbbbbbbbbbbbeeeebbbbbbbbbbbbbbbeebbbebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbeeeeebbbbbbb:    

3s27_D_1     501:AFTLPGLYRVVHGIDVFDPKFNIVSPGADUSIYFPYTEEKRRLTKFHSEIEELLYSDVENKEHLCVLKDKKKPILFTUARLDRVKNLSGLVEWYGKNTRL: 600
SecStr          :SEEETTTEEEEE   TT TTEEE      TTTS  TT GGG  GGGHHHHHHHHH S  SSSEES BS TTS EEEEE   STTTTHHHHHHHHHH HHH:    
ExpBur          :bbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbbbbeeeeebeeeeeeebeebbbbeeeeeebbbbbeeeebebbbbbbbbbebbbbbbbbebbbebeeb:    
Contact         :                                                                             bbb    b               

3s27_D_1     601:RELANLVVVGGDRRKESKDNEEKAEUKKUYDLIEEYKLNGQFRWISSQUDRVRNGELYRYICDTKGAFVQPALYEAFGLTVVEAUTCGLPTFATCKGGPA: 700
SecStr          :HHH EEEEE   TTS    HHHHHHHHHHHHHHHHTT TBTEEEE     HHHHHHHHHHHHHTT EEEE  S BSS HHHHHHHHHT  EEEESSBTHH:    
ExpBur          :bebbbbbbbbbbbeeebebebbeebbeebeebbeebebebebbbbbbbeeeeebbbbbbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbbe:    
Contact         :        b                                     bb     b                       bbb  b                 

3s27_D_1     701:EIIVHGKSGFHIDPYHGDQAADTLADFFTKCKEDPSHWDEISKGGLQRIEEKYTWQIYSQRLLTLTGVYGFWKHVSNLDRLEARRYLEUFYALKYRPLAQ: 800
SecStr          :HH  BTTTBEEE TT HHHHHHHHHHHHHHHHH THHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeeeebbbebebeebeebbeebbebbeebeeeeebbeebbebbeebbeeebbbeebbeebbbbbbbbbbbeebbeeeeeebeeebeebbeeebeebbe:    

3s27_D_1     801:AVPLAQD---------------------------------------------------------------------------------------------: 807
SecStr          :HS    -:    
ExpBur          :ebeeee-:

Protein Model on 3s27_D_1_DA_1 (TEMPLATE: 3s27 )

Input Residue Numbers for Focused Sites