[pdbjlvh2]Protein Model on 3lds_A_1_D

Protein Model on 3lds_A_1_D_1 (TEMPLATE: 3lds )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA]

DOWNLOAD:

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:1]

MOLECULES						contact sites
model	mark	query	asym_id oper (auth_asym_id)	type	description	a(query F)
1	a	F	A 1 (A)	polymer(polypeptide(L)) [903 aa]	DNA-directed DNA polymerase :DPOL_BPR69
2	b		D 1 (A)	non-polymer(DTP)	2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE	411D 412L 413T 414S 415L 416Y 482R 486K 560K 564N 622T 623D

FOCUSED TEMPLATE

MODEL[1] TEMPLATE:3lds_A_1

3lds_A_1       1:MKEFYLTVEQIGDSIFERYIDSNGRERTREVEYKPSLFAHCPESQATKYFDIYGKPCTRKLFANMRDASQWIKRMEDIGLEALGMDDFKLAYLSDTYNYE: 100
SecStr          :   EEEEEEEETTEEEEEEE SSS EEEEEE    EEEEE  SSS   EEETTS EEEEEE SSHHHHHHHHHHHHHHT   BS   HHHHHHHHH  S :    
ExpBur          :eeebbbbbbeeeebbbbbbbbeeeeeeeeeeebebebbbeeeeeeeeeeebbeeebbeeeebeebeebeebbeebeeeeebbbbbeebbbbbbbeebeee:    

3lds_A_1     101:IKYDHTKIRVANFDIEVTSPDGFPEPSQAKHPIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSPYGNVEEWSIEIAAKLQEQGGDEVPSEIIDKIIYMPFDNEKELLME: 200
SecStr          :    GGGS EEEEEEEE  TTSS  TTT  S EEEEEEEETTTTEEEEEEE EETTEE     HHHHHS GGGT     HHHHTTEEEEEESSHHHHHHH:    
ExpBur          :bebeeeebbbbbbebbbbbeeeebebeebebbbbbbbbbbeeeeebbbbbbbebeeeebeebeeeebeeeeeeebbebeeebbeebeeeebeebeebbee:    

3lds_A_1     201:YLNFWQQKTPVILTGWNVESFAIPYVYNRIKNIFGESTAKRLSPHRKTRVKVIENMYGSREIITLFGISVLDYIDLYKKFSFTNQPSYSLDYISEFELNV: 300
SecStr          :HHHHHHHT  SEEESSSTTTTHHHHHHHHHHHHH HHHHGGGSTTS EEEEEEE SS EEEEEEETT EE  HHHHHHHHS    S  SHHHHHHHHT  :    
ExpBur          :bbebbeebbbbbbbbbebeebbbbbbbbbbeeeeeeeebeebbebeebeeeeeeeeeeeeebbebbbbbbbbbbebbeebbeeebbbbebebbbeebbee:    

3lds_A_1     301:GKLKYDGPISKLRESNHQRYISYNIIAVYRVLQIDAKRQFINLSLDMGYYAKIQIQSVFSPIKTWDAIIFNSLKEQNKVIPQGRSHPVQPYPGAFVKEPI: 400
SecStr          :     SS HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHT  GGGGG HHHHHHHHHHHHHHHTTEE                B    :    
ExpBur          :eeeeeeeeebebbeeebbbbbbbbbbbbbbbeebbebbebbebbbebbbebbbbbebbeeeeebbbbbbbbbbeeeeebbbbeeeeeeeeeeeeebeebe:    

3lds_A_1     401:PNRYKYVMSFDLTSLYPSIIRQVNISPETIAGTFKVAPLHDYINAVAERPSDVYSCSPNGMMYYKDRDGVVPTEITKVFNQRKEHKGYMLAAQRNGEIIK: 500
SecStr          :SEE SSEEEEEETTHHHHHHHHHT  TT EEEE     HHHHHTT S  S SSSEEETTTEEE SSS  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeebebbbbbebebbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeeeeeeebbeeebeebbeeebbbbebbbbeeeeebbbbebbeebbeebeeeeebbbbbbebbbebe:    
Contact         :          bbbbbb                                                                 b   b              

3lds_A_1     501:EALHNPNLSVDEPLDVDYRFDFSDEIKEKIKKLSAKSLNEMLFRAQRTEVAGMTAQINRKALINSLYGALGNVWFRYYDLRNATAITTFGQMALQWIERK: 600
SecStr          :HHTTS B          TTS   HHHHHHHTTSBHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT TTSTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeeeeeeeeeeeeeeebeeebeeeeeeebeebbbebbeebbeebeeeebebebbbbbbeebbeebbebbeebebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbeb:    
Contact         :                                                           b   b                                    

3lds_A_1     601:VNEYLNEVCGTEGEAFVLYGDTDSIYVSADKIIDKVGESKFRDTNHWVDFLDKFARERMEPAIDRGFREMCEYMNNKQHLMFMDREAIAGPPLGSKGIGG: 700
SecStr          :HHHHHHHHH  SS   EEE BTT EEEE HHHHHHH TTS SSHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHTT SS    EEEEEEE   TTS    E:    
ExpBur          :beeebbeebeeeeeebbbbbeebbbbbbbeebbeeeeeeebeeeeebbeebbebbeeebeebbeebbeebbebbbbeebbbebebbbbbbbeeeeebbbb:    
Contact         :                     bb                                                                             

3lds_A_1     701:FWTGKKRYALNVWDMEGTRYAEPKLKIMGLETQKSSTPKAVQKALKECIRRMLQEGEESLQEYFKEFEKEFRQLNYISIASVSSANNIAKYDVGGFPGPK: 800
SecStr          :EEEETTEEEEEEEEESS EEEEEEEEEESSTTT TTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTS HHHH EEEE   HHHHBSSSSB TT:    
ExpBur          :bbebeeebbbbbbbbbebebeeeebebeebebeebebbebbbebbeebbebbbbebeebbbebbeebeeebeeeebeebbebeebeebeebeeeeeebee:    

3lds_A_1     801:CPFHIRGILTYNRAIKGNIDAPQVVEGEKVYVLPLREGNPFGDKCIAWPSGTEITDLIKDDVLHWMDYTVLLEKTFIKPLEGFTSAAKLDYEKKASLFDM: 900
SecStr          :  HHHHHHHHHHHHH S S S    TTSEEEEEEB TT SSSSSEEEEESSS   HHHHHHHHHHB HHHHHHHHTHHHHHHHHHHHT  SS    GGGS:    
ExpBur          :beeebebbbbbeeebeeeeebeebeeeebbbbbbbeeebebebebbbbbbeeebbeebeeebeeebbbeebbeebbbebbeebbebbebeeeeeeeeeee:    

3lds_A_1     901:FDF-------------------------------------------------------------------------------------------------: 903
SecStr          :  -:    
ExpBur          :ee-:

Protein Model on 3lds_A_1_D_1 (TEMPLATE: 3lds )

Input Residue Numbers for Focused Sites