Protein Model on 4erp_D_2_L_2 (TEMPLATE: 4erp )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:2]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 2 (D) polymer(polypeptide(L)) [736 aa] Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha :RIR1_ECOLI
2 b L 2 (D) non-polymer(ATP) ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE 7V 9K 10R 11D 15E 16R 17I 18N 21K 22I 25V 55T 59H 87F 91K
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4erp_D_2
4erp_D_2       1:XXQNLLVTKRDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPP: 100
SecStr          :--   EEE TTS EEE  HHHHHHHHHHHHTT SS  HHHHHHHHT    SS  HHHHHHHHHHHHHHT  TT TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSS  :    
ExpBur          :--eeeebeeeeeeeeeeeeeeeeeebeebbeebeebeeeebeeebeeeeeebbeebebbeebbebbbebbeeebbbbbebbbbbbbebbbeebbeeeebe:    
Contact         :      b bbb   bbbb  bb  b                             b   b                           b   b         

4erp_D_2     101:ALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAV: 200
SecStr          : HHHHHHHHHTTTSS THHHHHS HHHHHHHHHH  GGGGGG  HHHHHHHHHHTS B TTT  B   HHHHHHHHHHHTTSSS HHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbeebbeeeebbebbeeebeeebbeebeebbebebbeebbbbbbbbbbeebbbbeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeebbebbeebbebb:    

4erp_D_2     201:STFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRALGSPIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGG: 300
SecStr          :HTTSEE  HHHHHHTTSS      EEEEE  SSHHHHHHHHHHHHHHHHS  EEEEE TTS  TT EETTTTEE   SHHHHHHHHHHHTTTSSSSSS  :    
ExpBur          :bebebbbbeebbebbbbeeeebbebbbbbbbbeeebbebbbebbeebbeeebebbbbbbebebeebeeeeeeeebebbbeebeebbebbbeebeebeeee:    

4erp_D_2     301:AATLFYPMWHLEVESLLVLKNNRGVEGNRVRHMDYGVQINKLMYTRLLKGEDITLFSPSDVPGLYDAFFADQEEFERLYTKYEKDDSIRKQRVKAVELFS: 400
SecStr          : EEEEEETTBTTHHHHHGGG SSS GGG   SSEEEEEE HHHHHHHHTT B  BB TTTSSSHHHHHHH TTHHHHHHHHHHT SSS  B  BHHHHHH:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbbbeebbbbbbeeeeeeebbeebbbbbbbbebbbebbeeeeebbbbbbeebeebbebbbeebeebeebbeebbeeeebeeeebebeebbe:    

4erp_D_2     401:LMMQERASTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPAIAPVRQSNLCLEIALPTKPLNDVNDENGEIALCTLSAFNLGAINNLDELEELAILAVRALDALLDYQDYPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHS  EEEEHHHHHHSSSS TTTS      TTS         SSTT SS    B  EEEEEGGG SSGGGHHHHHHHHHHHHHHHTTTS  SS:    
ExpBur          :ebbebbeeebebbbbbbbbbbebbbbbeeebbbbbbbbebbbbbbbeebeeeebeebbbbbbbbbbbbbeebeebeebeebbbbbbbbbbebbebbebeb:    

4erp_D_2     501:PAAKRGAMGRRTLGIGVINFAYYLAKHGKRYSDGSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPWFNETTYAKGILPIDTYKKDLDTIANEPLHYDWE: 600
SecStr          :HHHHHHHHHH   EEEEE HHHHHHHTS  SSS THHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   TTTTSSTTTTT  TTSSS GGGGGG      S SH:    
ExpBur          :ebbeebbebbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebebbebbbebbbbbbbbbbebbbebbeeeeebeebebbbbeebebbbeeeeeebeebbebeeebebe:    

4erp_D_2     601:ALRESIKTHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYVSIKASKDGILRQVVPDYEHLHDAYELLWEMPGNDGYLQLVGIMQKFIDQSISANTNYD: 700
SecStr          :HHHHHHHHT  S S  B B   SHHHHHTT  SSSS  S SEEEE  SSS EEEE TTHHHHTTT   TTT S HHHHHHHHHHHHTT SS B  B  B :    
ExpBur          :ebeeebeeebbbbbbbbbbbebeebbbbbbbbebbbbbeebeeeeeeeeeebebbbbebeebeebbbbbeebeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

4erp_D_2     701:PSRFPSGKVPMQQLLKDLLTAYKFGVKTLYYQNTRDGA--------------------------------------------------------------: 738
SecStr          :GGGSGGGS  HHHHHHHHHHHHHTT  EEB   B   -:    
ExpBur          :beeeeeeeeeeeebbebbebbbebbbbbbbebeeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123