Protein Model on 4erm_D_1_S_1 (TEMPLATE: 4erm )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FD 1 (D) polymer(polypeptide(L)) [733 aa] Ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit alpha :RIR1_ECOLI
2 b S 1 (C) non-polymer(DTP) 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE 249S 292C
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:4erm_D_1
4erm_D_1       1:XXXXLLVTKRDGSTERINLDKIHRVLDWAAEGLHNVSISQVELRSHIQFYDGIKTSDIHETIIKAAADLISRDAPDYQYLAARLAIFHLRKKAYGQFEPP: 100
SecStr          :---- EEE TTS EEE  HHHHHHHHHHHHTT SS  HHHHHHHHT    TTEEHHHHHHHHHHHHHHT BTTBTTHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSSS  :    
ExpBur          :----eebeeeeeeeeeeeeeebeebbeebbeebeeeeeeebeeebeeeeeeebeebebbeebbebbbebbeeebbbbbebbbebbbbbbbeeebeeeebe:    

4erm_D_1     101:ALYDHVVKMVEMGKYDNHLLEDYTEEEFKQMDTFIDHDRDMTFSYAAVKQLEGKYLVQNRVTGEIYESAQFLYILVAACLFSNYPRETRLQYVKRFYDAV: 200
SecStr          : HHHHHHHHHHHTSS THHHHHS HHHHHHHTTT  GGGGGGS HHHHHHHHHTTS B TTT  B   HHHHHHHHHHHHSTTS HHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbeebbeeebbbebbeeebeeebbeebeebbebeebeebbbbbbbbbbbebbbbeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeebbebbeebbebb:    

4erm_D_1     201:STFKISLPTPIMSGVRTPTRQFSSCVLIECGDSLDSINATSSAIVKYVSQRAGIGINAGRIRALGSPIRGGEAFHTGCIPFYKHFQTAVKSCSQGGVRGG: 300
SecStr          :TTTSEE  HHHHHHTTSS      EEEE   SSHHHHHHHHHHHHHHHTTT EEEE GGGS  TT EEGGGTEE   SHHHHHHHHHHHSSSSSTTTSS :    
ExpBur          :bebebbbbeebbebbbbeeeebbbbbbbbbbeeeebbebbbebbeebbebebbbbbbbbebbbeebeeeeeeeebebbbebbeebbebbbeebeeeeeee:    
Contact         :                                                b                                          b        

4erm_D_1     301:AATLFYPMWHLEVESLLVLKNNRGVEGNRVRHMDYGVQINKLMYTRLLKGEDITLFSPSDVPGLYDAFFADQEEFERLYTKYEKDDSIRKQRVKAVELFS: 400
SecStr          : BEEEEETTBTTHHHHTTSS SSS GGG  TTSEEEEEE HHHHHHHHTT EEE B TTTSTTTTHHHHS HHHHHHHHHHHHH TTS   EEEHHHHHH:    
ExpBur          :ebbbbbbbbbbbbeebbebbeeeeeeeebbeebbbbbbbbebbbbbbeeeeebbbbbbeebeebbebbbeeeeebeebbeebbeeeebebeebebeebbe:    

4erm_D_1     401:LMMQERASTGRIYIQNVDHCNTHSPFDPAIAPVRQSNLCLEIALPTKPLNDVNDENGEIALCTLSAFNLGAINNLDELEELAILAVRALDALLDYQDYPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHTS EEEEEHHHHHHSSSB TTTS      TTS      B  SSTT SS B  B  EEEEETTT SSGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHS  SS:    
ExpBur          :ebbebbeeebebbbbbbbbbbebbbbbeeebbbbbbbbbbbbbbbbeebeeeebeebbbbbbbbbbbbbeebeebeebeebbbbbbbbbbbbbebbebeb:    

4erm_D_1     501:PAAKRGAMGRRTLGIGVINFAYYLAKHGKRYSDGSANNLTHKTFEAIQYYLLKASNELAKEQGACPWFNETTYAKGILPIDTYKKDLDTIANEPLHYDWE: 600
SecStr          :HHHHHHHHHH   EEEEE HHHHHHHTT  SSS TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   TTGGGBGGGGT  TTTSS GGGGGT      S HH:    
ExpBur          :ebbeebbebbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebebbebbbebbbbbbbbbbebbbebbeeeeebebbebbbbeeeebbbeebeeebeebbebeeebebe:    

4erm_D_1     601:ALRESIKTHGLRNSTLSALMPSETSSQISNATNGIEPPRGYVSIKASKDGILRQVVPDYEHLHDAYELLWEMPGNDGYLQLVGIMQKFIDQSISANTNYD: 700
SecStr          :HHHHHHHHH  SSS    B   SHHHHHTT  STTS  SSTEEEEE SSSEEEEE TTHHHHTTT   TTTSS STTHHHHHHHHHTT SS B   EEE :    
ExpBur          :ebbeebeeebbbbbbbbbbbebebbbbbbbbbebbbbbebebeeeebeeeebebbbbeeeebeebbbbbeebeebebbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbb:    

4erm_D_1     701:PSRFPSGKVPMQQLLKDLLTAYKFGVKTLYYQNTRDG---------------------------------------------------------------: 737
SecStr          :TTSSGGG   HHHHHHHHHHHHHTT  EE  EEE  -:    
ExpBur          :eeeeeeeeeeeeebbebbebbbebbbbbbbebeeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123