CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] |
DOWNLOAD: [sequence-replaced 3D model] [for PyMOL] [3D template] [Modeller script]
ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT: |
MOLECULES | contact sites | |||||
model | mark | query | asym_id oper (auth_asym_id) |
type | description | a(query A) |
1 | a | A(AMPN_HUMAN) | D 1 (D) | polymer(polypeptide(L)) [898 aa] | Aminopeptidase N :AMPN_PIG | |
2 | b | LA 1 (D) | non-polymer(ZN) | ZINC ION | 388H 392H 411E 477Y (identity: 100.0 %/79.5 %) |
ALIGNMENTS |
MODEL[1] Protein A "queryA" TEMPLATE:5lds_D_1 identity=79.5% |
queryA 67:QSKAWNRYRLPNTLKPDSYRVTLRPYLTPNDRGLYVFKGSSTVRFTCKEATDVIIIHSKKLNYTLSQGHRVVLRGVGGSQPPDIDKTELVEPTEYLVVHL: 166 :*** ******* ** **** ********** *** *** * *** * * ************** * ******* ** * ** ***** ********: 5lds_D_1 45:QSKPWNRYRLPTTLLPDSYNVTLRPYLTPNADGLYIFKGKSIVRFICQEPTDVIIIHSKKLNYTXXX-HMVVLRGVGDSQVPEIDRTELVELTEYLVVHL: 143 SecStr : SGGGSSS SSEEEEEEEEEEEEE S TTS EEEEEEEEEEEESS SEEEEE S EE ---- EEEE TT EEEEEEETTTTEEEEEE: ExpBur :eeeebeeeebeebbebebbebebbbebeeeeeeebbbebebebebebeeebebbbbbbbebebe----eebebeeeeebeebebeebeebeebbbbbbbb: queryA 167:KGSLVKDSQYEMDSEFEGELADDLAGFYRSEYMEGNVRKVVATTQMQAADARKSFPCFDEPAMKAEFNITLIHPKDLTALSNMLPKGPSTPLPEDPNWNV: 266 :**** *** *** ******************** ** ****** **************** ******** ******* *** **** ***** *: 5lds_D_1 144:KGSLQPGHMYEMESEFQGELADDLAGFYRSEYMEGNVKKVLATTQMQSTDARKSFPCFDEPAMKATFNITLIHPNNLTALSNMPPKGSSTPLAEDPNWSV: 243 SecStr :SS TTEEEEEEEEEEEE SSSSEEEEEEEEETTEEEEEEEEE TTTTGGGTS B STTS BEEEEEEEEETTSEEEESS BSS EEETTEEEEEE: ExpBur :eeebeeeeebebebebebebbeebbbbbbbebeeeeeebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbebebbbbbeeebebbbbbeeeeeeeebeeeeebbe: queryA 267:TEFHTTPKMSTYLLAFIVSEFDYVEKQASNGVLIRIWARPSAIAAGHGDYALNVTGPILNFFAGHYDTPYPLPKSDQIGLPDFNAGAMENWGLVTYRENS: 366 :*** *** ******* ***** * * *********** *** *** ************** ** * ********* ******************** : 5lds_D_1 244:TEFETTPVMSTYLLAYIVSEFQSVNETAQNGVLIRIWARPNAIAEGHGMYALNVTGPILNFFANHYNTSYPLPKSDQIALPDFNAGAMENWGLVTYRENA: 343 SecStr :EEB SB GGG EEEE EEEEEE TTS EEEEEE HHHHHTTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSEEEEEEESS SSSEE TTEEEEEGGG: ExpBur :bebeebbebbbbbbbbbbbebeeeeeebeeebebebbbbbebbeeebbebbbebbbebbbbbbebbebebebebbbbbbbbbbeeebbbbbbbbbbbbbb: queryA 367:LLFDPLSSSSSNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTIEWWNDLWLNEGFASYVEYLGADYAEPTWNLKDLMVLNDVYRVMAVDALASSHPLSTPASEINTPA: 466 :***** *** ************************ ********************* ********** * ***************** *** * ****: 5lds_D_1 344:LLFDPQSSSISNKERVVTVIAHELAHQWFGNLVTLAWWNDLWLNEGFASYVEYLGADHAEPTWNLKDLIVPGDVYRVMAVDALASSHPLTTPAEEVNTPA: 443 SecStr :T TTTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHBTTTEEESSGGGTHHHHHHHHHHHHHHHHHH GGG GGGGHHHHTHHHHHHHHTSTT SS GGG SHH: ExpBur :bbbbeeebbbebebebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeebeebebeebbbbebbbebbeebbbbbbbbbbbeeeebebbe: Contact : b b b queryA 