Protein Model on 3lzi_A_1_D_1 (TEMPLATE: 3lzi )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FA 1 (A) polymer(polypeptide(L)) [903 aa] DNA polymerase :DPOL_BPR69
2 b D 1 (A) non-polymer(DTP) 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE 411D 412L 413T 414S 415L 416Y 417P 482R 560K 564N 622T 623D
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:3lzi_A_1
3lzi_A_1       1:MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYE: 100
SecStr          :   EEEEEEE SS EEEEEE TTS EEEEEE    EEEEE  SSS  S EETTS BEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHT   BS  SHHHHHHHHH  S :    
ExpBur          :eeebbbbbbeeeebbbbbbbbeebeeeeeeeebebebbbeeeeeeeeebebbeeebbeeeebeebeebeebeeebeeeeeebbbbebbbbbbbbeebeee:    

3lzi_A_1     101:IKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLME: 200
SecStr          :    GGGS EEEEEEE   TTSS  TTT  S   EEEEEETTTTEEEEEEE EETTEE     HHHHHS GGGTS    HHHHTTEEEEEESSHHHHHHH:    
ExpBur          :beeeeeebbbbbbebbbbbeeeebebeebebbbbbbbbbbeeeeebbbbbbbebeeeebeebeeeebeeeeeeebbebeeebbeebeeeebeebeebbee:    

3lzi_A_1     201:YLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVIENMYGSREIITLFGISVLDYIDLYKKFSFTNQPSYSLDYISEFELNV: 300
SecStr          :HHHHHHHT  SEEE SSTTTTHHHHHHHHHHHHH HHHHGGGSTTS EEEE  B SS B  EEEETT EE  HHHHHHHHS    S   HHHHHHHHH  :    
ExpBur          :bbebbbeebbbbbbbbebeebbbbbbbbbbeeeeeeeebeebbebeebeeeeeeeeeeeebebebbbbbbbbbbebbeebbeeebbbbebebbbeebbee:    

3lzi_A_1     301:GKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVFSPIKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPVQPYPGAFVKEPI: 400
SecStr          :     SS GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHTS GGGGG HHHHHHHHHHHHHHHTTEE                B    :    
ExpBur          :eebeeeeeebebbeeebbbbbbbbbbbbbbbbebbebbebbebbbebbbebbbbbebbeeeeebbbbbbbbbbeeeeebbbeeeeeeeeeeeeeebeebe:    

3lzi_A_1     401:PNRYKYVMSFDLTSLYPSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIK: 500
SecStr          : EE SSEEEEEETTHHHHHHHHHT  TT EEEE     HHHHHTT S  S SSSEE TTSEEE SSS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeebebbbbbbbebbebbbbbbbbbbbbbeeeebeeeeeeebbeeebeebbeeebbbbebbbbeeeeebbbbebbeebbeebeeebebbbbbbebbbebe:    
Contact         :          bbbbbbb                                                                b                  

3lzi_A_1     501:EALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKLLINSLAGALGNVWFRYYDLRNATAITTFGQMALQWIERK: 600
SecStr          :HHTTS  SS        TTS   HHHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTSTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeeeeeeeeeebbeeebeeebeeebeeebeebbeebbeebbeebeeeeebbebbbbbbeebbeebbebbeebebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                                                           b   b                                    

3lzi_A_1     601:VNEYLNEVCGTEGEAFVLYGDTDSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGG: 700
SecStr          :HHHHHHHHTT SS   EEEEETTEEEEE HHHHHHH STT SSHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHTT SS    EEEEEEE   TTS    E:    
ExpBur          :bbebbbeebeeeeeebbbbbbebbbbbbbeebbeeebeeebeebeebbeebbebbeeebbebbeebbeebbebbbbeeebbebebbbbbbbeeeeebbbb:    
Contact         :                     bb                                                                             

3lzi_A_1     701:FWTGKKRYALNVWDMEGTRYAEPKLKIMGLETQKSSTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASVSSANNIAKYDVGGFPGPK: 800
SecStr          :EEEETTEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEESSGGG TTS HHHHHHHHHHHHHHHHT HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHH EEEE   HHHHBSSSSB TT:    
ExpBur          :bbebeeebbbbbbbbeebebeeeebbbeebebeebebbebbeebbeebbebbbbebeebbbeebeebeeebeeeebeebbebeebeebeeeeeeeeebee:    

3lzi_A_1     801:CPFHIRGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEKVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEKTFIKPLEGFTSAAKLDYEKKASLFDM: 900
SecStr          :  HHHHHHHHHHHHTSS TTS    TTSEEEEEEB TT TT SSEEEEETTS   HHHHHHHHHHB HHHHHHHHTHHHHHHHHHHTT  SS    GGGS:    
ExpBur          :beeebebbbbbeeebeeeeebeebeeeebbbbbbbeeebebebebbbbbbeeebbeebeeebeeebbbeebbeebbbebbeebbebbebebeeeeeeeee:    

3lzi_A_1     901:FDF-------------------------------------------------------------------------------------------------: 903
SecStr          :  -:    
ExpBur          :ee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123