Protein Model on 6iia_E_1_H_1 (TEMPLATE: 6iia )

CurrentView:HTML5 Change to:[JAVA] DOWNLOAD:
[3D template]

ALL MOLECULES IN THE BIOLOGICAL UNIT:
[assembly_id:2]

Window size :
[small] [medium] [large]

[help]


MOLECULES contact sites
model mark query asym_id oper
(auth_asym_id)
type description a(query F)
1 a FE 1 (E) polymer(polypeptide(L)) [1030 aa] Multidrug resistance protein MexB :MEXB_PSEAE
2 b H 1 (E) non-polymer(AV0) Lauryl Maltose Neopentyl Glycol 46Q 48S 81E 89T 134K 136F 139V 176Q 177V 178F 179G 180S 273Q 274D 277I 327Y 610F 612V 615F 617F 620R 628F 630M
FOCUSED TEMPLATE
MODEL[1] TEMPLATE:6iia_E_1
6iia_E_1       1:MSKFFIDRPIFAWVIALVIMLAGGLSILSLPVNQYPAIAPPAIAVQVSYPGASAETVQDTVVQVIEQQMNGIDNLRYISSESNSDGSMTITVTFEQGTDP: 100
SecStr          : HHHHTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  B S  S S  EEEEEEE TT  HHHHHHHTHHHHHHH  S TTEEEEEEEEETTSEEEEEEEE TT  H:    
ExpBur          :ebeebbeeeeebeeebeebeeebeebeeebebbbbbebbbbbbbbebebbebebeebbeebbeebbeebeebeeebbbebebbebbbbbbebbbeeebee:    
Contact         :                                             b b                                b       b           

6iia_E_1     101:DIAQVQVQNKLQLATPLLPQEVQRQGIRVTKAVKNFLMVVGVVSTDGSMTKEDLSNYIVSNIQDPLSRTKGVGDFQVFGSQYSMRIWLDPAKLNSYQLTP: 200
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHGGGS HHHHHH  EEEE     SEEEEEEESSS S HHHHHHHHHHHTHHHHHTSTTEEEEEESS S EEEEEE HHHHHTTT  H:    
ExpBur          :eebbeebeeebeebeeebbeebeebebebeebeeeebbbbbbbbeeeebebbebbbbbbeebeeebeebeebeeeebeeeebbbbbbbbbeebeeeebbb:    
Contact         :                                 b b  b                                    bbbbb                    

6iia_E_1     201:GDVSSAIQAQNVQISSGQLGGLPAVKGQQLNATIIGKTRLQTAEQFENILLKVNPDGSQVRLKDVADVGLGGQDYSINAQFNGSPASGIAIKLATGANAL: 300
SecStr          :HHHHHHHHHHS      EES SS  S     EE        SHHHHHHSEEEE TTS EEEHHHHEEEEEE S  S EEEETTEEEEEEEEEE TT BHH:    
ExpBur          :eebbebbeeebeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeebeeeeebeebebeebeeeeebebeebbebeebbbeeeeebbbeeeebbbbbbbbeeebebe:    
Contact         :                                                                        bb  b                       

6iia_E_1     301:DTAKAIRQTIANLEPFMPQGMKVVYPYDTTPVVSASIHEVVKTLGEAILLVFLVMYLFLQNFRATLIPTIAVPVVLLGTFGVLAAFGFSINTLTMFGMVL: 400
SecStr          :HHHHHHHHHHHTTGGGS TTEEEEEEEESHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT  BSHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebbeebeebbeeeeeebeeebebeebbbbbebbebbeebbeebbeebeebbeebbeebbbeeebbebbeebbebbbebbbbebeeeebbbbbbbbbbbbb:    
Contact         :                          b                                                                         