467:QISELFDAISYSKGASVLRMLSSFLSEDVFKQGLASYLHTFAYQNTIYLNLWDHLQEAVNNR-SIQLPTTVRDIMNRWTLQMGFPVITVDTSTGTLSQEH: 565 :**** ** ********* **** ** ** ** ******* ****** ** ** *** ** ** ** *** ** *************** ** ** *: 5lds_D_1 444:QISEMFDSISYSKGASVIRMLSNFLTEDLFKEGLASYLHAFAYQNTTYLDLWEHLQKAVDAQTSIRLPDTVRAIMDRWTLQMGFPVITVDTKTGNISQKH: 543 SecStr :HHHHTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHTTEEE HHHHHHHHHHHHHT SSS SS HHHHHHHHHSS EEEEEETTTTEEEEEE: ExpBur :ebbbbbebbbbbbbbbbbbbbbebbebebbeebbbebbeebeeeebebeebbebbbebbeeeeeeeeeeebeebbbbbbebbbbbbbebebeebebebeb: Contact : b queryA 566:FLLDPDSNVTRPSEFNYVWIVPITSIRDGRQQQDYWLIDV-RAQNDLFSTSGNEWVLLNLNVTGYYRVNYDEENWRKIQTQLQRDHSAIPVINRAQIIND: 664 :**** ***** * * * ***** ** * * *** ** ****** * ***** ***** ***** *** ** *** * ******** * *: 5lds_D_1 544:FLLDSESNVTRSSAFDYLWIVPISSIKNGVMQDHYWLRDVSQAQNDLFKTASDDWVLLNVNVTGYFQVNYDEDNWRMIQHQLQTNLSVIPVINRAQVIYD: 643 SecStr : S SS S TTTT EEE EEETTEE EEE S SEEE GGG TT EEESGGG SS EEEE HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHHHHHH: ExpBur :bbbeeebeeeeebebebbbbbbbbbbeeeeebeebbbeeeeeeeeebbebeeeebbbbbbebbbbbbbbbbeebbeebeebbeeebeebeebbbbbbbbb: queryA 665:AFNLASAHKVPVTLALNNTLFLIEERQYMPWEAALSSLSYFKLMFDRSEVYGPMKNYLKKQVTPLFIHFRNNTNNWREIPENLMDQYSEVNAISTACSNG: 764 : **** ** ******* ***** * **** ********* ************* ** *** *** ** * ** * ********** **********: 5lds_D_1 644:SFNLATAHMVPVTLALDNTLFLNGEKEYMPWQAALSSLSYFSLMFDRSEVYGPMKKYLRKQVEPLFQHFETLTKNWTERPENLMDQYSEINAISTACSNG: 743 SecStr :HHHHHHTTSS HHHHHHTTGGGGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTS SSHHHHHHHHHHHHHHHHTT: ExpBur :bbebbbbeebebebbbebbebbeebeebbbbbbbeebbebbebbbbeeebeebbeebbeebbeebbeebeeebeebeebbeebbebbbbbbbbebbbebe: queryA 765:VPECEEMVSGLFKQWMENPNNNPIHPNLRSTVYCNAIAQGGEEEWDFAWEQFRNATLVNEADKLRAALACSKELWILNRYLSYTLNPDLIRKQDATSTII: 864 : * ** ** *** * *********** ********* ***** * * ********* ***** * * ***** ***************** : 5lds_D_1 744:LPQCENLAKTLFDQWMSDPENNPIHPNLRSTIYCNAIAQGGQDQWDFAWGQLQQAQLVNEADKLRSALACSNEVWLLNRYLGYTLNPDLIRKQDATSTIN: 843 SecStr : HHHHHHHHHHHHHHHTSTTS S GGGHHHHHHHHHHHS HHHHHHHHHHHHT S HHHHHHHHHHHTT S HHHHHHHHHHTT TTTS HHHHHHHHH: ExpBur :beebeebbeebbeebeeeeeeeebebbbbebbbebbbeeeeeebbebbbebbeeeebbbbbbbbbebbbbbeeeebbeebbeebeeeeebebbbbbebbb: queryA 865:SITNNVIGQGLVWDFVQSNWKKLFNDYGGGSFSFSNLIQAVTRRFSTEYELQQLEQFKKDNEETGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLQWFTE: 964 :** ***** * ************ ************** ****** * ********** * ******************************* ** *: 5lds_D_1 844:SIASNVIGQPLAWDFVQSNWKKLFQDYGGGSFSFSNLIQGVTRRFSSEFELQQLEQFKKNNMDVGFGSGTRALEQALEKTKANIKWVKENKEVVLNWFIE: 943 SecStr :HHHHSTTHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHTT SSHHHHHHHHHHTT SHHHHHHHHHHHHHTTTT GGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH: ExpBur :ebbebeebbebbbebbeeebeebeeebbeebebbeebbebbbebbbeeebbeebeebbeeeeeeebebbebbbebbbbebebbbebbeebeeebbebbee: queryA 965:NS: 966 : *: 5lds_D_1 944:HS: 945 SecStr :T : ExpBur :be: |