Protein Model on 6y79_LA_1_BB_1 (TEMPLATE: 6y79 )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FLA 1 (4) polymer(polypeptide(L)) [485 aa] Subunit NU4M of NADH:Ubiquinone Oxidoreductase (Complex I) :S5TMP9_YARLL
2 b BB 1 (J) non-polymer(LMN) Lauryl Maltose Neopentyl Glycol 177F 184V 205D 209I
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:6y79_LA_1
6y79_LA_1      1:XFLTSILLSSLYLFNRILAWQGNVKHFYLFASNLLLLFIVVLYINFNTFSNSFQFNFELFNSLNPFGLSNSDISNGLLFGIDGLSLTFILLTVLLIPLTL: 100
SecStr          :- HHHHHHHHHHHHHHHHHH S  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  TT  S  S EEES SS SSS    SS  SEEE   HHHHHHHHHHHTTHHHHH:    
ExpBur          :-eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebbeebeeebeeeeeebeebeeebeeeeeebeeeebeebeeeeeeebeeeeeebbebbbbbbbbbbbebbbebbbbbb:    

6y79_LA_1    101:LGNWYNINFNSNLYYTLVLAIGLVILLNFWALDYISFYILFEATLPLLFILIHIYGSSDSERASFYVLMFTLSGSLFMLLSIVVISIVLNTTNFINHNLF: 200
SecStr          :HHTTTT  SSHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTB SHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSS   SSSTTT :    
ExpBur          :bbbbeebeeebeebbebbbebbebbbebbbbbbbebbbebbeebbeebeebbeebeeeebeebbeebeeebeebbeebeebbeebeeebeebbbeebeee:    
Contact         :                                                                            b      b                

6y79_LA_1    201:VLSLDLQTIIWLGLFIAIMVKTPLFPIHVWLPVVHSESPLAGSMILAGLILKLALYAILRLLLPLLCEAQILYTPMIYIISLLTIILTSLATLRQIDLKV: 300
SecStr          :   HHHHHHHHHHHHHHHHHHTT GGG  HHHHHHHTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS  BSHH:    
ExpBur          :ebeeeebbebbebbbebbbbbbbbeeebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbeeebeebbebbbebbeebbeebeeeeebbb:    
Contact         :    b   b                                                                                           

6y79_LA_1    301:IIAYSSISHMGIAILGVCSNTSLGIYGSIVLGVAHGFVSPALFLIVGGILYDRYHIRIVNYYKGLTTYMPQLATYIIILSFANIGTPLTGNFTGEFLSLQ: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTHHHH   BGGG   TTTT HHHHHHHHHHHHHHHT SSSSHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbebeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebeeebebeebebbeeebeebbebbeebbebbbbeeebbbebbbebbbe:    

6y79_LA_1    401:GGFIRNPIIGGISCISVLLAAIYQLKLTNKLTGGISSIYMHRTNDVTIREKFIMNILIISTLIIGICPQIMYNLLYWTVNNYIYII--------------: 486
SecStr          :HHHHH HHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHSSS  SSS       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGGGHHHHHHHHHHT   -:    
ExpBur          :bbeeeeeeebeebeebeebbbebbeebbeebbeeebbeebeeeeebeebbeebbeebbebbeebbeeeeebeebbeebbeebeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123