Protein Model on 4m3w_A_1_D_1 (TEMPLATE: 4m3w )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [903 aa] DNA polymerase :DPOL_BPR69
2 b D 1 (A) non-polymer(ATP) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE 411D 412L 413T 414S 415A 416Y 417P 482R 560K 564N 622T 623D
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4m3w_A_1
4m3w_A_1       1:MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYE: 100
SecStr          :   EEEEEEEETTEEEEEEE TTS EEEEEE    EEEEE  TTS  SEEETTS EEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHT   BS  SHHHHHHHHH  S :    
ExpBur          :eeebbbbbbeeeebbbbbbbbeebeeeeeeeebebbbbbebeeeeeeebebbeeebbeeeebeebeebeebeeebeeeeebbbbbebbbbbbbbeebeee:    

4m3w_A_1     101:IKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLME: 200
SecStr          :    GGGS EEEEEEE   TTSS  TTT  S   EEEEEETTTTEEEEEEE EETTEE     HHHHHS GGGTS    HHHHTTEEEEEESSHHHHHHH:    
ExpBur          :bebeeeebbbbbbbbbbbbeeeebebbebebbbbbbbbbbeeeeebbbbbbbebeeeebeebeeeebeeeeeeebbebeeebbeebeeeebeebeebbee:    

4m3w_A_1     201:YLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVIENMYGSREIITLFGISVLDYIDLYKKFSFTNQPSYSLDYISEFELNV: 300
SecStr          :HHHHHHHT  SEEE SSTTTTHHHHHHHHHHHHH HHHHGGGSTTS EEEEEE  SSS EEEEEETT EE  HHHHHHHHS    S   HHHHHHHHH  :    
ExpBur          :bbebbeeebbbbbbbbebeebbbbbbbbbbeeeeeeeebeebbebeebeeeeeeeeeeeebbbebbbbbbbbbbebbeebbebebbbbebebbbeebbee:    

4m3w_A_1     301:GKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVFSPIKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPVQPYPGAFVKEPI: 400
SecStr          :     SS GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHTS GGGGG HHHHHHHHHHHHHHHTTEE                B    :    
ExpBur          :eebeeeeeebebbeeebbbbbbbbbbbbbbbeebeebbebbebbbebbbebbbbbebbeeeeebbbbbbbbbbeeeeebbbeeeeeeeeeeeeeebeebe:    

4m3w_A_1     401:PNRYKYVMSFDLTSAYPSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIK: 500
SecStr          : EE SSEEEEEETTHHHHHHHHHT  TT EEEE     HHHHHTT S  S SSSEE TTSEEE SSS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeebebbbbbebebbebbbbbbbbbbbbbbeeebeeeeeeebbeeebeebbeeebbbbebbbbeeeeebbbbebbeebbeebeeebebbbbbbebbbebe:    
Contact         :          bbbbbbb                                                                b                  

4m3w_A_1     501:EALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKALINGLAGALGNVWFRYYDLRNATAITTFGQMALQWIERK: 600
SecStr          :HHTTS  SS        TTS   HHHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT TTSTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeeeeeeeeeebbebebeeebeeeeeeebeebbeebbeebbeebeeeeebbebbbbbbeebbeebbebbeebebbbbbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                                                           b   b                                    

4m3w_A_1     601:VNEYLNEVCGTEGEAFVLYGDTDSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGG: 700
SecStr          :HHHHHHHHTT SS   EEE BSSEEEEE HHHHHHH GGG SSHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHT SS    EEEEEEE   TTS    E:    
ExpBur          :bbebbbeebeeeeeebbbbbbeebbbbbbeebbeeeeeeebeebeebbeebbebbeeebeebbeebbeebbebbbbeebbbebebbbbbbbeeeeebbbb:    
Contact         :                     bb                                                                             

4m3w_A_1     701:FWTGKKRYALNVWDMEGTRYAEPKLKIMGLETQKSSTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASVSSANNIAKYDVGGFPGPK: 800
SecStr          :EEEETTEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEESSGGG TTS HHHHHHHHHHHHHHHHT HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHH EEEE  STGGGEETTEE TT:    
ExpBur          :bbebeeebbbbbbbbeebebbeeebbbeebbbeeeebbebbeebbeebbebbbbebeebbbeebeebeeebeeeebbbbbebeebeebeebeeeeeebee:    

4m3w_A_1     801:CPFHIRGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEKVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEKTFIKPLEGFTSAAKLDYEKKASLFDM: 900
SecStr          :  HHHHHHHHHHHHTTT SSS    TT EEEEEEB TT TT SSEEEEETTS   HHHHHHHHHHB HHHHHHHHTHHHHHHHHHHHT  SS    GGGG:    
ExpBur          :beeebebbbbbeeebeeeeebeebeeeebbbbbbbeeebebebebbbbbbeeebbeebeeebeeebbbeebbeebbbebbeebbebbebebeeeeeeeee:    

4m3w_A_1     901:FDF-------------------------------------------------------------------------------------------------: 903
SecStr          :S -:    
ExpBur          :ee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123