[pdbjlvh2]Protein Model on 5cns_D_1_AA

Protein Model on 5cns_D_1_AA_1 (TEMPLATE: 5cns )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description	a(query F)
1	a	F	D 1 (D)	polymer(polypeptide(L)) [734 aa]	Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha :RIR1_ECOLI
2	b		AA 1 (D)	non-polymer(DTP)	2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE	232D 233S 234L 261I 262R 268I 269R 275H 276T 281F

FOCUSED TEMPLATE

MODEL[1] TEMPLATE:5cns_D_1

5cns_D_1       1:XXXNLLVTKRDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPP: 100
SecStr          :---  EEE TTS EEE  HHHHHHHHHHHTTT SS  HHHHHHHTT    TTEEHHHHHHHHHHHHHHT  SS TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSS  :    
ExpBur          :---eeebeeeeeeeeeeeeeebeebbeebbeebeeeebeebeeebeeeeeeebeeeebbeebbebbbeebeeebbbbbebbbebbbbbbbeebbeeeebe:    

5cns_D_1     101:ALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAV: 200
SecStr          : HHHHHHHHHHTTSS THHHHHS HHHHHHHHTT  GGGGGG  HHHHHHHHHTTS B TTT  B   HHHHHHHHHHHHTTTS TTTHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbeebbeeeebbebbeeebeeebbeebeebbebeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeebbebbeebbebb:    

5cns_D_1     201:STFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRALGSPIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGG: 300
SecStr          :HTTSEE  HHHHHHTTSSS    SEEEEE  SSHHHHHHHHHHHHHHHTTT EEEEE TTS  TT EETTTTEE   SHHHHHHHHHHHHTSEETTTEE :    
ExpBur          :bebebbbbbbbbbbbbbeebbbbbbbbbbbbeeeebbebbbebbeebbeebbbbbbbbbbbebeebeeeeeeeebebbbeebeebbebbeeeebeebeeb:    
Contact         :                               bbb                          bb     bb     bb    b                   

5cns_D_1     301:AATLFYPMWHLEVESLLVLKNNRGVEGNRVRHMDYGVQINKLMYTRLLKGEDITLFSPSDVPGLYDAFFADQEEFERLYTKYEKDDSIRKQRVKAVELFS: 400
SecStr          : EEEEEETTBTTHHHHTTSSSS S GGG  TTSEEEEEE HHHHHHHHTT EEEEE TTSSTTHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH SSS EEEEEHHHHHH:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbbbeebbbbbbeeeeeeebbeebbbbbbbbebbbebbeeeeebbbbbbeebeebbebbbeeeeebeebbeebbeeeebeeeebebeebbe:    

5cns_D_1     401:LMMQERASTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPAIAPVRQSNLCLEIALPTKPLNDVNDENGEIALCTLSAFNLGAINNLDELEELAILAVRALDALLDYQDYPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHS EEEEETTHHHHTSSB TTTS      SSS      B  SSTT SS B EEEEEEEEETTS SSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SS:    
ExpBur          :bbbebbeeebebbbbbbbbbbebbbbeeeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeeeebeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeebeebbebbbbbbbbbbebbebeb:    

5cns_D_1     501:PAAKRGAMGRRTLGIGVINFAYYLAKHGKRYSDGSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPWFNETTYAKGILPIDTYKKDLDTIANEPLHYDWE: 600
SecStr          :HHHHHHHHHH  EEEEEE HHHHHHHTT  SSSSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   TTGGGBTTTTT  HHHHS GGGGGT      S HH:    
ExpBur          :ebbeebbebbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeeeebbebbbebbbbbbbbbbebbbebbeeeeebebbebbbbeebebbbeebeeebeebbeeeeeeebe:    

5cns_D_1     601:ALRESIKTHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYVSIKASKDGILRQVVPDYEHLHDAYELLWEMPGNDGYLQLVGIMQKFIDQSISANTNYD: 700
SecStr          :HHHHHHHHH  S S  B B   TTGGGTTT   TT   SSSEEEE  SSS EEEE TTHHHHTTT   GGG S SHHHHHHHHHHHTT SS B   EEE :    
ExpBur          :ebbebbeeebbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbebebebeeeebebbbbebeebeebbbbbbebeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

5cns_D_1     701:PSRFPSGKVPMQQLLKDLLTAYKFGVKTLYYQNTRDG---------------------------------------------------------------: 737
SecStr          :GGGSGGG   HHHHHHHHHHHHHTT  EE  EEE  -:    
ExpBur          :eeebeeeeeeeeebbebbebbbebbbbbbbbbeeee-:

Protein Model on 5cns_D_1_AA_1 (TEMPLATE: 5cns )

Input Residue Numbers for Focused Sites