6iia_E_1     401:AIGLLVDDAIVVVENVERVMAEEGLSPREAARKSMGQIQGALVGIAMVLSAVFLPMAFFGGSTGVIYRQFSITIVSAMALSVIVALILTPALCATMLKPI: 500
SecStr          :HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSGGGG  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHH    :    
ExpBur          :bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbeeeeebeebbeebbebbeebbebbbebbebbbebbbebebbbbbbbebbbbbbbbbbebbbebbbbbbbbbbbebbeee:    

6iia_E_1     501:EKGDHGEHKGGFFGWFNRMFLSTTHGYERGVASILKHRAPYLLIYVVIVAGMIWMFTRIPTAFLPDEDQGVLFAQVQTPPGSSAERTQVVVDSMREYLLE: 600
SecStr          : TT  STT  SHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHS B SS     SEEEEEEE  TT  HHHHHHHHHHHHHHHHH:    
ExpBur          :eeeeebeeeeeebbebbeebeeebeebbeebeebbeeeeeeeeebeebeeebeebeeebeeebbbebbbebbbbbbebeeebeeeebbebbeebbebbee:    

6iia_E_1     601:KESSSVSSVFTVTGFNFAGRGQSSGMAFIMLKPWEERPGGENSVFELAKRAQMHFFSFKDAMVFAFAPPSVLELGNATGFDLFLQDQAGVGHEVLLQARN: 700
SecStr          :HTTTTEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEE  STTS SGGG HHHHHHHTHHHHHS TTSEE  B   SSGGG S SS EEEEEESSS HHHHHHHHHH:    
ExpBur          :ebeebbebbbbbbbebebbebebbbbbbbbbeebeebeeeebbbeebbeebeeebeeeeebebebeebebbebbeeeebbbbbbbbeeeeeeeebbebbe:    
Contact         :         b b  b b  b       b b                                                                      

6iia_E_1     701:KFLMLAAQNPALQRVRPNGMSDEPQYKLEIDDEKASALGVSLADINSTVSIAWGSSYVNDFIDRGRVKRVYLQGRPDARMNPDDLSKWYVRNDKGEMVPF: 800
SecStr          :HHHHHHHH SS     B S   EEE      HHHHHHHT  GGGHHHHHHHHHS EEEEEEESSSSEEEEEEEE TTSSSSGGGGGS B   SSS   BG:    
ExpBur          :ebbeebeeeebbeebeeebbebbeeeeeeeeeeebeeebbeeeebeebeebbebbbbbbebbbeeeebebbbbbeeebeeeeebbeebebebeeeebbeb:    

6iia_E_1     801:NAFATGKWEYGSPKLERYNGVPAMEILGEPAPGLSSGDAMAAVEEIVKQLPKGVGYSWTGLSYEERLSGSQAPALYALSLLVVFLCLAALYESWSIPFSV: 900
SecStr          :GGS     EEE SEEEEESSSBEEEEE    TT  HHHHHHHHHHHTTTS TTEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHT SSTHHHH:    
ExpBur          :eebbeeeeeebbbbbbbbeebebbbbbbbbbeeeebeebbebbeebbeebeeebbeebbebbebeeebeeeeeebeeebeeebbebbbeebeeeebbebb:    

6iia_E_1     901:MLVVPLGVIGALLATSMRGLSNDVFFQVGLLTTIGLSAKNAILIVEFAKELHEQGKGIVEAAIEACRMRLRPIVMTSLAFILGVVPLAISTGAGSGSQHA:1000
SecStr          :HTTHHHHHHHHHHHHHHTT  BSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSTTTS  STTHHHHTT:    
ExpBur          :bebebbbbbbbbeebeeeeebbbbbbebbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbebeeeeeeeeebbbbbbebbbebbebbbebbeebbeebbebeebbbbbbbb:    

6iia_E_1    1001:IGTGVIGGMVTATVLAIFWVPLFYVAVSTL----------------------------------------------------------------------:1030
SecStr          :TTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-:    
ExpBur          :bbbbbebbbebbbebbbebbbbbbbbeee-:    


Input Residue Numbers for Focused Sites

ex) 2,15,123