Protein Model on 5cns_B_1_L_1 (TEMPLATE: 5cns )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FB 1 (B) polymer(polypeptide(L)) [734 aa] Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha :RIR1_ECOLI
2 b L 1 (A) non-polymer(DTP) 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE 249S 292C 293S
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:5cns_B_1
5cns_B_1       1:XXXNLLVTKRDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPP: 100
SecStr          :---  EEE TTS EEE  HHHHHHHHHHHTTT SS  HHHHHHHHT    TTEEHHHHHHHHHHHHHHT  SS TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSS  :    
ExpBur          :---eeebeeeeeeeeeeeeeebeebbeebbeebeeeebeebeeebeeeeeeebeeeebbeebbebbbebbeeebbbbbebbbbbbbbbbbeebbeeeebe:    

5cns_B_1     101:ALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAV: 200
SecStr          : HHHHHHHHHHTTSS THHHHHS HHHHHHHHHH  GGGGGG  HHHHHHHHHTTS B TTT  B   HHHHHHHHHHHHTTTS TTTHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbeebbeeeebbebbeeebeeebbeebeebbebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeebbebbeebbebb:    

5cns_B_1     201:STFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRALGSPIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGG: 300
SecStr          :HTTSEE  HHHHHHTTSSS    SEEEEE  SSHHHHHHHHHHHHHHHTTT EEEEE TTS  TT EETTTTEE   SHHHHHHHHHHHHTSEETTTEE :    
ExpBur          :bebebbbbbbbbbbbbbeebbbbbbbbbbbbeeeebbebbbebbeebbeebbbbbbbbbebebeebeeeeeeeebebbbeebeebbebbeeeebeebeeb:    
Contact         :                                                b                                          bb       

5cns_B_1     301:AATLFYPMWHLEVESLLVLKNNRGVEGNRVRHMDYGVQINKLMYTRLLKGEDITLFSPSDVPGLYDAFFADQEEFERLYTKYEKDDSIRKQRVKAVELFS: 400
SecStr          : EEEEEETTBTTHHHHTTTT SSS GGG  TTSEEEEEE HHHHHHHHTT EEEEE GGGSTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH TTS EEEEEHHHHHH:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbbbeebbbbbbeeeeeeebbeebbbbbbbbebbbebbeeeeebbbbbbeebeebbebbbeeeeebeebbeebbeeeebeeeebebeebbe:    

5cns_B_1     401:LMMQERASTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPAIAPVRQSNLCLEIALPTKPLNDVNDENGEIALCTLSAFNLGAINNLDELEELAILAVRALDALLDYQDYPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHS EEEEETTHHHHTSSB TTTS      SSS      B  SSTT SS B EEEEEEEEETTS SSGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SS:    
ExpBur          :bbbebbeeebebbbbbbbbbbebbbbebeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeeeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeebeebbebbbbbbbbbbebbebeb:    

5cns_B_1     501:PAAKRGAMGRRTLGIGVINFAYYLAKHGKRYSDGSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPWFNETTYAKGILPIDTYKKDLDTIANEPLHYDWE: 600
SecStr          :HHHHHHHHHH  EEEEEE HHHHHHHTT  STTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   TTGGGBTTTTT  HHHHS GGGGGT      S HH:    
ExpBur          :ebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeeeebbebbbebbbbbbbbbbebbbebbeeeeebebbebbbbeebebbbeebeeebeebbeeeeebebe:    

5cns_B_1     601:ALRESIKTHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYVSIKASKDGILRQVVPDYEHLHDAYELLWEMPGNDGYLQLVGIMQKFIDQSISANTNYD: 700
SecStr          :HHHHHHHHH  S S  B B   TTGGGTTT   TT   SSSEEEE  SSS EEEE TTHHHHTTT   GGG S SHHHHHHHHHHHHH SS B   EEE :    
ExpBur          :ebbebbeeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbebebebeeeebebbbbebeebeebbbbbeebeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

5cns_B_1     701:PSRFPSGKVPMQQLLKDLLTAYKFGVKTLYYQNTRDG---------------------------------------------------------------: 737
SecStr          :GGGSGGG   HHHHHHHHHHHHHTT  EE  EEE  -:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeebbebbebbbebbbbbbbebeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123