Protein Model on 6l7p_F_1_KB_1 (TEMPLATE: 6l7p )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FF 1 (F) polymer(polypeptide(L)) [646 aa] NADH dehydrogenase subunit 5 :Q8DKX9_THEEB
2 b KB 1 (F) non-polymer(AJP) Digitonin 29F 32T 33T 36L 40S
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:6l7p_F_1
6l7p_F_1       1:MEPLYQYAWLIPVLPLLGALIVGFGLIAFSETTSKLRRPSAIFIMALMAIAMGHSLTLFWSQVQGHLPYTQMIEWAAAGNLHIAMGYVIDPLAALMLVIV: 100
SecStr          : HHHHHT SSTTTHHHHHHHHHHHHHTTTSSSTTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE S  SS   EEEEEE HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeebeebeebbeebeebbeebeebeeeeeeeeeeeeeeebeebbebbeebbeebeebeebbeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebbebbbebbbbbbbbbb:    
Contact         :                            b  bb  b   b                                                            

6l7p_F_1     101:TTVAFLVMLYSDGYMAHDPGYVRFFAYLSLFGSSMLGLVVSPNLVQVYIFWELVGMCSYLLIGFWYDRKSAAEAAQKAFVTNRVGDFGLLLGMVGLFWAT: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHTSS S  HHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SS   SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH :    
ExpBur          :bebbebbbebbeebbeeeebbbebbbebbebbbbbbbbbbbbbbebbbeebeebbebbeebbebeeeeeebeebbeebeebbeebbebbeebeebbeeeb:    

6l7p_F_1     201:GTFDFAGMGDRLTELVNTGLLSPSLAAILAILVFLGPVAKSAQFPLHVWLPDAMEGPTPISALIHAATMVAAGVFLIARMFPVFEQLPQVMTTIAWTGAF: 300
SecStr          :   SHHHHHHHHHHHHHTT S HHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SSS THHHHHHSS HHHHHHHTTTTSHHHHHHHHHHTHHHHTS SHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeebeebbeebeebeeeeeeeeeebbeebebbbebbbbbbbbeeebbbbbebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebeebbeebbebbbe:    

6l7p_F_1     301:TAFMGATIAITQNDIKKSLAYSTISQLGYMVMGMGVGAYSAGLFHLMTHAYFKAMLFLGSGSVIHSMEGVVGHNPDLAQDMRYMGGLRKYMPITGATFLV: 400
SecStr          :HHHHHHHHSSS   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS S STTTS SSS    TTT HHHHHHHHH:    
ExpBur          :bbebbbebbebbeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeebbebbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbebbbbeeeebbeebebbbbbeeebeebbebbee:    

6l7p_F_1     401:GCLAISGVPPFAGFWSKDEILGAVFHANPAMWLLTWLTAGLTAFYMFRMYFMTFEGKFRNVPPERQEHHDHHSHHAAVPHESPWTMTLPLVVLAIPSTLI: 500
SecStr          :HHHHTT SSS HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSS      TTS   S SSS   SS     SSTHHHHHHTTHHHHHH:    
ExpBur          :bbebbbbbeeebbbbbbbebbbbbeeeeeebbeebeebbbebbbbbbbbbbbbbeeeeeebeeeeeeeeeeeeeebeebeebeebbbebbeebeeebeeb:    

6l7p_F_1     501:GFVGTPFNNLFEVFIHAPGXXXXXXXXXDLTEFLILGGSSVGIGLMGITVAYLMYLKGTPSPQAIAKAIQPLYQFSLHKWYFDELYEAVFIKGCRRLARQ: 600
SecStr          :HHHT TTT HHHHHS    ---------  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTT SS HHHHHHH SHHHHHHHSSSS HHHHTHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :beebbeeebebeeebeeee---------eeeeeeebbeebeebbeebeeebeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeebeebeeeeeeeeeeeeeeeeee:    

6l7p_F_1     601:VLEVDYNVVDGVVNLTGFVTMVTGEGLKYLQNGRAQFYALIVLLAVLGFVIFSVQ---------------------------------------------: 655
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123